MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 1119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	TTATC	2	10	502	511	20 %	60 %	0 %	20 %	14520219
2	NC_000868	CTTCC	2	10	3361	3370	0 %	40 %	0 %	60 %	14520224
3	NC_000868	ACCTC	2	10	5931	5940	20 %	20 %	0 %	60 %	14520226
4	NC_000868	GGAAA	2	10	6495	6504	60 %	0 %	40 %	0 %	14520227
5	NC_000868	GAAAG	2	10	10671	10680	60 %	0 %	40 %	0 %	14520231
6	NC_000868	AATTT	2	10	13997	14006	40 %	60 %	0 %	0 %	14520234
7	NC_000868	TCCTC	2	10	15258	15267	0 %	40 %	0 %	60 %	14520235
8	NC_000868	CTCCA	2	10	18552	18561	20 %	20 %	0 %	60 %	14520239
9	NC_000868	CAATC	2	10	20184	20193	40 %	20 %	0 %	40 %	14520240
10	NC_000868	GCTAT	2	10	20437	20446	20 %	40 %	20 %	20 %	14520240
11	NC_000868	CAGTA	2	10	20450	20459	40 %	20 %	20 %	20 %	14520240
12	NC_000868	AGTTT	2	10	22423	22432	20 %	60 %	20 %	0 %	14520242
13	NC_000868	AATGG	2	10	22449	22458	40 %	20 %	40 %	0 %	14520242
14	NC_000868	AGGAA	2	10	27864	27873	60 %	0 %	40 %	0 %	14520248
15	NC_000868	GTTCG	2	10	28944	28953	0 %	40 %	40 %	20 %	14520249
16	NC_000868	CATCC	2	10	29831	29840	20 %	20 %	0 %	60 %	14520250
17	NC_000868	CGTAG	2	10	30252	30261	20 %	20 %	40 %	20 %	14520250
18	NC_000868	TCCAA	2	10	30547	30556	40 %	20 %	0 %	40 %	14520250
19	NC_000868	TTGCT	2	10	33068	33077	0 %	60 %	20 %	20 %	14520252
20	NC_000868	ACTAA	2	10	33962	33971	60 %	20 %	0 %	20 %	14520253
21	NC_000868	CTTTT	2	10	37510	37519	0 %	80 %	0 %	20 %	14520258
22	NC_000868	GCATT	2	10	37897	37906	20 %	40 %	20 %	20 %	14520259
23	NC_000868	AAGGA	2	10	42251	42260	60 %	0 %	40 %	0 %	14520265
24	NC_000868	CCAAC	2	10	43429	43438	40 %	0 %	0 %	60 %	14520266
25	NC_000868	TTCCT	2	10	43675	43684	0 %	60 %	0 %	40 %	14520266
26	NC_000868	TCCTT	2	10	43728	43737	0 %	60 %	0 %	40 %	14520267
27	NC_000868	TTTCC	2	10	45607	45616	0 %	60 %	0 %	40 %	14520270
28	NC_000868	AAGTT	2	10	52799	52808	40 %	40 %	20 %	0 %	14520277
29	NC_000868	CTTCC	2	10	53186	53195	0 %	40 %	0 %	60 %	14520277
30	NC_000868	GCTCT	2	10	54334	54343	0 %	40 %	20 %	40 %	14520278
31	NC_000868	CTTAT	2	10	56724	56733	20 %	60 %	0 %	20 %	14520280
32	NC_000868	GAAAG	2	10	60605	60614	60 %	0 %	40 %	0 %	14520284
33	NC_000868	TGCAA	2	10	62791	62800	40 %	20 %	20 %	20 %	14520287
34	NC_000868	AGATA	2	10	62875	62884	60 %	20 %	20 %	0 %	14520287
35	NC_000868	CTTCG	2	10	64284	64293	0 %	40 %	20 %	40 %	14520290
36	NC_000868	GAGAA	2	10	67590	67599	60 %	0 %	40 %	0 %	14520293
37	NC_000868	CCATC	2	10	69035	69044	20 %	20 %	0 %	60 %	14520294
38	NC_000868	TCTAT	2	10	69629	69638	20 %	60 %	0 %	20 %	14520295
39	NC_000868	AGCAT	2	10	71549	71558	40 %	20 %	20 %	20 %	14520298
40	NC_000868	AGGTG	2	10	71995	72004	20 %	20 %	60 %	0 %	14520298
41	NC_000868	GGAAG	2	10	80843	80852	40 %	0 %	60 %	0 %	33356667
42	NC_000868	TCTCA	2	10	81996	82005	20 %	40 %	0 %	40 %	14520309
43	NC_000868	GTATC	2	10	83247	83256	20 %	40 %	20 %	20 %	14520312
44	NC_000868	TAGCA	2	10	84093	84102	40 %	20 %	20 %	20 %	14520313
45	NC_000868	TCATT	2	10	85665	85674	20 %	60 %	0 %	20 %	14520314
46	NC_000868	AGGGA	2	10	87015	87024	40 %	0 %	60 %	0 %	14520315
47	NC_000868	GGTAG	2	10	87313	87322	20 %	20 %	60 %	0 %	14520315
48	NC_000868	CTTCC	2	10	89047	89056	0 %	40 %	0 %	60 %	14520316
49	NC_000868	AATTA	2	10	91937	91946	60 %	40 %	0 %	0 %	14520319
50	NC_000868	CCGTT	2	10	94840	94849	0 %	40 %	20 %	40 %	33356668
51	NC_000868	TCCCC	2	10	95462	95471	0 %	20 %	0 %	80 %	33356668
52	NC_000868	GAAGG	2	10	98869	98878	40 %	0 %	60 %	0 %	14520326
53	NC_000868	AGAGA	2	10	99889	99898	60 %	0 %	40 %	0 %	14520327
54	NC_000868	AGAGG	2	10	102304	102313	40 %	0 %	60 %	0 %	14520327
55	NC_000868	TAAGA	2	10	103471	103480	60 %	20 %	20 %	0 %	14520328
56	NC_000868	TAGGT	2	10	103483	103492	20 %	40 %	40 %	0 %	14520328
57	NC_000868	AAGCC	2	10	104420	104429	40 %	0 %	20 %	40 %	14520328
58	NC_000868	CACAA	2	10	104768	104777	60 %	0 %	0 %	40 %	14520328
59	NC_000868	TTCAA	2	10	105965	105974	40 %	40 %	0 %	20 %	14520328
60	NC_000868	CAGAG	2	10	107862	107871	40 %	0 %	40 %	20 %	14520329
61	NC_000868	AGGGA	2	10	107935	107944	40 %	0 %	60 %	0 %	14520329
62	NC_000868	AGAGG	2	10	108426	108435	40 %	0 %	60 %	0 %	14520329
63	NC_000868	GTTCA	2	10	110164	110173	20 %	40 %	20 %	20 %	14520331
64	NC_000868	GATAA	2	10	111314	111323	60 %	20 %	20 %	0 %	14520332
65	NC_000868	GGAAA	2	10	111544	111553	60 %	0 %	40 %	0 %	14520332
66	NC_000868	AGAGG	2	10	112103	112112	40 %	0 %	60 %	0 %	14520333
67	NC_000868	TATAA	2	10	112776	112785	60 %	40 %	0 %	0 %	14520333
68	NC_000868	TTCTC	2	10	113713	113722	0 %	60 %	0 %	40 %	14520336
69	NC_000868	TTGCA	2	10	114276	114285	20 %	40 %	20 %	20 %	14520336
70	NC_000868	ACTTC	2	10	120984	120993	20 %	40 %	0 %	40 %	14520339
71	NC_000868	TCCTC	2	10	123541	123550	0 %	40 %	0 %	60 %	14520341
72	NC_000868	TCCTC	2	10	125113	125122	0 %	40 %	0 %	60 %	14520343
73	NC_000868	AGATT	2	10	125828	125837	40 %	40 %	20 %	0 %	14520344
74	NC_000868	TGCCC	2	10	126102	126111	0 %	20 %	20 %	60 %	14520344
75	NC_000868	AAACC	2	10	126521	126530	60 %	0 %	0 %	40 %	14520345
76	NC_000868	GCTCA	2	10	128871	128880	20 %	20 %	20 %	40 %	14520348
77	NC_000868	TGAAG	2	10	129585	129594	40 %	20 %	40 %	0 %	14520349
78	NC_000868	GGAAG	2	10	130970	130979	40 %	0 %	60 %	0 %	14520350
79	NC_000868	AGAAT	2	10	132397	132406	60 %	20 %	20 %	0 %	14520351
80	NC_000868	CGTAT	2	10	132953	132962	20 %	40 %	20 %	20 %	14520351
81	NC_000868	CTTAT	2	10	134160	134169	20 %	60 %	0 %	20 %	14520352
82	NC_000868	GAGTT	2	10	134439	134448	20 %	40 %	40 %	0 %	14520352
83	NC_000868	GCATT	2	10	135545	135554	20 %	40 %	20 %	20 %	14520353
84	NC_000868	GAAAG	2	10	138089	138098	60 %	0 %	40 %	0 %	14520356
85	NC_000868	TAAGA	2	10	143680	143689	60 %	20 %	20 %	0 %	14520360
86	NC_000868	AGAGG	2	10	143881	143890	40 %	0 %	60 %	0 %	14520360
87	NC_000868	GGGAG	2	10	144991	145000	20 %	0 %	80 %	0 %	14520361
88	NC_000868	AAGGA	2	10	145968	145977	60 %	0 %	40 %	0 %	14520363
89	NC_000868	AAGCC	2	10	146386	146395	40 %	0 %	20 %	40 %	14520363
90	NC_000868	GATAG	2	10	147513	147522	40 %	20 %	40 %	0 %	14520364
91	NC_000868	CCCTC	2	10	152539	152548	0 %	20 %	0 %	80 %	14520367
92	NC_000868	GCTAA	2	10	153235	153244	40 %	20 %	20 %	20 %	14520368
93	NC_000868	CCCTC	2	10	156647	156656	0 %	20 %	0 %	80 %	14520371
94	NC_000868	AGGTC	2	10	158701	158710	20 %	20 %	40 %	20 %	14520374
95	NC_000868	TTTTC	2	10	161812	161821	0 %	80 %	0 %	20 %	14520377
96	NC_000868	TTTTC	2	10	162617	162626	0 %	80 %	0 %	20 %	14520377
97	NC_000868	TAGCT	2	10	164183	164192	20 %	40 %	20 %	20 %	14520379
98	NC_000868	ATCCC	2	10	164346	164355	20 %	20 %	0 %	60 %	14520379
99	NC_000868	AGGGA	2	10	164633	164642	40 %	0 %	60 %	0 %	14520380
100	NC_000868	CCTCT	2	10	167551	167560	0 %	40 %	0 %	60 %	14520384
101	NC_000868	AGAGG	2	10	170059	170068	40 %	0 %	60 %	0 %	14520387
102	NC_000868	ATAGT	2	10	170966	170975	40 %	40 %	20 %	0 %	14520388
103	NC_000868	CCCTT	2	10	172698	172707	0 %	40 %	0 %	60 %	14520390
104	NC_000868	TGGAG	2	10	173887	173896	20 %	20 %	60 %	0 %	14520391
105	NC_000868	CACCG	2	10	174527	174536	20 %	0 %	20 %	60 %	14520393
106	NC_000868	GAATA	2	10	175255	175264	60 %	20 %	20 %	0 %	14520394
107	NC_000868	AAAGT	2	10	175456	175465	60 %	20 %	20 %	0 %	14520394
108	NC_000868	GATTG	2	10	177328	177337	20 %	40 %	40 %	0 %	14520395
109	NC_000868	AGGGC	2	10	177782	177791	20 %	0 %	60 %	20 %	14520395
110	NC_000868	ATGAA	2	10	178304	178313	60 %	20 %	20 %	0 %	14520396
111	NC_000868	TTGGA	2	10	178469	178478	20 %	40 %	40 %	0 %	14520396
112	NC_000868	AAGCT	2	10	179749	179758	40 %	20 %	20 %	20 %	14520397
113	NC_000868	CTGGA	2	10	182238	182247	20 %	20 %	40 %	20 %	14520398
114	NC_000868	AGAGG	2	10	182582	182591	40 %	0 %	60 %	0 %	14520398
115	NC_000868	GAGCT	2	10	185098	185107	20 %	20 %	40 %	20 %	14520399
116	NC_000868	ATATT	2	10	185554	185563	40 %	60 %	0 %	0 %	14520399
117	NC_000868	TCGAG	2	10	186220	186229	20 %	20 %	40 %	20 %	14520400
118	NC_000868	TCCCC	2	10	186266	186275	0 %	20 %	0 %	80 %	14520400
119	NC_000868	CTTAT	2	10	186814	186823	20 %	60 %	0 %	20 %	33356669
120	NC_000868	TTAGC	2	10	188120	188129	20 %	40 %	20 %	20 %	14520402
121	NC_000868	GAAAA	2	10	188827	188836	80 %	0 %	20 %	0 %	14520402
122	NC_000868	ATAGA	2	10	189033	189042	60 %	20 %	20 %	0 %	14520403
123	NC_000868	TCTCC	2	10	190202	190211	0 %	40 %	0 %	60 %	14520405
124	NC_000868	CTAGC	2	10	190633	190642	20 %	20 %	20 %	40 %	14520405
125	NC_000868	GCTCT	2	10	191920	191929	0 %	40 %	20 %	40 %	14520406
126	NC_000868	CCAAA	2	10	193878	193887	60 %	0 %	0 %	40 %	14520408
127	NC_000868	AAAGG	2	10	194232	194241	60 %	0 %	40 %	0 %	14520408
128	NC_000868	TTAGC	2	10	194625	194634	20 %	40 %	20 %	20 %	14520409
129	NC_000868	AGCAT	2	10	196292	196301	40 %	20 %	20 %	20 %	14520410
130	NC_000868	AAAAT	2	10	197527	197536	80 %	20 %	0 %	0 %	14520411
131	NC_000868	TCCTT	2	10	198053	198062	0 %	60 %	0 %	40 %	14520411
132	NC_000868	CCCTT	2	10	211264	211273	0 %	40 %	0 %	60 %	14520420
133	NC_000868	GATGT	2	10	211530	211539	20 %	40 %	40 %	0 %	14520421
134	NC_000868	GGAAA	2	10	212784	212793	60 %	0 %	40 %	0 %	14520422
135	NC_000868	AGTTG	2	10	214229	214238	20 %	40 %	40 %	0 %	14520423
136	NC_000868	TAGCT	2	10	214548	214557	20 %	40 %	20 %	20 %	14520424
137	NC_000868	TCCAA	2	10	214963	214972	40 %	20 %	0 %	40 %	14520424
138	NC_000868	CCTCT	2	10	215044	215053	0 %	40 %	0 %	60 %	14520424
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140	NC_000868	AGATA	2	10	216603	216612	60 %	20 %	20 %	0 %	14520426
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154	NC_000868	CTATC	2	10	235649	235658	20 %	40 %	0 %	40 %	14520444
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157	NC_000868	GAAGA	2	10	239024	239033	60 %	0 %	40 %	0 %	14520447
158	NC_000868	AGGGG	2	10	239680	239689	20 %	0 %	80 %	0 %	14520447
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251	NC_000868	AATGG	2	10	377425	377434	40 %	20 %	40 %	0 %	14520603
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254	NC_000868	TTCTC	2	10	385474	385483	0 %	60 %	0 %	40 %	14520611
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263	NC_000868	ATGGG	2	10	398115	398124	20 %	20 %	60 %	0 %	14520624
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265	NC_000868	GGTGA	2	10	400551	400560	20 %	20 %	60 %	0 %	14520628
266	NC_000868	GCTTG	2	10	403905	403914	0 %	40 %	40 %	20 %	14520634
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