MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 3854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	TTAA	2	8	76	83	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000868	GCTT	2	8	648	655	0 %	50 %	25 %	25 %	14520220
3	NC_000868	AATA	2	8	946	953	75 %	25 %	0 %	0 %	14520220
4	NC_000868	CCCA	2	8	1081	1088	25 %	0 %	0 %	75 %	14520220
5	NC_000868	CCCT	2	8	2458	2465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_000868	CAAC	2	8	2632	2639	50 %	0 %	0 %	50 %	14520223
7	NC_000868	CTTT	2	8	2653	2660	0 %	75 %	0 %	25 %	14520223
8	NC_000868	AGGG	2	8	2807	2814	25 %	0 %	75 %	0 %	14520223
9	NC_000868	TGCT	2	8	3859	3866	0 %	50 %	25 %	25 %	14520224
10	NC_000868	TCGT	2	8	3958	3965	0 %	50 %	25 %	25 %	14520224
11	NC_000868	CCAA	2	8	4118	4125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000868	CTTT	2	8	4517	4524	0 %	75 %	0 %	25 %	14520225
13	NC_000868	TATT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000868	CTAT	2	8	5997	6004	25 %	50 %	0 %	25 %	14520226
15	NC_000868	CTAT	2	8	6661	6668	25 %	50 %	0 %	25 %	14520227
16	NC_000868	GAGT	2	8	7064	7071	25 %	25 %	50 %	0 %	14520228
17	NC_000868	TATC	2	8	7443	7450	25 %	50 %	0 %	25 %	14520228
18	NC_000868	CTCG	2	8	7783	7790	0 %	25 %	25 %	50 %	14520228
19	NC_000868	ACCC	2	8	8210	8217	25 %	0 %	0 %	75 %	14520229
20	NC_000868	CTGG	2	8	8805	8812	0 %	25 %	50 %	25 %	14520230
21	NC_000868	AATG	2	8	10638	10645	50 %	25 %	25 %	0 %	14520231
22	NC_000868	TCCT	2	8	10855	10862	0 %	50 %	0 %	50 %	14520232
23	NC_000868	CTCC	2	8	10970	10977	0 %	25 %	0 %	75 %	14520232
24	NC_000868	TTGC	2	8	11173	11180	0 %	50 %	25 %	25 %	14520232
25	NC_000868	CCTT	2	8	11335	11342	0 %	50 %	0 %	50 %	14520232
26	NC_000868	TAAC	2	8	11501	11508	50 %	25 %	0 %	25 %	14520232
27	NC_000868	AGGT	2	8	11542	11549	25 %	25 %	50 %	0 %	14520232
28	NC_000868	CCTA	2	8	11553	11560	25 %	25 %	0 %	50 %	14520232
29	NC_000868	CCCT	2	8	11892	11899	0 %	25 %	0 %	75 %	14520232
30	NC_000868	CCAC	2	8	12864	12871	25 %	0 %	0 %	75 %	14520233
31	NC_000868	ACGT	2	8	12942	12949	25 %	25 %	25 %	25 %	14520233
32	NC_000868	TTTC	2	8	13102	13109	0 %	75 %	0 %	25 %	14520233
33	NC_000868	CCCA	2	8	13623	13630	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_000868	TAAA	2	8	13693	13700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000868	AGAT	2	8	13917	13924	50 %	25 %	25 %	0 %	14520234
36	NC_000868	CTTC	2	8	14721	14728	0 %	50 %	0 %	50 %	14520235
37	NC_000868	GGCT	2	8	14857	14864	0 %	25 %	50 %	25 %	14520235
38	NC_000868	TGGT	2	8	14889	14896	0 %	50 %	50 %	0 %	14520235
39	NC_000868	CCTT	2	8	15698	15705	0 %	50 %	0 %	50 %	14520235
40	NC_000868	TCGT	2	8	16127	16134	0 %	50 %	25 %	25 %	14520235
41	NC_000868	ATTG	2	8	18003	18010	25 %	50 %	25 %	0 %	14520238
42	NC_000868	TAGG	2	8	18293	18300	25 %	25 %	50 %	0 %	14520239
43	NC_000868	GGAC	2	8	18517	18524	25 %	0 %	50 %	25 %	14520239
44	NC_000868	CCTT	2	8	18572	18579	0 %	50 %	0 %	50 %	14520239
45	NC_000868	CTCC	2	8	18594	18601	0 %	25 %	0 %	75 %	14520239
46	NC_000868	TCCA	2	8	18815	18822	25 %	25 %	0 %	50 %	14520239
47	NC_000868	TCCC	2	8	20022	20029	0 %	25 %	0 %	75 %	14520240
48	NC_000868	TCCT	2	8	20263	20270	0 %	50 %	0 %	50 %	14520240
49	NC_000868	TATG	2	8	20486	20493	25 %	50 %	25 %	0 %	14520240
50	NC_000868	CTTC	2	8	20963	20970	0 %	50 %	0 %	50 %	14520241
51	NC_000868	AGCT	2	8	21108	21115	25 %	25 %	25 %	25 %	14520241
52	NC_000868	TATC	2	8	21656	21663	25 %	50 %	0 %	25 %	14520241
53	NC_000868	TTAT	2	8	23303	23310	25 %	75 %	0 %	0 %	14520243
54	NC_000868	TAAA	2	8	23578	23585	75 %	25 %	0 %	0 %	14520243
55	NC_000868	CTTT	2	8	24423	24430	0 %	75 %	0 %	25 %	14520244
56	NC_000868	TCCC	2	8	26460	26467	0 %	25 %	0 %	75 %	14521984
57	NC_000868	AGTG	2	8	26558	26565	25 %	25 %	50 %	0 %	14521984
58	NC_000868	CTGG	2	8	26788	26795	0 %	25 %	50 %	25 %	161723322
59	NC_000868	ATAG	2	8	26929	26936	50 %	25 %	25 %	0 %	161723322
60	NC_000868	GCTA	2	8	27030	27037	25 %	25 %	25 %	25 %	161723322
61	NC_000868	TTGA	2	8	27577	27584	25 %	50 %	25 %	0 %	14520248
62	NC_000868	ATTT	2	8	27965	27972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000868	TAAA	2	8	28074	28081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000868	CTAT	2	8	28164	28171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000868	GAAC	2	8	30104	30111	50 %	0 %	25 %	25 %	14520250
66	NC_000868	AACT	2	8	30171	30178	50 %	25 %	0 %	25 %	14520250
67	NC_000868	CCCT	2	8	31238	31245	0 %	25 %	0 %	75 %	14520250
68	NC_000868	CTTA	2	8	31335	31342	25 %	50 %	0 %	25 %	14520250
69	NC_000868	TCCC	2	8	31832	31839	0 %	25 %	0 %	75 %	14520251
70	NC_000868	TATC	2	8	32251	32258	25 %	50 %	0 %	25 %	14520251
71	NC_000868	ATCC	2	8	32970	32977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000868	GCCT	2	8	33137	33144	0 %	25 %	25 %	50 %	14520252
73	NC_000868	GTAG	2	8	33163	33170	25 %	25 %	50 %	0 %	14520252
74	NC_000868	CATC	2	8	33495	33502	25 %	25 %	0 %	50 %	14520253
75	NC_000868	GCTC	2	8	33756	33763	0 %	25 %	25 %	50 %	14520253
76	NC_000868	ATGC	2	8	34056	34063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000868	GCCA	2	8	34870	34877	25 %	0 %	25 %	50 %	14520255
78	NC_000868	AACG	2	8	35007	35014	50 %	0 %	25 %	25 %	14520255
79	NC_000868	TCCT	2	8	35476	35483	0 %	50 %	0 %	50 %	14520255
80	NC_000868	TTAG	2	8	35701	35708	25 %	50 %	25 %	0 %	14520255
81	NC_000868	CTTC	2	8	35945	35952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_000868	AGTT	2	8	35958	35965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000868	TCCT	2	8	36403	36410	0 %	50 %	0 %	50 %	33356661
84	NC_000868	CTTC	2	8	36680	36687	0 %	50 %	0 %	50 %	14520257
85	NC_000868	CCTT	2	8	37382	37389	0 %	50 %	0 %	50 %	14520258
86	NC_000868	GCCA	2	8	37540	37547	25 %	0 %	25 %	50 %	14520258
87	NC_000868	AATA	2	8	38791	38798	75 %	25 %	0 %	0 %	14520260
88	NC_000868	TCAC	2	8	40150	40157	25 %	25 %	0 %	50 %	14520262
89	NC_000868	GGGA	2	8	41397	41404	25 %	0 %	75 %	0 %	14520264
90	NC_000868	GAAG	2	8	41763	41770	50 %	0 %	50 %	0 %	14520265
91	NC_000868	TTAG	2	8	42359	42366	25 %	50 %	25 %	0 %	14520265
92	NC_000868	TCCT	2	8	42526	42533	0 %	50 %	0 %	50 %	14520266
93	NC_000868	AGTA	2	8	43026	43033	50 %	25 %	25 %	0 %	14520266
94	NC_000868	GCTG	2	8	43524	43531	0 %	25 %	50 %	25 %	14520266
95	NC_000868	GAAC	2	8	43908	43915	50 %	0 %	25 %	25 %	14520267
96	NC_000868	CGGT	2	8	43932	43939	0 %	25 %	50 %	25 %	14520267
97	NC_000868	GAGG	2	8	44039	44046	25 %	0 %	75 %	0 %	14520267
98	NC_000868	TTCC	2	8	44236	44243	0 %	50 %	0 %	50 %	14520267
99	NC_000868	TCCT	2	8	44381	44388	0 %	50 %	0 %	50 %	14520267
100	NC_000868	CCTG	2	8	45306	45313	0 %	25 %	25 %	50 %	14520269
101	NC_000868	CTTC	2	8	45465	45472	0 %	50 %	0 %	50 %	14520269
102	NC_000868	TTTA	2	8	45969	45976	25 %	75 %	0 %	0 %	14520270
103	NC_000868	AGGA	2	8	46074	46081	50 %	0 %	50 %	0 %	14520270
104	NC_000868	TTCC	2	8	46981	46988	0 %	50 %	0 %	50 %	14520271
105	NC_000868	AATC	2	8	47686	47693	50 %	25 %	0 %	25 %	14520271
106	NC_000868	TTCC	2	8	48325	48332	0 %	50 %	0 %	50 %	14520271
107	NC_000868	CCCT	2	8	48531	48538	0 %	25 %	0 %	75 %	14520271
108	NC_000868	TTCT	2	8	49088	49095	0 %	75 %	0 %	25 %	14520272
109	NC_000868	AGCC	2	8	49259	49266	25 %	0 %	25 %	50 %	14520273
110	NC_000868	TAAA	2	8	49558	49565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000868	CTTC	2	8	49606	49613	0 %	50 %	0 %	50 %	14520274
112	NC_000868	TTGG	2	8	50403	50410	0 %	50 %	50 %	0 %	14520275
113	NC_000868	CATA	2	8	50500	50507	50 %	25 %	0 %	25 %	14520275
114	NC_000868	CTAA	2	8	50517	50524	50 %	25 %	0 %	25 %	14520275
115	NC_000868	GAAG	2	8	50802	50809	50 %	0 %	50 %	0 %	14520275
116	NC_000868	GAAG	2	8	51266	51273	50 %	0 %	50 %	0 %	14520275
117	NC_000868	CCTT	2	8	51861	51868	0 %	50 %	0 %	50 %	14520276
118	NC_000868	TATC	2	8	52662	52669	25 %	50 %	0 %	25 %	14520276
119	NC_000868	ACCA	2	8	53923	53930	50 %	0 %	0 %	50 %	14520278
120	NC_000868	TCCT	2	8	53987	53994	0 %	50 %	0 %	50 %	14520278
121	NC_000868	TCCA	2	8	54056	54063	25 %	25 %	0 %	50 %	14520278
122	NC_000868	CTCA	2	8	54112	54119	25 %	25 %	0 %	50 %	14520278
123	NC_000868	ACCT	2	8	55312	55319	25 %	25 %	0 %	50 %	14520279
124	NC_000868	CCTC	2	8	55491	55498	0 %	25 %	0 %	75 %	14520279
125	NC_000868	TACC	2	8	56890	56897	25 %	25 %	0 %	50 %	14520280
126	NC_000868	GAAT	2	8	57385	57392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000868	AACG	2	8	57820	57827	50 %	0 %	25 %	25 %	14520281
128	NC_000868	TTCC	2	8	57890	57897	0 %	50 %	0 %	50 %	14520281
129	NC_000868	GCTC	2	8	58113	58120	0 %	25 %	25 %	50 %	14520281
130	NC_000868	TAAA	2	8	58715	58722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000868	GTGA	2	8	59037	59044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000868	AGCA	2	8	59141	59148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_000868	GGCT	2	8	59386	59393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_000868	CAAG	2	8	60112	60119	50 %	0 %	25 %	25 %	14520284
135	NC_000868	GAAC	2	8	60373	60380	50 %	0 %	25 %	25 %	14520284
136	NC_000868	AAGA	2	8	60509	60516	75 %	0 %	25 %	0 %	14520284
137	NC_000868	GGGA	2	8	60530	60537	25 %	0 %	75 %	0 %	14520284
138	NC_000868	GATA	2	8	61309	61316	50 %	25 %	25 %	0 %	14520284
139	NC_000868	CTTC	2	8	62829	62836	0 %	50 %	0 %	50 %	14520287
140	NC_000868	ATTC	2	8	62967	62974	25 %	50 %	0 %	25 %	14520288
141	NC_000868	AGAT	2	8	63639	63646	50 %	25 %	25 %	0 %	14520289
142	NC_000868	AAGA	2	8	63727	63734	75 %	0 %	25 %	0 %	14520289
143	NC_000868	GAAA	2	8	64048	64055	75 %	0 %	25 %	0 %	14520289
144	NC_000868	GAAC	2	8	64144	64151	50 %	0 %	25 %	25 %	14520289
145	NC_000868	CCGA	2	8	64294	64301	25 %	0 %	25 %	50 %	14520290
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