MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 22089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	CCT	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_000868	CCT	2	6	63	68	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_000868	TCG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520219
4	NC_000868	GGC	2	6	251	256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520219
5	NC_000868	CTT	2	6	383	388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520219
6	NC_000868	GAT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520219
7	NC_000868	TAG	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520219
8	NC_000868	GGA	2	6	561	566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520219
9	NC_000868	CTA	2	6	589	594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520219
10	NC_000868	CTT	2	6	611	616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520219
11	NC_000868	CTC	2	6	634	639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
12	NC_000868	CAA	2	6	717	722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520220
13	NC_000868	AAC	2	6	751	756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520220
14	NC_000868	CGG	2	6	825	830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520220
15	NC_000868	TCC	2	6	836	841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
16	NC_000868	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520220
17	NC_000868	CTC	2	6	885	890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
18	NC_000868	TCA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520220
19	NC_000868	TCC	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520220
20	NC_000868	TCC	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520221
21	NC_000868	TTA	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520221
22	NC_000868	ATT	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520221
23	NC_000868	CTT	2	6	1184	1189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520221
24	NC_000868	CTC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520221
25	NC_000868	TCC	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
26	NC_000868	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520222
27	NC_000868	CCT	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
28	NC_000868	ATC	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520222
29	NC_000868	TTA	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520222
30	NC_000868	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520222
31	NC_000868	GAC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520222
32	NC_000868	TCT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520222
33	NC_000868	GGC	2	6	2115	2120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520222
34	NC_000868	TTC	2	6	2121	2126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520222
35	NC_000868	TGA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520222
36	NC_000868	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520222
37	NC_000868	CAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520222
38	NC_000868	CTC	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
39	NC_000868	CTA	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520222
40	NC_000868	CTC	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
41	NC_000868	CTC	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520222
42	NC_000868	ACG	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520222
43	NC_000868	ACT	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520223
44	NC_000868	GAC	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520223
45	NC_000868	CAT	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520223
46	NC_000868	GAA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520223
47	NC_000868	TCA	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520223
48	NC_000868	TCT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520223
49	NC_000868	TCG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520223
50	NC_000868	TTC	2	6	2866	2871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520223
51	NC_000868	TTA	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000868	TCC	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_000868	TTC	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000868	AAT	2	6	3254	3259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000868	ACC	3	9	3522	3530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520224
56	NC_000868	TAT	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520224
57	NC_000868	CTC	3	9	3627	3635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520224
58	NC_000868	ATG	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520224
59	NC_000868	GTT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520224
60	NC_000868	TAA	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520224
61	NC_000868	CTT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520224
62	NC_000868	CAC	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_000868	GGA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
64	NC_000868	AGA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520225
65	NC_000868	TAA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520225
66	NC_000868	GGC	2	6	4567	4572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520225
67	NC_000868	TAA	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520225
68	NC_000868	ATT	2	6	4639	4644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520225
69	NC_000868	GGA	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
70	NC_000868	AGG	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
71	NC_000868	TGA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520225
72	NC_000868	AGG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520225
73	NC_000868	CGG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_000868	CCA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_000868	ATA	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000868	CAC	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_000868	CAT	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_000868	ATA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000868	AGA	2	6	5748	5753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000868	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000868	TCT	2	6	6142	6147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000868	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000868	TAG	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000868	GAG	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000868	AGG	2	6	6314	6319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000868	AGA	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520227
87	NC_000868	CAG	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520227
88	NC_000868	TAG	2	6	6727	6732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520227
89	NC_000868	CCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520227
90	NC_000868	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520227
91	NC_000868	TAG	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520227
92	NC_000868	CTA	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520227
93	NC_000868	GAA	3	9	6885	6893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520227
94	NC_000868	CTG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520227
95	NC_000868	AGG	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520227
96	NC_000868	TTC	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
97	NC_000868	TTC	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
98	NC_000868	ATT	2	6	7123	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520228
99	NC_000868	TGT	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520228
100	NC_000868	CAA	2	6	7299	7304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520228
101	NC_000868	CTT	2	6	7331	7336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
102	NC_000868	TTA	2	6	7377	7382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520228
103	NC_000868	AAG	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520228
104	NC_000868	TCC	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520228
105	NC_000868	CTT	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520228
106	NC_000868	CCT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520228
107	NC_000868	TAT	2	6	7741	7746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520228
108	NC_000868	TCC	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520228
109	NC_000868	TTC	2	6	7900	7905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
110	NC_000868	TAT	2	6	8002	8007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520229
111	NC_000868	AGG	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520229
112	NC_000868	ATT	2	6	8039	8044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520229
113	NC_000868	CTC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520229
114	NC_000868	CTT	2	6	8251	8256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
115	NC_000868	TCG	2	6	8297	8302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520229
116	NC_000868	CTT	2	6	8314	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
117	NC_000868	CTT	2	6	8428	8433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520229
118	NC_000868	ATC	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520229
119	NC_000868	ATC	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520229
120	NC_000868	CTC	2	6	8688	8693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520230
121	NC_000868	CTT	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
122	NC_000868	CTT	2	6	8837	8842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
123	NC_000868	TAT	2	6	8927	8932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520230
124	NC_000868	CTT	2	6	8999	9004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
125	NC_000868	TGG	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520230
126	NC_000868	CTT	2	6	9077	9082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520230
127	NC_000868	ACG	2	6	9135	9140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520230
128	NC_000868	AAC	2	6	9236	9241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520230
129	NC_000868	TAT	2	6	9272	9277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520230
130	NC_000868	CCT	2	6	9317	9322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520230
131	NC_000868	TGG	2	6	9418	9423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520230
132	NC_000868	CTC	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520230
133	NC_000868	CAA	2	6	9544	9549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520230
134	NC_000868	GTA	2	6	9689	9694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520231
135	NC_000868	CCG	2	6	9697	9702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520231
136	NC_000868	CCT	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520231
137	NC_000868	GAA	2	6	9788	9793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520231
138	NC_000868	ATT	2	6	9885	9890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520231
139	NC_000868	CTT	2	6	10018	10023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520231
140	NC_000868	CTA	2	6	10069	10074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520231
141	NC_000868	TAT	2	6	10118	10123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520231
142	NC_000868	TCT	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520231
143	NC_000868	GAA	2	6	10214	10219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520231
144	NC_000868	TTG	2	6	10231	10236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520231
145	NC_000868	TAA	2	6	10306	10311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520231
146	NC_000868	TTA	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520231
147	NC_000868	ATC	2	6	10419	10424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520231
148	NC_000868	ATT	2	6	10590	10595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520231
149	NC_000868	TAG	2	6	10766	10771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520231
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151	NC_000868	ACC	2	6	10787	10792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_000868	CCT	2	6	10878	10883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520232
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162	NC_000868	ACC	2	6	12177	12182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520232
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176	NC_000868	TAT	2	6	13091	13096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520233
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184	NC_000868	CTA	2	6	13857	13862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_000868	ATT	2	6	13988	13993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520234
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198	NC_000868	TCA	2	6	14662	14667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520235
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221	NC_000868	TGA	2	6	15942	15947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520235
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230	NC_000868	TGT	2	6	16373	16378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_000868	TCT	2	6	17359	17364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520237
241	NC_000868	GAG	2	6	17378	17383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520237
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252	NC_000868	TTC	2	6	18836	18841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520240
253	NC_000868	CTT	2	6	18873	18878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520240
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255	NC_000868	TAT	2	6	18918	18923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520240
256	NC_000868	AGT	2	6	18981	18986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520240
257	NC_000868	CTC	2	6	19095	19100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520240
258	NC_000868	CAT	2	6	19116	19121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520240
259	NC_000868	CTC	2	6	19138	19143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520240
260	NC_000868	GTA	2	6	19191	19196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520240
261	NC_000868	GGC	2	6	19290	19295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520240
262	NC_000868	TAG	2	6	19400	19405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520240
263	NC_000868	TCT	2	6	19419	19424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520240
264	NC_000868	GGT	2	6	19533	19538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520240
265	NC_000868	GTT	2	6	19603	19608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520240
266	NC_000868	TCC	2	6	19639	19644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520240
267	NC_000868	TCA	2	6	19654	19659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520240
268	NC_000868	CCA	2	6	19741	19746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520240
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273	NC_000868	GAA	2	6	20052	20057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520240
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275	NC_000868	CGT	2	6	20105	20110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520240
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277	NC_000868	GCT	2	6	20298	20303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520240
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279	NC_000868	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520240
280	NC_000868	CTT	2	6	20518	20523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520240
281	NC_000868	CCT	2	6	20561	20566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520240
282	NC_000868	TCC	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520240
283	NC_000868	CTT	2	6	20803	20808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520240
284	NC_000868	GAA	2	6	20821	20826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_000868	TCA	2	6	20892	20897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520241
286	NC_000868	TAT	2	6	20898	20903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520241
287	NC_000868	CAT	2	6	20934	20939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520241
288	NC_000868	CTT	2	6	21678	21683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520241
289	NC_000868	ATC	2	6	21844	21849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520241
290	NC_000868	CGT	2	6	21855	21860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520241
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293	NC_000868	GCG	2	6	22083	22088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520242
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299	NC_000868	CGG	2	6	22549	22554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520242
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386	NC_000868	CAT	2	6	29954	29959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520250
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391	NC_000868	TCA	2	6	30442	30447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520250
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394	NC_000868	AGT	2	6	30861	30866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520250
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434	NC_000868	GTT	2	6	34599	34604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520254
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