MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 1892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	CCT	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_000868	CCT	2	6	63	68	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_000868	TTA	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000868	TCC	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_000868	TTC	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_000868	AAT	2	6	3254	3259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000868	CAC	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_000868	CGG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000868	CCA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_000868	ATA	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000868	CAC	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_000868	CAT	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000868	ATA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000868	AGA	2	6	5748	5753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000868	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000868	TCT	2	6	6142	6147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_000868	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000868	TAG	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000868	GAG	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000868	AGG	2	6	6314	6319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000868	ACC	2	6	10787	10792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_000868	AAT	2	6	13831	13836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000868	CTA	2	6	13857	13862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000868	AGA	2	6	14627	14632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000868	GAA	2	6	14645	14650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000868	TGT	2	6	16373	16378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000868	GAA	2	6	20821	20826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000868	CAC	2	6	25008	25013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_000868	TAT	2	6	25058	25063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000868	GAA	2	6	26733	26738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000868	TAT	2	6	28003	28008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000868	TTC	2	6	28063	28068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_000868	AGG	2	6	28185	28190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000868	TTC	2	6	29701	29706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000868	ATT	2	6	32516	32521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000868	GAA	2	6	32564	32569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000868	TAA	2	6	32578	32583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000868	CTT	2	6	32819	32824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_000868	TCC	2	6	32832	32837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_000868	TTC	2	6	32841	32846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000868	TTA	2	6	32907	32912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000868	ACA	2	6	32937	32942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000868	TAT	2	6	32945	32950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000868	TTC	3	9	33406	33414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_000868	TTA	2	6	35896	35901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000868	AAG	2	6	36015	36020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000868	TAA	2	6	38069	38074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000868	ATC	2	6	38165	38170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_000868	TCA	2	6	40591	40596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_000868	CCA	2	6	43693	43698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_000868	CAC	2	6	48667	48672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_000868	CCA	2	6	55842	55847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_000868	GCG	3	9	56908	56916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000868	CCT	2	6	56947	56952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_000868	GCT	2	6	57010	57015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_000868	GGC	2	6	57134	57139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_000868	CGG	2	6	57177	57182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000868	CGC	2	6	57222	57227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_000868	ACT	2	6	57234	57239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_000868	TTA	2	6	57316	57321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000868	TTC	2	6	57338	57343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_000868	GTG	2	6	58688	58693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000868	GAT	2	6	58784	58789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000868	TAA	2	6	58805	58810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000868	AGA	3	9	59025	59033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000868	AAG	2	6	59088	59093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000868	AGA	2	6	59291	59296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000868	GAA	2	6	59329	59334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000868	CCT	2	6	62646	62651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_000868	TTA	2	6	62708	62713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000868	AGG	2	6	63476	63481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000868	AGA	2	6	65038	65043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000868	TAA	2	6	65205	65210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000868	TCA	2	6	65242	65247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_000868	CAT	3	9	65266	65274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_000868	TAT	2	6	65306	65311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000868	CAT	2	6	65318	65323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_000868	GAT	2	6	65337	65342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000868	ATT	2	6	65426	65431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000868	TAG	2	6	65501	65506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000868	CCT	2	6	67420	67425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_000868	ATG	2	6	67954	67959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000868	TGG	2	6	71475	71480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000868	ATC	2	6	71486	71491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_000868	TCA	2	6	73052	73057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_000868	CAA	2	6	73066	73071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_000868	TCA	3	9	73078	73086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_000868	AAG	2	6	76150	76155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000868	AAG	2	6	76191	76196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000868	AGA	2	6	76219	76224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000868	TCC	2	6	77080	77085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_000868	CCT	2	6	77185	77190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_000868	TTA	2	6	78919	78924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000868	GGT	2	6	79040	79045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000868	CTT	2	6	79896	79901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_000868	TCT	2	6	79905	79910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_000868	GGT	2	6	79950	79955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000868	CTT	2	6	91669	91674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_000868	TTA	2	6	91699	91704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000868	CAA	2	6	91728	91733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_000868	TGG	2	6	91742	91747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000868	ACT	2	6	92852	92857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_000868	TAA	2	6	98456	98461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000868	TGA	2	6	107410	107415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000868	ATG	2	6	110884	110889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000868	ACC	2	6	113587	113592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_000868	TAG	2	6	113599	113604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000868	CTT	2	6	115153	115158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_000868	TAA	2	6	122843	122848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000868	GAA	2	6	123380	123385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000868	ACC	2	6	124278	124283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_000868	ATT	2	6	124353	124358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000868	GTT	2	6	129365	129370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000868	ATT	2	6	132115	132120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000868	ACG	2	6	133427	133432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_000868	TCT	2	6	134609	134614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_000868	ATT	2	6	134666	134671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000868	AGT	2	6	134683	134688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000868	TCA	2	6	137897	137902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_000868	AGG	2	6	138029	138034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000868	TCA	2	6	139404	139409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000868	TAT	2	6	139454	139459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000868	AGG	2	6	139556	139561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000868	GGC	2	6	139570	139575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_000868	AAT	2	6	139591	139596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000868	TAA	2	6	140676	140681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000868	AAT	2	6	140748	140753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000868	GAA	2	6	142377	142382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000868	GAA	2	6	148020	148025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000868	TTC	2	6	148233	148238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_000868	GGC	2	6	148496	148501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_000868	CGG	2	6	148512	148517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_000868	AAC	2	6	148551	148556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_000868	ACG	2	6	148753	148758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_000868	CAT	2	6	148785	148790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_000868	GCA	2	6	149165	149170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_000868	GCA	2	6	149177	149182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_000868	CAA	2	6	149230	149235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_000868	ACA	2	6	149770	149775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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