MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	TCCAGA	2	12	46441	46452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000854	CCTAGG	2	12	62159	62170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_000854	CCAATT	2	12	122630	122641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_000854	GGCCGG	2	12	140068	140079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_000854	CATAGG	2	12	149005	149016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_000854	TCTAGG	2	12	181511	181522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_000854	ACCACA	2	12	191538	191549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_000854	CCGGAG	2	12	198484	198495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000854	ACATTA	2	12	198634	198645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_000854	CCGGAG	2	12	200294	200305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_000854	GAGTAG	2	12	209058	209069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000854	CGGACT	2	12	209110	209121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000854	CCAGCA	2	12	303051	303062	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000854	TAAAGC	2	12	308923	308934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_000854	TTAATA	2	12	344842	344853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000854	GAACGT	2	12	380929	380940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_000854	CCACCC	2	12	445255	445266	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
18	NC_000854	GGCTAG	2	12	481806	481817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_000854	TGTACG	2	12	491749	491760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_000854	CTGGCC	2	12	494588	494599	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_000854	AGGGTG	2	12	528094	528105	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000854	GGGTGT	2	12	528427	528438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000854	AAGAAT	2	12	542399	542410	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000854	ATGAGG	2	12	692355	692366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000854	GCCCCC	2	12	708818	708829	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_000854	CAAGCC	2	12	718674	718685	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_000854	TTAAAT	2	12	737699	737710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000854	ACTCCT	2	12	757955	757966	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_000854	GGTGTC	2	12	758560	758571	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_000854	GTTGTA	2	12	763706	763717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000854	ATATAA	2	12	786518	786529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000854	GGAAAA	2	12	786593	786604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000854	TTCTAT	2	12	798762	798773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_000854	CCATCT	2	12	798845	798856	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000854	TAGCTG	2	12	874740	874751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_000854	GTCTGA	2	12	882719	882730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_000854	AGTTGC	2	12	898896	898907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_000854	CAAACC	2	12	922750	922761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000854	CGGGTG	2	12	969226	969237	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_000854	CTAAAC	2	12	984775	984786	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000854	TAAATT	2	12	985543	985554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000854	CAAAAT	2	12	996833	996844	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_000854	AATGCT	2	12	996987	996998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_000854	ACCTCA	2	12	1008295	1008306	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000854	CCGGGC	2	12	1015332	1015343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000854	GGGTGC	2	12	1040555	1040566	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_000854	TTAAAA	2	12	1123890	1123901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000854	GGTAGG	2	12	1128994	1129005	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000854	TCCGCC	2	12	1131056	1131067	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_000854	TAGCTA	2	12	1176469	1176480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_000854	AGGGGG	2	12	1220981	1220992	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000854	ATGAAG	2	12	1237129	1237140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000854	CCAAGG	2	12	1237382	1237393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000854	ACAACC	2	12	1260211	1260222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000854	CCCACC	2	12	1269569	1269580	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_000854	GTCTAA	2	12	1308152	1308163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_000854	CCCTAA	2	12	1311042	1311053	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000854	CCCCCG	2	12	1320054	1320065	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_000854	AATAGT	2	12	1357665	1357676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000854	GCCGGG	2	12	1391366	1391377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_000854	TCCTCT	2	12	1395748	1395759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000854	TCTAGT	2	12	1417933	1417944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_000854	GTAACT	2	12	1445141	1445152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_000854	CGGGGG	2	12	1462175	1462186	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_000854	GTGCAG	2	12	1549780	1549791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_000854	TAGCTG	2	12	1564241	1564252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_000854	TCCCAG	2	12	1575599	1575610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000854	CTTTTC	2	12	1585728	1585739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000854	CCTCTA	2	12	1608737	1608748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000854	ATCATT	2	12	1632391	1632402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_000854	TGTTAT	2	12	1665879	1665890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000854	CCGGAG	2	12	1666804	1666815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.