MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	GAGTCG	2	12	1258042	1258053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601769
502	NC_000854	TGAGTG	2	12	1263212	1263223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	14601774
503	NC_000854	CCTCCC	2	12	1265389	1265400	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	14601777
504	NC_000854	AGGGGT	2	12	1271128	1271139	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	14601784
505	NC_000854	GAGGGG	2	12	1271481	1271492	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	14601784
506	NC_000854	GGAGGC	2	12	1273677	1273688	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118431691
507	NC_000854	GAGAGC	2	12	1274082	1274093	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	14601788
508	NC_000854	GCTGCG	2	12	1284771	1284782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431699
509	NC_000854	CGGCTC	2	12	1288740	1288751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118431702
510	NC_000854	AGGCTA	2	12	1289248	1289259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431703
511	NC_000854	ACAGCC	2	12	1293471	1293482	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118431708
512	NC_000854	TACCTA	2	12	1293981	1293992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431709
513	NC_000854	TCTCCG	2	12	1294396	1294407	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118431710
514	NC_000854	AGCTTA	2	12	1296213	1296224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431711
515	NC_000854	GAGGTG	2	12	1302064	1302075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	118431715
516	NC_000854	AAGCTA	2	12	1306851	1306862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431718
517	NC_000854	GGCATG	2	12	1309772	1309783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601825
518	NC_000854	GCCTCC	2	12	1314561	1314572	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431722
519	NC_000854	CTTCGG	2	12	1316681	1316692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601833
520	NC_000854	TCTCGA	2	12	1318780	1318791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431726
521	NC_000854	GTTGTA	2	12	1321308	1321319	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	14601838
522	NC_000854	CTCCTT	2	12	1324250	1324261	0 %	50 %	0 %	50 %	118431729
523	NC_000854	CTTAAC	2	12	1326228	1326239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431730
524	NC_000854	GATCTC	2	12	1326501	1326512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431730
525	NC_000854	AGGGAG	2	12	1329307	1329318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431732
526	NC_000854	GTTGTC	2	12	1329630	1329641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118431733
527	NC_000854	AGCGGC	2	12	1329921	1329932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431733
528	NC_000854	GGCTAG	2	12	1331117	1331128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601847
529	NC_000854	GTGGCT	2	12	1333570	1333581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14601849
530	NC_000854	CAGCCT	2	12	1337514	1337525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431737
531	NC_000854	GAGGCC	2	12	1341059	1341070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431739
532	NC_000854	AGGGTT	2	12	1343412	1343423	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118431741
533	NC_000854	TGGCTC	2	12	1346178	1346189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431742
534	NC_000854	CGTCAT	2	12	1347476	1347487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431743
535	NC_000854	ATTGAT	3	18	1358152	1358169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118431749
536	NC_000854	GGGTTT	2	12	1358656	1358667	0 %	50 %	50 %	0 %	118431749
537	NC_000854	GGGCGC	2	12	1364032	1364043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431754
538	NC_000854	CTTCCT	2	12	1364903	1364914	0 %	50 %	0 %	50 %	118431755
539	NC_000854	CGCCGG	2	12	1366169	1366180	0 %	0 %	50 %	50 %	118431757
540	NC_000854	CGGGCT	2	12	1367124	1367135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431758
541	NC_000854	GGAGAG	2	12	1374734	1374745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601886
542	NC_000854	TCCTCT	2	12	1378052	1378063	0 %	50 %	0 %	50 %	14601888
543	NC_000854	ATCTTT	2	12	1378199	1378210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	14601888
544	NC_000854	TCCTCT	2	12	1378441	1378452	0 %	50 %	0 %	50 %	118431764
545	NC_000854	CCTTCT	2	12	1379072	1379083	0 %	50 %	0 %	50 %	118431764
546	NC_000854	TATAAA	2	12	1383329	1383340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431770
547	NC_000854	AAGTAC	2	12	1384863	1384874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431772
548	NC_000854	TTGCTT	2	12	1385389	1385400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118431773
549	NC_000854	GACTTA	2	12	1385428	1385439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431773
550	NC_000854	GCGGTG	2	12	1387088	1387099	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118431775
551	NC_000854	AGGGGG	2	12	1387625	1387636	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	118431775
552	NC_000854	GGTTGT	2	12	1389920	1389931	0 %	50 %	50 %	0 %	14601903
553	NC_000854	CTCTTC	2	12	1394193	1394204	0 %	50 %	0 %	50 %	118431777
554	NC_000854	GAGGCC	2	12	1398496	1398507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	14601911
555	NC_000854	CATAGA	2	12	1403886	1403897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431782
556	NC_000854	CTACGT	2	12	1409179	1409190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431784
557	NC_000854	TGGAGG	2	12	1411441	1411452	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	118431786
558	NC_000854	GCTGAG	2	12	1411472	1411483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431786
559	NC_000854	CAGGAC	2	12	1424284	1424295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431794
560	NC_000854	GCGTAG	2	12	1424969	1424980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431794
561	NC_000854	AGGAGC	2	12	1425636	1425647	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431795
562	NC_000854	GCCATA	2	12	1434611	1434622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	14601951
563	NC_000854	CAGAGG	2	12	1435554	1435565	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431800
564	NC_000854	CAGAGG	2	12	1436556	1436567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431801
565	NC_000854	CTGTTG	2	12	1441183	1441194	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118431806
566	NC_000854	AGTCTA	2	12	1442428	1442439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431806
567	NC_000854	TATGAT	2	12	1448265	1448276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	14601960
568	NC_000854	GGCGAG	2	12	1454024	1454035	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	14601964
569	NC_000854	CCTCAA	2	12	1460648	1460659	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	14601969
570	NC_000854	CTTGAG	2	12	1463106	1463117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118431816
571	NC_000854	TCGCCC	2	12	1464748	1464759	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431816
572	NC_000854	GGGGTC	2	12	1465502	1465513	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	14601973
573	NC_000854	GGGCTT	2	12	1465781	1465792	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14601973
574	NC_000854	CACGCT	2	12	1466827	1466838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431817
575	NC_000854	CACCCT	2	12	1471090	1471101	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	118431819
576	NC_000854	GTCGAG	2	12	1473880	1473891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431822
577	NC_000854	CAGCCA	2	12	1477320	1477331	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	14601982
578	NC_000854	CTCACC	2	12	1482422	1482433	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	14601988
579	NC_000854	TCTTGC	2	12	1483677	1483688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118431827
580	NC_000854	GGGGGT	2	12	1483893	1483904	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	118431827
581	NC_000854	TGGGGT	2	12	1483950	1483961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431827
582	NC_000854	TGAAGC	2	12	1485965	1485976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14601992
583	NC_000854	TGAGGC	2	12	1486890	1486901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601994
584	NC_000854	CGTGCT	2	12	1491064	1491075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431834
585	NC_000854	TCTCCC	2	12	1497352	1497363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431838
586	NC_000854	GCCCAG	2	12	1497846	1497857	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118431839
587	NC_000854	TCTCAA	2	12	1498560	1498571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431840
588	NC_000854	CGCCTT	2	12	1502642	1502653	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14602016
589	NC_000854	GAGCGG	2	12	1504091	1504102	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118431845
590	NC_000854	GAGGCC	2	12	1504709	1504720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431846
591	NC_000854	TATCTC	2	12	1508877	1508888	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118431851
592	NC_000854	GGATAG	2	12	1512114	1512125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	14602026
593	NC_000854	TAGGAG	2	12	1513392	1513403	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	14602028
594	NC_000854	GGTTAG	2	12	1514029	1514040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118431853
595	NC_000854	TCAGGG	2	12	1514226	1514237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431854
596	NC_000854	GTTGAG	2	12	1514745	1514756	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118431855
597	NC_000854	TCAGGC	2	12	1515257	1515268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118431855
598	NC_000854	AAGAAC	2	12	1516360	1516371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118431856
599	NC_000854	CAGGGC	2	12	1521407	1521418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431858
600	NC_000854	CCTCGG	2	12	1523936	1523947	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118431859
601	NC_000854	CCCCCT	2	12	1524687	1524698	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	118431860
602	NC_000854	AACCCT	2	12	1525241	1525252	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118431861
603	NC_000854	CTGGGC	2	12	1528767	1528778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431864
604	NC_000854	CCTTGC	2	12	1530537	1530548	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118431865
605	NC_000854	GAGAGG	2	12	1531185	1531196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431866
606	NC_000854	CAGCCA	2	12	1532053	1532064	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	14602051
607	NC_000854	GTCCTC	2	12	1532945	1532956	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14602052
608	NC_000854	CAGCGT	2	12	1533532	1533543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14602052
609	NC_000854	GGCAGC	2	12	1534405	1534416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	14602053
610	NC_000854	GATGTT	2	12	1534609	1534620	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	14602053
611	NC_000854	CCTCTC	2	12	1534896	1534907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602053
612	NC_000854	TTGAGG	2	12	1540587	1540598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118431870
613	NC_000854	TAGAAA	2	12	1546673	1546684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	14602065
614	NC_000854	CTTCCT	2	12	1555499	1555510	0 %	50 %	0 %	50 %	118431875
615	NC_000854	TGGCTG	2	12	1556840	1556851	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14602074
616	NC_000854	GCTATG	2	12	1557536	1557547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14602074
617	NC_000854	CTTGCC	2	12	1559251	1559262	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14602214
618	NC_000854	CGAAGT	2	12	1564829	1564840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431883
619	NC_000854	ACCCGG	2	12	1567979	1567990	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	14602084
620	NC_000854	CCTCGT	2	12	1571115	1571126	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118431886
621	NC_000854	TGCGCG	2	12	1572080	1572091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431887
622	NC_000854	CCACAG	2	12	1572357	1572368	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118431887
623	NC_000854	CTCCAG	2	12	1576287	1576298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431892
624	NC_000854	GCAGTG	2	12	1579071	1579082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431895
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626	NC_000854	CGCCTC	2	12	1584013	1584024	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431900
627	NC_000854	GTATAC	2	12	1586619	1586630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431903
628	NC_000854	CATAGG	2	12	1587893	1587904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431903
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632	NC_000854	GCCTCC	2	12	1610129	1610140	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431916
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634	NC_000854	ATCTCA	2	12	1618908	1618919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431921
635	NC_000854	CTGCGG	2	12	1620576	1620587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	14602138
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637	NC_000854	CCTAGG	2	12	1624089	1624100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118431922
638	NC_000854	CCGGCG	2	12	1624470	1624481	0 %	0 %	50 %	50 %	118431922
639	NC_000854	TCAACC	2	12	1626909	1626920	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118431923
640	NC_000854	CTCGGC	2	12	1627874	1627885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118431923
641	NC_000854	ACCGCC	2	12	1628471	1628482	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118431923
642	NC_000854	CCAGCA	2	12	1629665	1629676	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	14602146
643	NC_000854	AGGCCA	2	12	1630918	1630929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602148
644	NC_000854	GCAGTC	2	12	1631073	1631084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14602148
645	NC_000854	AGGGTC	2	12	1633310	1633321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431927
646	NC_000854	GTTAAG	2	12	1633532	1633543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431927
647	NC_000854	TAGGAT	2	12	1638028	1638039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431928
648	NC_000854	CATGAG	2	12	1638754	1638765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14602155
649	NC_000854	TTGAGC	2	12	1640821	1640832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14602157
650	NC_000854	GGGAGG	2	12	1643576	1643587	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	118431930
651	NC_000854	CTAGCC	2	12	1644442	1644453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14602160
652	NC_000854	GCTAGG	2	12	1644832	1644843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14602160
653	NC_000854	CCTCAG	2	12	1645695	1645706	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431931
654	NC_000854	ATCCTC	2	12	1652593	1652604	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	14602168
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657	NC_000854	CAGGGG	2	12	1661125	1661136	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	14602175
658	NC_000854	TCGCCT	2	12	1664147	1664158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118431941

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