MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	GTGGAT	2	12	1100187	1100198	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118431573
502	NC_000854	CATAGC	2	12	1100586	1100597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118431573
503	NC_000854	ACCTCG	2	12	1101937	1101948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431575
504	NC_000854	ATGCCT	2	12	1105513	1105524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431577
505	NC_000854	TCGTAG	2	12	1107380	1107391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14601607
506	NC_000854	GCCTCC	2	12	1112807	1112818	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431581
507	NC_000854	GGCGTC	2	12	1113409	1113420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431581
508	NC_000854	GCCACC	2	12	1114603	1114614	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118431582
509	NC_000854	AGGGCG	2	12	1116646	1116657	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118431584
510	NC_000854	GACATA	2	12	1120033	1120044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431586
511	NC_000854	TTAAAA	2	12	1123890	1123901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_000854	GTCGGC	2	12	1124669	1124680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431591
513	NC_000854	CCCTCT	2	12	1127131	1127142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431594
514	NC_000854	GGTAGG	2	12	1128994	1129005	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_000854	TCCGCC	2	12	1131056	1131067	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_000854	ACGTTG	2	12	1134278	1134289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118431598
517	NC_000854	GAAGGA	2	12	1134291	1134302	50 %	0 %	50 %	0 %	118431598
518	NC_000854	GGCCGG	2	12	1142386	1142397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601641
519	NC_000854	ACCTCC	2	12	1147561	1147572	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	14601647
520	NC_000854	TCCTGG	2	12	1149388	1149399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601649
521	NC_000854	AAGGCG	2	12	1153018	1153029	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431607
522	NC_000854	TGGGCA	2	12	1155639	1155650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431608
523	NC_000854	GGAGGC	2	12	1157256	1157267	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	14601657
524	NC_000854	GCTACG	2	12	1157579	1157590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14601657
525	NC_000854	TAGAGC	2	12	1161926	1161937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431612
526	NC_000854	CTCCAC	2	12	1162635	1162646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	118431613
527	NC_000854	GCTTCT	2	12	1167108	1167119	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	14601670
528	NC_000854	CACCGA	2	12	1168360	1168371	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118431616
529	NC_000854	TATCTC	2	12	1171715	1171726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118431618
530	NC_000854	CAGCCT	2	12	1174739	1174750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14601675
531	NC_000854	TAGCTA	2	12	1176469	1176480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
532	NC_000854	TGTATC	2	12	1177814	1177825	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118431620
533	NC_000854	CCTAGC	2	12	1178405	1178416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431621
534	NC_000854	CTGGCG	2	12	1182348	1182359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431625
535	NC_000854	TCAGCG	2	12	1194588	1194599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14601697
536	NC_000854	CTCTAC	2	12	1195728	1195739	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118431634
537	NC_000854	CCCCTA	2	12	1195798	1195809	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	118431634
538	NC_000854	ATCTCT	2	12	1199349	1199360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	14601702
539	NC_000854	GTAGAA	2	12	1201729	1201740	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118431639
540	NC_000854	TCGCCA	2	12	1207892	1207903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14601712
541	NC_000854	TATAGC	2	12	1208104	1208115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14601712
542	NC_000854	CTCAAC	2	12	1214131	1214142	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	14601719
543	NC_000854	AGGGGG	2	12	1220981	1220992	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_000854	CGGCCG	2	12	1221962	1221973	0 %	0 %	50 %	50 %	14601723
545	NC_000854	TCTCCC	2	12	1223369	1223380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431648
546	NC_000854	AACCTC	2	12	1226866	1226877	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118431652
547	NC_000854	GGGCTG	2	12	1229253	1229264	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118431654
548	NC_000854	GAGCAC	2	12	1231132	1231143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601736
549	NC_000854	CCTATA	2	12	1231857	1231868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431656
550	NC_000854	ATGAAG	2	12	1237129	1237140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_000854	CCAAGG	2	12	1237382	1237393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_000854	CGGCCT	2	12	1243243	1243254	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118431664
553	NC_000854	GAGAGG	2	12	1251517	1251528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431671
554	NC_000854	GAGTCG	2	12	1258042	1258053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601769
555	NC_000854	ACAACC	2	12	1260211	1260222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_000854	TGAGTG	2	12	1263212	1263223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	14601774
557	NC_000854	CCTCCC	2	12	1265389	1265400	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	14601777
558	NC_000854	CCCACC	2	12	1269569	1269580	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
559	NC_000854	AGGGGT	2	12	1271128	1271139	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	14601784
560	NC_000854	GAGGGG	2	12	1271481	1271492	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	14601784
561	NC_000854	GGAGGC	2	12	1273677	1273688	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118431691
562	NC_000854	GAGAGC	2	12	1274082	1274093	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	14601788
563	NC_000854	GCTGCG	2	12	1284771	1284782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431699
564	NC_000854	CGGCTC	2	12	1288740	1288751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118431702
565	NC_000854	AGGCTA	2	12	1289248	1289259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431703
566	NC_000854	ACAGCC	2	12	1293471	1293482	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118431708
567	NC_000854	TACCTA	2	12	1293981	1293992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431709
568	NC_000854	TCTCCG	2	12	1294396	1294407	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118431710
569	NC_000854	AGCTTA	2	12	1296213	1296224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431711
570	NC_000854	GAGGTG	2	12	1302064	1302075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	118431715
571	NC_000854	AAGCTA	2	12	1306851	1306862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431718
572	NC_000854	GTCTAA	2	12	1308152	1308163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
573	NC_000854	GGCATG	2	12	1309772	1309783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601825
574	NC_000854	CCCTAA	2	12	1311042	1311053	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_000854	GCCTCC	2	12	1314561	1314572	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431722
576	NC_000854	CTTCGG	2	12	1316681	1316692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601833
577	NC_000854	TCTCGA	2	12	1318780	1318791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431726
578	NC_000854	CCCCCG	2	12	1320054	1320065	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
579	NC_000854	GTTGTA	2	12	1321308	1321319	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	14601838
580	NC_000854	CTCCTT	2	12	1324250	1324261	0 %	50 %	0 %	50 %	118431729
581	NC_000854	CTTAAC	2	12	1326228	1326239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431730
582	NC_000854	GATCTC	2	12	1326501	1326512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431730
583	NC_000854	AGGGAG	2	12	1329307	1329318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431732
584	NC_000854	GTTGTC	2	12	1329630	1329641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118431733
585	NC_000854	AGCGGC	2	12	1329921	1329932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431733
586	NC_000854	GGCTAG	2	12	1331117	1331128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14601847
587	NC_000854	GTGGCT	2	12	1333570	1333581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14601849
588	NC_000854	CAGCCT	2	12	1337514	1337525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431737
589	NC_000854	GAGGCC	2	12	1341059	1341070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431739
590	NC_000854	AGGGTT	2	12	1343412	1343423	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118431741
591	NC_000854	TGGCTC	2	12	1346178	1346189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431742
592	NC_000854	CGTCAT	2	12	1347476	1347487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431743
593	NC_000854	AATAGT	2	12	1357665	1357676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_000854	ATTGAT	3	18	1358152	1358169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118431749
595	NC_000854	GGGTTT	2	12	1358656	1358667	0 %	50 %	50 %	0 %	118431749
596	NC_000854	GGGCGC	2	12	1364032	1364043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431754
597	NC_000854	CTTCCT	2	12	1364903	1364914	0 %	50 %	0 %	50 %	118431755
598	NC_000854	CGCCGG	2	12	1366169	1366180	0 %	0 %	50 %	50 %	118431757
599	NC_000854	CGGGCT	2	12	1367124	1367135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118431758
600	NC_000854	GGAGAG	2	12	1374734	1374745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601886
601	NC_000854	TCCTCT	2	12	1378052	1378063	0 %	50 %	0 %	50 %	14601888
602	NC_000854	ATCTTT	2	12	1378199	1378210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	14601888
603	NC_000854	TCCTCT	2	12	1378441	1378452	0 %	50 %	0 %	50 %	118431764
604	NC_000854	CCTTCT	2	12	1379072	1379083	0 %	50 %	0 %	50 %	118431764
605	NC_000854	TATAAA	2	12	1383329	1383340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431770
606	NC_000854	AAGTAC	2	12	1384863	1384874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431772
607	NC_000854	TTGCTT	2	12	1385389	1385400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118431773
608	NC_000854	GACTTA	2	12	1385428	1385439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431773
609	NC_000854	GCGGTG	2	12	1387088	1387099	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118431775
610	NC_000854	AGGGGG	2	12	1387625	1387636	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	118431775
611	NC_000854	GGTTGT	2	12	1389920	1389931	0 %	50 %	50 %	0 %	14601903
612	NC_000854	GCCGGG	2	12	1391366	1391377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_000854	CTCTTC	2	12	1394193	1394204	0 %	50 %	0 %	50 %	118431777
614	NC_000854	TCCTCT	2	12	1395748	1395759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_000854	GAGGCC	2	12	1398496	1398507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	14601911
616	NC_000854	CATAGA	2	12	1403886	1403897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118431782
617	NC_000854	CTACGT	2	12	1409179	1409190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118431784
618	NC_000854	TGGAGG	2	12	1411441	1411452	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	118431786
619	NC_000854	GCTGAG	2	12	1411472	1411483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431786
620	NC_000854	TCTAGT	2	12	1417933	1417944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
621	NC_000854	CAGGAC	2	12	1424284	1424295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431794
622	NC_000854	GCGTAG	2	12	1424969	1424980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431794
623	NC_000854	AGGAGC	2	12	1425636	1425647	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431795
624	NC_000854	GCCATA	2	12	1434611	1434622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	14601951
625	NC_000854	CAGAGG	2	12	1435554	1435565	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431800
626	NC_000854	CAGAGG	2	12	1436556	1436567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431801
627	NC_000854	CTGTTG	2	12	1441183	1441194	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118431806
628	NC_000854	AGTCTA	2	12	1442428	1442439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431806
629	NC_000854	GTAACT	2	12	1445141	1445152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
630	NC_000854	TATGAT	2	12	1448265	1448276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	14601960
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632	NC_000854	CCTCAA	2	12	1460648	1460659	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	14601969
633	NC_000854	CGGGGG	2	12	1462175	1462186	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
634	NC_000854	CTTGAG	2	12	1463106	1463117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118431816
635	NC_000854	TCGCCC	2	12	1464748	1464759	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431816
636	NC_000854	GGGGTC	2	12	1465502	1465513	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	14601973
637	NC_000854	GGGCTT	2	12	1465781	1465792	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14601973
638	NC_000854	CACGCT	2	12	1466827	1466838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431817
639	NC_000854	CACCCT	2	12	1471090	1471101	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	118431819
640	NC_000854	GTCGAG	2	12	1473880	1473891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431822
641	NC_000854	CAGCCA	2	12	1477320	1477331	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	14601982
642	NC_000854	CTCACC	2	12	1482422	1482433	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	14601988
643	NC_000854	TCTTGC	2	12	1483677	1483688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118431827
644	NC_000854	GGGGGT	2	12	1483893	1483904	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	118431827
645	NC_000854	TGGGGT	2	12	1483950	1483961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431827
646	NC_000854	TGAAGC	2	12	1485965	1485976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14601992
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651	NC_000854	TCTCAA	2	12	1498560	1498571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431840
652	NC_000854	CGCCTT	2	12	1502642	1502653	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14602016
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654	NC_000854	GAGGCC	2	12	1504709	1504720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431846
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656	NC_000854	GGATAG	2	12	1512114	1512125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	14602026
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659	NC_000854	TCAGGG	2	12	1514226	1514237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431854
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672	NC_000854	CAGCGT	2	12	1533532	1533543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14602052
673	NC_000854	GGCAGC	2	12	1534405	1534416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	14602053
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679	NC_000854	CTTCCT	2	12	1555499	1555510	0 %	50 %	0 %	50 %	118431875
680	NC_000854	TGGCTG	2	12	1556840	1556851	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14602074
681	NC_000854	GCTATG	2	12	1557536	1557547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14602074
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684	NC_000854	CGAAGT	2	12	1564829	1564840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431883
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689	NC_000854	TCCCAG	2	12	1575599	1575610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
690	NC_000854	CTCCAG	2	12	1576287	1576298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431892
691	NC_000854	GCAGTG	2	12	1579071	1579082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431895
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693	NC_000854	CGCCTC	2	12	1584013	1584024	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431900
694	NC_000854	CTTTTC	2	12	1585728	1585739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
695	NC_000854	GTATAC	2	12	1586619	1586630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118431903
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699	NC_000854	GTGCAG	2	12	1605713	1605724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431914
700	NC_000854	CCTCTA	2	12	1608737	1608748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
701	NC_000854	GCCTCC	2	12	1610129	1610140	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431916
702	NC_000854	GCCCTC	2	12	1612127	1612138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118431918
703	NC_000854	ATCTCA	2	12	1618908	1618919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431921
704	NC_000854	CTGCGG	2	12	1620576	1620587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	14602138
705	NC_000854	CAAGGC	2	12	1621454	1621465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602139
706	NC_000854	CCTAGG	2	12	1624089	1624100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118431922
707	NC_000854	CCGGCG	2	12	1624470	1624481	0 %	0 %	50 %	50 %	118431922
708	NC_000854	TCAACC	2	12	1626909	1626920	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118431923
709	NC_000854	CTCGGC	2	12	1627874	1627885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118431923
710	NC_000854	ACCGCC	2	12	1628471	1628482	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118431923
711	NC_000854	CCAGCA	2	12	1629665	1629676	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	14602146
712	NC_000854	AGGCCA	2	12	1630918	1630929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602148
713	NC_000854	GCAGTC	2	12	1631073	1631084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14602148
714	NC_000854	ATCATT	2	12	1632391	1632402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
715	NC_000854	AGGGTC	2	12	1633310	1633321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431927
716	NC_000854	GTTAAG	2	12	1633532	1633543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431927
717	NC_000854	TAGGAT	2	12	1638028	1638039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431928
718	NC_000854	CATGAG	2	12	1638754	1638765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14602155
719	NC_000854	TTGAGC	2	12	1640821	1640832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14602157
720	NC_000854	GGGAGG	2	12	1643576	1643587	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	118431930
721	NC_000854	CTAGCC	2	12	1644442	1644453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14602160
722	NC_000854	GCTAGG	2	12	1644832	1644843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14602160
723	NC_000854	CCTCAG	2	12	1645695	1645706	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118431931
724	NC_000854	ATCCTC	2	12	1652593	1652604	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	14602168
725	NC_000854	CTGCCT	2	12	1653066	1653077	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14602168
726	NC_000854	CGCGAC	2	12	1655729	1655740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	14602170
727	NC_000854	CAGGGG	2	12	1661125	1661136	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	14602175
728	NC_000854	TCGCCT	2	12	1664147	1664158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118431941
729	NC_000854	TGTTAT	2	12	1665879	1665890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
730	NC_000854	CCGGAG	2	12	1666804	1666815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

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