MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	TGGT	2	8	618	625	0 %	50 %	50 %	0 %	14600380
2	NC_000854	ACCA	2	8	735	742	50 %	0 %	0 %	50 %	14600380
3	NC_000854	AGCC	2	8	963	970	25 %	0 %	25 %	50 %	14600381
4	NC_000854	CAAG	2	8	2325	2332	50 %	0 %	25 %	25 %	118430836
5	NC_000854	ATGA	2	8	2540	2547	50 %	25 %	25 %	0 %	118430836
6	NC_000854	AGGA	2	8	2892	2899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000854	AGAA	2	8	3085	3092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000854	GAAA	3	12	3234	3245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000854	TTAT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000854	AAGC	2	8	4020	4027	50 %	0 %	25 %	25 %	118430837
11	NC_000854	CGGG	2	8	4099	4106	0 %	0 %	75 %	25 %	118430837
12	NC_000854	CCTC	2	8	4975	4982	0 %	25 %	0 %	75 %	118430837
13	NC_000854	TTCA	2	8	6083	6090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_000854	GGAT	2	8	6140	6147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000854	CATT	2	8	6437	6444	25 %	50 %	0 %	25 %	118430839
16	NC_000854	CCAC	2	8	6489	6496	25 %	0 %	0 %	75 %	118430839
17	NC_000854	CCTC	2	8	7448	7455	0 %	25 %	0 %	75 %	118430839
18	NC_000854	CCTC	2	8	7603	7610	0 %	25 %	0 %	75 %	118430839
19	NC_000854	GCAC	2	8	8704	8711	25 %	0 %	25 %	50 %	118430840
20	NC_000854	TCAG	2	8	9078	9085	25 %	25 %	25 %	25 %	14600388
21	NC_000854	AAGG	2	8	9220	9227	50 %	0 %	50 %	0 %	14600388
22	NC_000854	GCCA	2	8	10315	10322	25 %	0 %	25 %	50 %	118430841
23	NC_000854	AGCA	2	8	11714	11721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000854	CTGG	2	8	12587	12594	0 %	25 %	50 %	25 %	118430842
25	NC_000854	GCCA	2	8	13215	13222	25 %	0 %	25 %	50 %	118430842
26	NC_000854	GTCG	2	8	13224	13231	0 %	25 %	50 %	25 %	118430842
27	NC_000854	CCAG	2	8	13598	13605	25 %	0 %	25 %	50 %	118430842
28	NC_000854	GGAT	2	8	14146	14153	25 %	25 %	50 %	0 %	118430843
29	NC_000854	CCAC	2	8	14263	14270	25 %	0 %	0 %	75 %	118430843
30	NC_000854	CTGT	2	8	14316	14323	0 %	50 %	25 %	25 %	118430843
31	NC_000854	CAGC	2	8	14419	14426	25 %	0 %	25 %	50 %	118430843
32	NC_000854	ATGC	2	8	14724	14731	25 %	25 %	25 %	25 %	118430843
33	NC_000854	CTGC	2	8	14875	14882	0 %	25 %	25 %	50 %	118430843
34	NC_000854	CATC	2	8	15402	15409	25 %	25 %	0 %	50 %	118430844
35	NC_000854	AGTT	2	8	16954	16961	25 %	50 %	25 %	0 %	14600396
36	NC_000854	CATA	2	8	16991	16998	50 %	25 %	0 %	25 %	14600396
37	NC_000854	CCAG	2	8	19085	19092	25 %	0 %	25 %	50 %	14600397
38	NC_000854	CCTT	2	8	19390	19397	0 %	50 %	0 %	50 %	118430847
39	NC_000854	ATGT	2	8	19471	19478	25 %	50 %	25 %	0 %	118430847
40	NC_000854	GGTA	2	8	20400	20407	25 %	25 %	50 %	0 %	118430847
41	NC_000854	CTTA	2	8	20450	20457	25 %	50 %	0 %	25 %	118430847
42	NC_000854	AGCT	2	8	21152	21159	25 %	25 %	25 %	25 %	118430848
43	NC_000854	GAGG	2	8	21506	21513	25 %	0 %	75 %	0 %	118430848
44	NC_000854	TGGC	2	8	23255	23262	0 %	25 %	50 %	25 %	118430849
45	NC_000854	GTGG	2	8	23790	23797	0 %	25 %	75 %	0 %	118430849
46	NC_000854	CCCG	2	8	24778	24785	0 %	0 %	25 %	75 %	118430850
47	NC_000854	TGGC	2	8	24791	24798	0 %	25 %	50 %	25 %	118430850
48	NC_000854	GCTG	2	8	25629	25636	0 %	25 %	50 %	25 %	118430851
49	NC_000854	CTAA	2	8	26030	26037	50 %	25 %	0 %	25 %	118430852
50	NC_000854	TTGC	2	8	26847	26854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_000854	CTAT	2	8	26928	26935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000854	AATA	2	8	26964	26971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000854	GCTG	2	8	27023	27030	0 %	25 %	50 %	25 %	14600404
54	NC_000854	CTGG	2	8	27067	27074	0 %	25 %	50 %	25 %	14600404
55	NC_000854	ATTA	2	8	27213	27220	50 %	50 %	0 %	0 %	14600404
56	NC_000854	AGCC	2	8	27488	27495	25 %	0 %	25 %	50 %	14600404
57	NC_000854	GACC	2	8	28149	28156	25 %	0 %	25 %	50 %	118430853
58	NC_000854	CCTT	2	8	28519	28526	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
59	NC_000854	ATTG	2	8	28802	28809	25 %	50 %	25 %	0 %	118430853
60	NC_000854	AGTG	2	8	30667	30674	25 %	25 %	50 %	0 %	14600407
61	NC_000854	AGAC	2	8	31116	31123	50 %	0 %	25 %	25 %	14600408
62	NC_000854	CCGT	2	8	31678	31685	0 %	25 %	25 %	50 %	118430854
63	NC_000854	CACC	2	8	32776	32783	25 %	0 %	0 %	75 %	118430855
64	NC_000854	CACT	2	8	32892	32899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_000854	CCTT	2	8	33364	33371	0 %	50 %	0 %	50 %	118430856
66	NC_000854	TCCT	2	8	33492	33499	0 %	50 %	0 %	50 %	118430856
67	NC_000854	AATA	2	8	33868	33875	75 %	25 %	0 %	0 %	14600412
68	NC_000854	TTTC	2	8	35753	35760	0 %	75 %	0 %	25 %	118430857
69	NC_000854	TAGC	2	8	36155	36162	25 %	25 %	25 %	25 %	118430858
70	NC_000854	GGAT	2	8	36195	36202	25 %	25 %	50 %	0 %	118430858
71	NC_000854	CCTC	2	8	37155	37162	0 %	25 %	0 %	75 %	118430858
72	NC_000854	TTGG	2	8	37233	37240	0 %	50 %	50 %	0 %	118430858
73	NC_000854	GAAG	2	8	37267	37274	50 %	0 %	50 %	0 %	118430858
74	NC_000854	ATCA	2	8	37323	37330	50 %	25 %	0 %	25 %	118430858
75	NC_000854	TCTA	2	8	38673	38680	25 %	50 %	0 %	25 %	118430858
76	NC_000854	GAAG	2	8	38761	38768	50 %	0 %	50 %	0 %	118430858
77	NC_000854	CAGG	2	8	39628	39635	25 %	0 %	50 %	25 %	118430858
78	NC_000854	ATGC	2	8	39993	40000	25 %	25 %	25 %	25 %	118430858
79	NC_000854	AGGA	2	8	40903	40910	50 %	0 %	50 %	0 %	118430859
80	NC_000854	GTGG	2	8	41002	41009	0 %	25 %	75 %	0 %	118430859
81	NC_000854	AGTG	2	8	41047	41054	25 %	25 %	50 %	0 %	118430859
82	NC_000854	ATAC	2	8	41298	41305	50 %	25 %	0 %	25 %	118430860
83	NC_000854	TGGC	2	8	41451	41458	0 %	25 %	50 %	25 %	118430860
84	NC_000854	AGGC	2	8	42402	42409	25 %	0 %	50 %	25 %	118430860
85	NC_000854	GGAA	2	8	42454	42461	50 %	0 %	50 %	0 %	118430860
86	NC_000854	GCCC	2	8	43272	43279	0 %	0 %	25 %	75 %	14600419
87	NC_000854	TGGC	2	8	43461	43468	0 %	25 %	50 %	25 %	14600419
88	NC_000854	CTTC	2	8	43972	43979	0 %	50 %	0 %	50 %	14600419
89	NC_000854	GGCT	2	8	44283	44290	0 %	25 %	50 %	25 %	14600420
90	NC_000854	GGGA	2	8	44781	44788	25 %	0 %	75 %	0 %	14600420
91	NC_000854	ATGG	2	8	44853	44860	25 %	25 %	50 %	0 %	14600420
92	NC_000854	CGGC	2	8	45800	45807	0 %	0 %	50 %	50 %	118430861
93	NC_000854	GACA	2	8	45938	45945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_000854	CAAG	2	8	46175	46182	50 %	0 %	25 %	25 %	118430862
95	NC_000854	TACA	2	8	46486	46493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_000854	AAAT	2	8	46536	46543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000854	GCTG	2	8	46736	46743	0 %	25 %	50 %	25 %	118430863
98	NC_000854	AATA	2	8	47360	47367	75 %	25 %	0 %	0 %	118430864
99	NC_000854	TGGC	2	8	47614	47621	0 %	25 %	50 %	25 %	118430864
100	NC_000854	TTAG	2	8	47911	47918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000854	CCCT	2	8	47992	47999	0 %	25 %	0 %	75 %	118430865
102	NC_000854	CCAG	2	8	48372	48379	25 %	0 %	25 %	50 %	118430865
103	NC_000854	TCCC	2	8	48568	48575	0 %	25 %	0 %	75 %	118430865
104	NC_000854	CCCT	2	8	48619	48626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_000854	AGGA	2	8	48856	48863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000854	CCTC	2	8	49757	49764	0 %	25 %	0 %	75 %	14600426
107	NC_000854	TGGA	2	8	49860	49867	25 %	25 %	50 %	0 %	14600426
108	NC_000854	TGCA	2	8	51342	51349	25 %	25 %	25 %	25 %	118430866
109	NC_000854	CAGC	2	8	51397	51404	25 %	0 %	25 %	50 %	118430866
110	NC_000854	CATG	2	8	51485	51492	25 %	25 %	25 %	25 %	118430866
111	NC_000854	CCCT	2	8	51663	51670	0 %	25 %	0 %	75 %	118430866
112	NC_000854	CGCC	2	8	52476	52483	0 %	0 %	25 %	75 %	118430867
113	NC_000854	GGCT	2	8	53415	53422	0 %	25 %	50 %	25 %	14600431
114	NC_000854	AGCC	2	8	55019	55026	25 %	0 %	25 %	50 %	118430869
115	NC_000854	GCCC	2	8	55430	55437	0 %	0 %	25 %	75 %	118430869
116	NC_000854	TGAA	2	8	55836	55843	50 %	25 %	25 %	0 %	118430869
117	NC_000854	CTCG	2	8	55889	55896	0 %	25 %	25 %	50 %	118430869
118	NC_000854	GCTC	2	8	57162	57169	0 %	25 %	25 %	50 %	118430870
119	NC_000854	GCCT	2	8	57562	57569	0 %	25 %	25 %	50 %	118430870
120	NC_000854	CCAG	2	8	57982	57989	25 %	0 %	25 %	50 %	118430871
121	NC_000854	TGGG	2	8	58946	58953	0 %	25 %	75 %	0 %	118430872
122	NC_000854	GGCC	2	8	59179	59186	0 %	0 %	50 %	50 %	118430872
123	NC_000854	TACT	2	8	59846	59853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_000854	GAAT	2	8	60648	60655	50 %	25 %	25 %	0 %	118430874
125	NC_000854	GTGA	2	8	60745	60752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000854	GTTT	2	8	60803	60810	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000854	AGGA	2	8	61566	61573	50 %	0 %	50 %	0 %	118430875
128	NC_000854	GAGG	2	8	61682	61689	25 %	0 %	75 %	0 %	118430875
129	NC_000854	AGTT	2	8	62610	62617	25 %	50 %	25 %	0 %	118430876
130	NC_000854	CACG	2	8	62663	62670	25 %	0 %	25 %	50 %	118430876
131	NC_000854	AAGA	2	8	62924	62931	75 %	0 %	25 %	0 %	118430876
132	NC_000854	CTGG	2	8	63167	63174	0 %	25 %	50 %	25 %	118430876
133	NC_000854	CGAG	2	8	63348	63355	25 %	0 %	50 %	25 %	118430876
134	NC_000854	GAGC	2	8	63628	63635	25 %	0 %	50 %	25 %	118430876
135	NC_000854	GCAC	2	8	64057	64064	25 %	0 %	25 %	50 %	14600442
136	NC_000854	CTCG	2	8	64198	64205	0 %	25 %	25 %	50 %	14600442
137	NC_000854	GGGA	2	8	64540	64547	25 %	0 %	75 %	0 %	14600442
138	NC_000854	GGCA	2	8	64746	64753	25 %	0 %	50 %	25 %	14600442
139	NC_000854	TGGA	2	8	64989	64996	25 %	25 %	50 %	0 %	14600442
140	NC_000854	CTAA	2	8	65083	65090	50 %	25 %	0 %	25 %	14600442
141	NC_000854	ACAT	2	8	65480	65487	50 %	25 %	0 %	25 %	14602183
142	NC_000854	TCAT	2	8	66607	66614	25 %	50 %	0 %	25 %	118430877
143	NC_000854	AAAC	2	8	67349	67356	75 %	0 %	0 %	25 %	118430877
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412	NC_000854	GCCA	2	8	201323	201330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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