MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 2451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	ATA	3	9	3	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000854	TAT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000854	TAT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000854	AGA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000854	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000854	TTA	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000854	ATA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000854	GGT	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000854	ATA	2	6	3164	3169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000854	CCA	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_000854	TAT	2	6	3224	3229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000854	ACA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000854	TAA	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000854	AAT	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000854	GAT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000854	TAT	2	6	3415	3420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000854	CCT	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_000854	CAT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000854	GAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000854	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000854	CAA	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000854	ATA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000854	AGT	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000854	CAG	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000854	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000854	GTG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000854	CCG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_000854	ACA	2	6	5639	5644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_000854	GCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000854	CAG	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000854	TGT	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000854	GTT	2	6	6131	6136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000854	GTG	2	6	6148	6153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000854	CTT	2	6	7831	7836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000854	CAT	2	6	7889	7894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000854	TAT	2	6	7915	7920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000854	GTA	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000854	TTA	2	6	9938	9943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000854	TGG	2	6	9980	9985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000854	ACG	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000854	CTC	2	6	11781	11786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_000854	CGG	2	6	11915	11920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000854	ATG	2	6	11923	11928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000854	AGG	2	6	12082	12087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000854	ACT	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000854	GTC	2	6	15332	15337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_000854	ACC	2	6	15915	15920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_000854	GAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000854	AGC	2	6	22418	22423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_000854	TGG	2	6	22496	22501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000854	GAA	2	6	26949	26954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000854	GAA	2	6	31303	31308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000854	CCA	2	6	33594	33599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_000854	ATA	2	6	33624	33629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000854	TAA	2	6	33640	33645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000854	AGG	2	6	34978	34983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000854	AAT	2	6	41133	41138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000854	AAG	2	6	41165	41170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000854	TGG	2	6	45023	45028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000854	CTA	2	6	45869	45874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_000854	CTA	2	6	46529	46534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_000854	ATC	2	6	47116	47121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000854	GGT	2	6	47702	47707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000854	CTT	2	6	47857	47862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_000854	TGC	2	6	47891	47896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_000854	CTC	2	6	48648	48653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_000854	TAA	2	6	48734	48739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000854	CCT	2	6	48881	48886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_000854	ATA	2	6	49066	49071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000854	GTG	2	6	49225	49230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000854	GCA	2	6	53120	53125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_000854	TAA	2	6	53227	53232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000854	TAG	2	6	53242	53247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000854	GTG	2	6	54037	54042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000854	ATA	2	6	57778	57783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000854	ACC	2	6	58542	58547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_000854	ACC	2	6	59274	59279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_000854	GCA	2	6	59315	59320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_000854	GGT	2	6	59898	59903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000854	TCC	2	6	61847	61852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_000854	TCA	2	6	61863	61868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000854	CAG	2	6	61875	61880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_000854	CTC	2	6	61946	61951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_000854	TTA	2	6	61979	61984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000854	GTC	2	6	62004	62009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_000854	TAT	2	6	62041	62046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000854	TGG	2	6	62051	62056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000854	GAA	2	6	62139	62144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000854	TTC	2	6	62300	62305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_000854	ATC	2	6	62335	62340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_000854	CGT	2	6	62364	62369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_000854	GGT	2	6	62534	62539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000854	TCC	2	6	66555	66560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_000854	TAC	2	6	67719	67724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_000854	ATT	2	6	67771	67776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000854	GCT	2	6	67794	67799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_000854	TAA	2	6	67828	67833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000854	TCA	2	6	69170	69175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_000854	CGG	2	6	69224	69229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000854	GAG	2	6	72137	72142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000854	GTA	2	6	72265	72270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000854	CCT	2	6	72299	72304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_000854	TTA	2	6	72483	72488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000854	TAT	2	6	72489	72494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000854	TCC	2	6	72548	72553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_000854	AGG	2	6	72642	72647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000854	TGG	2	6	72689	72694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000854	CTT	2	6	72711	72716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_000854	TGG	2	6	72719	72724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000854	TAG	2	6	76098	76103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000854	GCT	2	6	76114	76119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_000854	CAA	2	6	76126	76131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_000854	TGA	2	6	77289	77294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000854	GGA	2	6	77736	77741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000854	AGG	2	6	84697	84702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000854	TTA	2	6	84978	84983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000854	AAT	2	6	86105	86110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000854	TGC	2	6	87397	87402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_000854	TGT	2	6	87512	87517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000854	TCC	2	6	88810	88815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_000854	ATA	2	6	88840	88845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000854	TGG	2	6	90707	90712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000854	TAC	2	6	92298	92303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_000854	TAA	2	6	92372	92377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000854	GTG	2	6	92385	92390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000854	CCA	2	6	98761	98766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_000854	CTA	2	6	98770	98775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_000854	TAA	2	6	99188	99193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000854	CTA	2	6	99250	99255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_000854	TGG	2	6	99259	99264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000854	AGG	2	6	101033	101038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000854	GCG	2	6	101043	101048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_000854	GAA	2	6	102300	102305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000854	CCT	2	6	103896	103901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_000854	TGC	2	6	103936	103941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_000854	AAC	2	6	104852	104857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_000854	CCT	2	6	104862	104867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_000854	GGA	2	6	104878	104883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000854	TGA	2	6	106105	106110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_000854	ATA	2	6	107013	107018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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