MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 1323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	AAACT	2	10	1240	1249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_000853	GAAAC	2	10	1304	1313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_000853	GCCTC	2	10	1523	1532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_000853	TTCTC	2	10	2535	2544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_000853	TTTTC	2	10	3254	3263	0 %	80 %	0 %	20 %	15642780
6	NC_000853	TCCCT	2	10	3363	3372	0 %	40 %	0 %	60 %	15642780
7	NC_000853	GAGAA	2	10	3779	3788	60 %	0 %	40 %	0 %	15642780
8	NC_000853	TCATC	2	10	5020	5029	20 %	40 %	0 %	40 %	15642780
9	NC_000853	ATCTC	2	10	5756	5765	20 %	40 %	0 %	40 %	15642781
10	NC_000853	TTATC	2	10	7507	7516	20 %	60 %	0 %	20 %	15642783
11	NC_000853	CTCTT	2	10	8868	8877	0 %	60 %	0 %	40 %	15642785
12	NC_000853	TTGCC	2	10	9905	9914	0 %	40 %	20 %	40 %	15642785
13	NC_000853	CCTTC	2	10	10193	10202	0 %	40 %	0 %	60 %	15642785
14	NC_000853	AAAAG	2	10	11454	11463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000853	TGGGA	2	10	11599	11608	20 %	20 %	60 %	0 %	15642788
16	NC_000853	AGATC	2	10	12602	12611	40 %	20 %	20 %	20 %	15642789
17	NC_000853	ATTTA	2	10	13149	13158	40 %	60 %	0 %	0 %	15642789
18	NC_000853	AGAGA	2	10	13715	13724	60 %	0 %	40 %	0 %	15642790
19	NC_000853	AGAGA	2	10	16476	16485	60 %	0 %	40 %	0 %	15642794
20	NC_000853	TCACC	2	10	19274	19283	20 %	20 %	0 %	60 %	15642797
21	NC_000853	TCTGC	2	10	19943	19952	0 %	40 %	20 %	40 %	15642798
22	NC_000853	GTTTT	2	10	20998	21007	0 %	80 %	20 %	0 %	15642798
23	NC_000853	CTCAT	2	10	21094	21103	20 %	40 %	0 %	40 %	15642798
24	NC_000853	CCACT	2	10	22206	22215	20 %	20 %	0 %	60 %	15642799
25	NC_000853	TTCTT	2	10	22572	22581	0 %	80 %	0 %	20 %	15642799
26	NC_000853	TCTCT	2	10	23412	23421	0 %	60 %	0 %	40 %	15642800
27	NC_000853	GTTTT	2	10	23585	23594	0 %	80 %	20 %	0 %	15642800
28	NC_000853	GCCAC	2	10	25672	25681	20 %	0 %	20 %	60 %	15642801
29	NC_000853	TTTTC	2	10	27275	27284	0 %	80 %	0 %	20 %	15642803
30	NC_000853	CCTCA	2	10	29779	29788	20 %	20 %	0 %	60 %	15642806
31	NC_000853	AGGAA	2	10	30822	30831	60 %	0 %	40 %	0 %	15642806
32	NC_000853	GAATC	2	10	33658	33667	40 %	20 %	20 %	20 %	15642808
33	NC_000853	ATCGT	2	10	37873	37882	20 %	40 %	20 %	20 %	15642812
34	NC_000853	GCTTG	2	10	41796	41805	0 %	40 %	40 %	20 %	15642817
35	NC_000853	CTGTC	2	10	42162	42171	0 %	40 %	20 %	40 %	15642818
36	NC_000853	GAAAG	2	10	43515	43524	60 %	0 %	40 %	0 %	15642818
37	NC_000853	TTTTG	2	10	44413	44422	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000853	GGGAT	2	10	44768	44777	20 %	20 %	60 %	0 %	15642821
39	NC_000853	GAATC	2	10	47501	47510	40 %	20 %	20 %	20 %	15642825
40	NC_000853	CAGAG	2	10	47934	47943	40 %	0 %	40 %	20 %	15642826
41	NC_000853	AAAGA	2	10	48119	48128	80 %	0 %	20 %	0 %	15642826
42	NC_000853	TTGTT	2	10	49787	49796	0 %	80 %	20 %	0 %	15642827
43	NC_000853	ATGGT	2	10	50875	50884	20 %	40 %	40 %	0 %	15642828
44	NC_000853	AAAAG	2	10	50952	50961	80 %	0 %	20 %	0 %	15642828
45	NC_000853	ATTTG	2	10	52518	52527	20 %	60 %	20 %	0 %	15642830
46	NC_000853	GGCAT	2	10	53741	53750	20 %	20 %	40 %	20 %	15642831
47	NC_000853	CTGTT	2	10	54865	54874	0 %	60 %	20 %	20 %	15642831
48	NC_000853	ACTTT	2	10	56742	56751	20 %	60 %	0 %	20 %	15642833
49	NC_000853	TCACA	2	10	56787	56796	40 %	20 %	0 %	40 %	15642833
50	NC_000853	GTCTT	2	10	58512	58521	0 %	60 %	20 %	20 %	15642834
51	NC_000853	ATGGG	2	10	60428	60437	20 %	20 %	60 %	0 %	15642836
52	NC_000853	TCACA	2	10	61955	61964	40 %	20 %	0 %	40 %	15642836
53	NC_000853	GCTGT	2	10	62499	62508	0 %	40 %	40 %	20 %	15642836
54	NC_000853	GTCCG	2	10	64855	64864	0 %	20 %	40 %	40 %	15642839
55	NC_000853	GAGCA	2	10	66222	66231	40 %	0 %	40 %	20 %	15642840
56	NC_000853	ATGGT	2	10	69962	69971	20 %	40 %	40 %	0 %	15642844
57	NC_000853	AGAGA	2	10	72955	72964	60 %	0 %	40 %	0 %	15642846
58	NC_000853	TCCAT	2	10	73850	73859	20 %	40 %	0 %	40 %	15642846
59	NC_000853	GGACA	2	10	75470	75479	40 %	0 %	40 %	20 %	15642848
60	NC_000853	TGTCA	2	10	75517	75526	20 %	40 %	20 %	20 %	15642848
61	NC_000853	CTTCT	2	10	77657	77666	0 %	60 %	0 %	40 %	15642850
62	NC_000853	GTGAG	2	10	79356	79365	20 %	20 %	60 %	0 %	15642851
63	NC_000853	AAAAG	2	10	82478	82487	80 %	0 %	20 %	0 %	15642854
64	NC_000853	AGTAA	2	10	82581	82590	60 %	20 %	20 %	0 %	15642854
65	NC_000853	GAGAT	2	10	83543	83552	40 %	20 %	40 %	0 %	15642855
66	NC_000853	TGAAG	2	10	87952	87961	40 %	20 %	40 %	0 %	15642858
67	NC_000853	GATTG	2	10	89957	89966	20 %	40 %	40 %	0 %	15642861
68	NC_000853	CTTTC	2	10	92399	92408	0 %	60 %	0 %	40 %	15642863
69	NC_000853	TCTTT	2	10	92420	92429	0 %	80 %	0 %	20 %	15642863
70	NC_000853	TCCTC	2	10	93398	93407	0 %	40 %	0 %	60 %	15642863
71	NC_000853	AAAAT	2	10	97031	97040	80 %	20 %	0 %	0 %	15642867
72	NC_000853	TTTTC	2	10	97694	97703	0 %	80 %	0 %	20 %	15642868
73	NC_000853	CTATT	2	10	101063	101072	20 %	60 %	0 %	20 %	15642872
74	NC_000853	CTTTT	2	10	102468	102477	0 %	80 %	0 %	20 %	15642874
75	NC_000853	AAGGA	2	10	108541	108550	60 %	0 %	40 %	0 %	15642878
76	NC_000853	ACCAC	2	10	108902	108911	40 %	0 %	0 %	60 %	15642878
77	NC_000853	TCGAA	2	10	111164	111173	40 %	20 %	20 %	20 %	15642880
78	NC_000853	CTCTT	2	10	112398	112407	0 %	60 %	0 %	40 %	15642881
79	NC_000853	CACAC	2	10	115161	115170	40 %	0 %	0 %	60 %	15642884
80	NC_000853	CTTTC	2	10	115496	115505	0 %	60 %	0 %	40 %	15642884
81	NC_000853	AGACC	2	10	117576	117585	40 %	0 %	20 %	40 %	15642886
82	NC_000853	GGAAG	2	10	117934	117943	40 %	0 %	60 %	0 %	15642886
83	NC_000853	TAACC	2	10	118131	118140	40 %	20 %	0 %	40 %	15642886
84	NC_000853	AAAAG	2	10	119814	119823	80 %	0 %	20 %	0 %	15642888
85	NC_000853	AGACC	2	10	121685	121694	40 %	0 %	20 %	40 %	15642890
86	NC_000853	GGTGA	2	10	122958	122967	20 %	20 %	60 %	0 %	15642891
87	NC_000853	ATGGA	2	10	123018	123027	40 %	20 %	40 %	0 %	15642891
88	NC_000853	GTTTC	2	10	124509	124518	0 %	60 %	20 %	20 %	15642892
89	NC_000853	GAAAA	2	10	126147	126156	80 %	0 %	20 %	0 %	15642893
90	NC_000853	CTTTC	2	10	130362	130371	0 %	60 %	0 %	40 %	15642897
91	NC_000853	TGAAA	2	10	131284	131293	60 %	20 %	20 %	0 %	15642898
92	NC_000853	TCGTT	2	10	134574	134583	0 %	60 %	20 %	20 %	15642903
93	NC_000853	AGATC	2	10	137200	137209	40 %	20 %	20 %	20 %	15642905
94	NC_000853	AGAAA	2	10	139170	139179	80 %	0 %	20 %	0 %	15642907
95	NC_000853	TGGTC	2	10	140681	140690	0 %	40 %	40 %	20 %	15642909
96	NC_000853	CAGGT	2	10	143193	143202	20 %	20 %	40 %	20 %	15642911
97	NC_000853	TTTTC	2	10	143248	143257	0 %	80 %	0 %	20 %	15642911
98	NC_000853	AGTCC	2	10	143803	143812	20 %	20 %	20 %	40 %	15642912
99	NC_000853	GAGAA	2	10	143903	143912	60 %	0 %	40 %	0 %	15642912
100	NC_000853	TCTGC	2	10	145652	145661	0 %	40 %	20 %	40 %	15642914
101	NC_000853	CGGAA	2	10	147771	147780	40 %	0 %	40 %	20 %	15642915
102	NC_000853	GAGAG	2	10	148833	148842	40 %	0 %	60 %	0 %	15642916
103	NC_000853	TTTTC	2	10	151893	151902	0 %	80 %	0 %	20 %	15642920
104	NC_000853	CAGTG	2	10	153833	153842	20 %	20 %	40 %	20 %	15642922
105	NC_000853	CCTTC	2	10	155120	155129	0 %	40 %	0 %	60 %	15642922
106	NC_000853	TTTGC	2	10	157333	157342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_000853	CTGGT	2	10	158468	158477	0 %	40 %	40 %	20 %	15642927
108	NC_000853	GTGTT	2	10	160586	160595	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000853	GAAAA	2	10	160939	160948	80 %	0 %	20 %	0 %	15642929
110	NC_000853	GGACA	2	10	161007	161016	40 %	0 %	40 %	20 %	15642929
111	NC_000853	CTGTC	2	10	163608	163617	0 %	40 %	20 %	40 %	15642931
112	NC_000853	TCCTC	2	10	166249	166258	0 %	40 %	0 %	60 %	15642935
113	NC_000853	GAAAG	2	10	166669	166678	60 %	0 %	40 %	0 %	15642935
114	NC_000853	CTTCT	2	10	167904	167913	0 %	60 %	0 %	40 %	15642936
115	NC_000853	CGGAA	2	10	168144	168153	40 %	0 %	40 %	20 %	15642936
116	NC_000853	GTTTC	2	10	168197	168206	0 %	60 %	20 %	20 %	15642936
117	NC_000853	CTTTC	2	10	173261	173270	0 %	60 %	0 %	40 %	15642941
118	NC_000853	GATGA	2	10	175753	175762	40 %	20 %	40 %	0 %	15642942
119	NC_000853	CGCAC	2	10	176166	176175	20 %	0 %	20 %	60 %	15642942
120	NC_000853	ACGGG	2	10	178288	178297	20 %	0 %	60 %	20 %	15642946
121	NC_000853	AAGGA	2	10	179320	179329	60 %	0 %	40 %	0 %	15642947
122	NC_000853	CTTTT	2	10	182296	182305	0 %	80 %	0 %	20 %	15642948
123	NC_000853	CTATC	2	10	183144	183153	20 %	40 %	0 %	40 %	15642948
124	NC_000853	CGGAG	2	10	184167	184176	20 %	0 %	60 %	20 %	15642948
125	NC_000853	GATTC	2	10	184623	184632	20 %	40 %	20 %	20 %	15642949
126	NC_000853	TTCAA	2	10	187067	187076	40 %	40 %	0 %	20 %	15642952
127	NC_000853	AGGAA	2	10	187309	187318	60 %	0 %	40 %	0 %	15642952
128	NC_000853	GAAGA	2	10	187762	187771	60 %	0 %	40 %	0 %	15642952
129	NC_000853	CTTCG	2	10	188279	188288	0 %	40 %	20 %	40 %	15642952
130	NC_000853	AGGGG	2	10	192728	192737	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000853	CATCC	2	10	193398	193407	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_000853	CAAGA	2	10	194108	194117	60 %	0 %	20 %	20 %	15642953
133	NC_000853	TTTGC	2	10	195507	195516	0 %	60 %	20 %	20 %	15642955
134	NC_000853	AAAGA	2	10	195649	195658	80 %	0 %	20 %	0 %	15642955
135	NC_000853	GGAGA	2	10	196206	196215	40 %	0 %	60 %	0 %	15642956
136	NC_000853	AGAGA	2	10	198221	198230	60 %	0 %	40 %	0 %	15642958
137	NC_000853	CCCAT	2	10	199810	199819	20 %	20 %	0 %	60 %	15642960
138	NC_000853	TTTTC	2	10	200779	200788	0 %	80 %	0 %	20 %	15644622
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400	NC_000853	ATGGG	2	10	568528	568537	20 %	20 %	60 %	0 %	15643309
401	NC_000853	GCTTC	2	10	572439	572448	0 %	40 %	20 %	40 %	15643313
402	NC_000853	GAGAT	2	10	574062	574071	40 %	20 %	40 %	0 %	15643313
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