MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	AAACT	2	10	1240	1249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_000853	GAAAC	2	10	1304	1313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_000853	GCCTC	2	10	1523	1532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_000853	TTCTC	2	10	2535	2544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_000853	AAAAG	2	10	11454	11463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000853	TTTTG	2	10	44413	44422	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000853	TTTGC	2	10	157333	157342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_000853	GTGTT	2	10	160586	160595	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000853	AGGGG	2	10	192728	192737	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000853	CATCC	2	10	193398	193407	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_000853	TTTAC	2	10	257539	257548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_000853	CGAAT	2	10	266857	266866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_000853	GATAT	2	10	291410	291419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000853	CCCCT	2	10	307964	307973	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
15	NC_000853	CTCTT	2	10	318032	318041	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_000853	TTTCT	2	10	331305	331314	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_000853	TTCCT	2	10	355106	355115	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_000853	CATTT	2	10	392101	392110	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_000853	CTTTG	2	10	395988	395997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_000853	ATGTT	2	10	396027	396036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000853	TTCTT	2	10	396405	396414	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_000853	ACAAG	2	10	409286	409295	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_000853	CGATG	2	10	410726	410735	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000853	TGCAT	2	10	419247	419256	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_000853	ATAAA	2	10	435640	435649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000853	GCCTT	2	10	442119	442128	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_000853	TGTTT	2	10	452287	452296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000853	GGAAA	2	10	474185	474194	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000853	AAAGT	2	10	519701	519710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000853	TCCCC	2	10	556930	556939	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_000853	TGTCT	2	10	560744	560753	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_000853	ACTTC	2	10	593624	593633	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_000853	CATAC	2	10	600213	600222	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_000853	AAAAG	2	10	629270	629279	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000853	TGTTT	2	10	645580	645589	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000853	GAAAA	2	10	689439	689448	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000853	GCCCC	2	10	716269	716278	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_000853	TGATA	2	10	726165	726174	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000853	AAAAG	2	10	774422	774431	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000853	ACAGA	2	10	830401	830410	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_000853	AACAG	2	10	846393	846402	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_000853	ATAGA	2	10	887095	887104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000853	CTGGT	2	10	896487	896496	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_000853	AGGTG	2	10	897369	897378	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000853	ACCCC	2	10	945683	945692	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_000853	CCTTC	2	10	948909	948918	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_000853	TTCAT	2	10	958922	958931	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_000853	CAAAA	2	10	966158	966167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_000853	TAAAT	2	10	984277	984286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000853	TGGTC	2	10	988174	988183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_000853	ATCAG	2	10	990157	990166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_000853	GAAGA	2	10	1018865	1018874	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000853	ATAAC	2	10	1019783	1019792	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000853	CTTTT	2	10	1025544	1025553	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_000853	TATCA	2	10	1028322	1028331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_000853	ATTTT	2	10	1046178	1046187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000853	AATAT	2	10	1083489	1083498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000853	AATCT	2	10	1138231	1138240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_000853	GAGGG	2	10	1148053	1148062	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000853	AGAGG	2	10	1184867	1184876	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000853	ACCTT	2	10	1218862	1218871	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_000853	AAAAG	2	10	1221934	1221943	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000853	TTGTG	2	10	1230570	1230579	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000853	CCCCG	2	10	1245985	1245994	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_000853	AAGTC	2	10	1253746	1253755	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_000853	TTACT	2	10	1309391	1309400	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_000853	GAGAA	2	10	1324812	1324821	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000853	AAAGA	2	10	1349958	1349967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000853	ACCTC	2	10	1359417	1359426	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_000853	GCTTT	2	10	1428787	1428796	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_000853	CAGAA	2	10	1433164	1433173	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_000853	CGATC	2	10	1433639	1433648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_000853	TGTAA	2	10	1435342	1435351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000853	GAAAA	2	10	1443396	1443405	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000853	TTCTT	2	10	1519749	1519758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_000853	CTTTT	2	10	1540367	1540376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_000853	TACTT	2	10	1562548	1562557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_000853	AAAGG	2	10	1580306	1580315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000853	ATATA	2	10	1580323	1580332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000853	AAGTC	2	10	1662832	1662841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_000853	TCTTT	2	10	1689941	1689950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_000853	TTCGC	2	10	1689987	1689996	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_000853	CATAA	2	10	1721869	1721878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_000853	GAGGT	2	10	1738662	1738671	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000853	CTTCG	2	10	1762929	1762938	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_000853	GAAGA	2	10	1780320	1780329	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000853	AAAAG	2	10	1804130	1804139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000853	ATTAT	2	10	1806967	1806976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000853	GTCCT	2	10	1812611	1812620	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_000853	TAACA	2	10	1831820	1831829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.