MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 26517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	AAT	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000853	GAT	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000853	TAG	2	6	110	115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000853	CTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_000853	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_000853	GTT	2	6	256	261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000853	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000853	CTG	2	6	525	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
9	NC_000853	TCG	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
10	NC_000853	ATT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000853	GGT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000853	TTA	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000853	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000853	TCA	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_000853	TCT	3	9	1387	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_000853	CTA	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_000853	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000853	GGA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642778
19	NC_000853	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
20	NC_000853	TCT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642778
21	NC_000853	AAT	2	6	1885	1890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
22	NC_000853	AAT	2	6	1951	1956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
23	NC_000853	AAT	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
24	NC_000853	AGT	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000853	ACG	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000853	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000853	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000853	TGA	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000853	AAT	2	6	2219	2224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000853	AAT	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000853	AAT	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000853	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000853	TCC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_000853	AAT	2	6	2485	2490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000853	AAT	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000853	ACC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_000853	AAT	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000853	CCT	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_000853	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000853	GAT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000853	AAT	2	6	2951	2956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000853	GAC	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000853	TGT	3	9	3004	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000853	CTT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
45	NC_000853	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
46	NC_000853	TCT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
47	NC_000853	GAT	3	9	3344	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
48	NC_000853	ATC	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
49	NC_000853	TGA	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
50	NC_000853	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
51	NC_000853	ACA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
52	NC_000853	CGT	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
53	NC_000853	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
54	NC_000853	TTC	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
55	NC_000853	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
56	NC_000853	CAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
57	NC_000853	TAT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642780
58	NC_000853	TTC	2	6	4176	4181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
59	NC_000853	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
60	NC_000853	TTC	2	6	4277	4282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
61	NC_000853	TCT	2	6	4288	4293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
62	NC_000853	CTT	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
63	NC_000853	GAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642780
64	NC_000853	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
65	NC_000853	TCT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
66	NC_000853	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
67	NC_000853	TCT	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
68	NC_000853	TTC	3	9	4909	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
69	NC_000853	TTC	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
70	NC_000853	TCC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
71	NC_000853	CTT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
72	NC_000853	CTG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
73	NC_000853	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
74	NC_000853	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
75	NC_000853	TCA	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
76	NC_000853	CCG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642781
77	NC_000853	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
78	NC_000853	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642781
79	NC_000853	CCT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
80	NC_000853	TCT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
81	NC_000853	CCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
82	NC_000853	TCC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
83	NC_000853	GCT	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642781
84	NC_000853	ATC	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
85	NC_000853	AAG	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642781
86	NC_000853	AGG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642781
87	NC_000853	CCT	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642782
88	NC_000853	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642782
89	NC_000853	CGT	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642782
90	NC_000853	CCA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
91	NC_000853	GAG	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
92	NC_000853	GTT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642782
93	NC_000853	CAC	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
94	NC_000853	CAC	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
95	NC_000853	ACC	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
96	NC_000853	CTT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
97	NC_000853	GTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642782
98	NC_000853	GGA	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
99	NC_000853	TTC	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
100	NC_000853	CTT	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
101	NC_000853	GAA	2	6	7144	7149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642782
102	NC_000853	ACG	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642782
103	NC_000853	CTT	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
104	NC_000853	GAG	2	6	7297	7302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
105	NC_000853	TCT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
106	NC_000853	CCT	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_000853	AGA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
108	NC_000853	CGC	2	6	7596	7601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642783
109	NC_000853	GAT	3	9	7608	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642783
110	NC_000853	TCA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642783
111	NC_000853	GAA	2	6	7743	7748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
112	NC_000853	GAA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
113	NC_000853	TCT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642783
114	NC_000853	GAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
115	NC_000853	GAA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
116	NC_000853	CAG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642783
117	NC_000853	ATC	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642783
118	NC_000853	AGA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
119	NC_000853	CGG	2	6	8192	8197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_000853	GAT	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
121	NC_000853	ATC	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642784
122	NC_000853	TTC	2	6	8376	8381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642784
123	NC_000853	GTA	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
124	NC_000853	AGA	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642784
125	NC_000853	CCT	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
126	NC_000853	CTT	2	6	8852	8857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
127	NC_000853	TCC	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
128	NC_000853	TCT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
129	NC_000853	TCT	2	6	9055	9060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
130	NC_000853	TTC	2	6	9098	9103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
131	NC_000853	GAA	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642785
132	NC_000853	GTC	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642785
133	NC_000853	CCA	2	6	9171	9176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642785
134	NC_000853	TCC	3	9	9305	9313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
135	NC_000853	TTC	2	6	9372	9377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
136	NC_000853	TGA	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642785
137	NC_000853	GTT	2	6	9491	9496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642785
138	NC_000853	CAC	2	6	9601	9606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642785
139	NC_000853	TCC	2	6	9671	9676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
140	NC_000853	GGC	2	6	9785	9790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642785
141	NC_000853	TCT	2	6	9892	9897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
142	NC_000853	CTC	3	9	9949	9957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
143	NC_000853	CTC	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
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163	NC_000853	CCT	2	6	11352	11357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642787
164	NC_000853	ATG	2	6	11448	11453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_000853	GAT	2	6	12081	12086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642788
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169	NC_000853	TGG	2	6	12493	12498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642789
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178	NC_000853	TGT	2	6	13222	13227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_000853	TTC	2	6	18549	18554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642797
266	NC_000853	CTG	2	6	18598	18603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642797
267	NC_000853	CGT	2	6	18782	18787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642797
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