MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 2872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000117	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000117	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000117	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000117	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	15604719
5	NC_000117	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	15604720
6	NC_000117	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	15604720
7	NC_000117	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	15604721
8	NC_000117	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	15604721
9	NC_000117	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	15604721
10	NC_000117	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	15604722
11	NC_000117	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	15604722
12	NC_000117	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	15604722
13	NC_000117	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	15604722
14	NC_000117	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	15604723
15	NC_000117	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	15604723
16	NC_000117	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	15604723
17	NC_000117	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000117	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	15604724
19	NC_000117	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	15604724
20	NC_000117	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000117	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000117	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000117	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	15604725
24	NC_000117	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	15604726
25	NC_000117	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	15604726
26	NC_000117	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	15604726
27	NC_000117	CTTT	2	8	9047	9054	0 %	75 %	0 %	25 %	15604726
28	NC_000117	TATT	2	8	9310	9317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000117	TTCG	2	8	9419	9426	0 %	50 %	25 %	25 %	15604727
30	NC_000117	AATT	2	8	9524	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	15604727
31	NC_000117	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	15604727
32	NC_000117	CTTT	2	8	10208	10215	0 %	75 %	0 %	25 %	15604728
33	NC_000117	GCAA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	25 %	25 %	15604728
34	NC_000117	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	15604728
35	NC_000117	GAAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	15604728
36	NC_000117	AGAA	2	8	11202	11209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000117	AATG	2	8	11541	11548	50 %	25 %	25 %	0 %	15604729
38	NC_000117	ATTT	2	8	12318	12325	25 %	75 %	0 %	0 %	15604729
39	NC_000117	GTTT	2	8	12573	12580	0 %	75 %	25 %	0 %	15604730
40	NC_000117	ATGC	2	8	13003	13010	25 %	25 %	25 %	25 %	15604730
41	NC_000117	AAGG	2	8	13438	13445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000117	TTGT	2	8	14039	14046	0 %	75 %	25 %	0 %	15604731
43	NC_000117	ATTT	2	8	14416	14423	25 %	75 %	0 %	0 %	15604731
44	NC_000117	TTTC	2	8	15078	15085	0 %	75 %	0 %	25 %	15604732
45	NC_000117	AAAT	2	8	15560	15567	75 %	25 %	0 %	0 %	15604732
46	NC_000117	CAAA	2	8	16072	16079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000117	GTAA	2	8	16402	16409	50 %	25 %	25 %	0 %	15604733
48	NC_000117	CTAA	2	8	16595	16602	50 %	25 %	0 %	25 %	15604733
49	NC_000117	AGAA	2	8	16858	16865	75 %	0 %	25 %	0 %	15604733
50	NC_000117	ATTT	2	8	17004	17011	25 %	75 %	0 %	0 %	15604733
51	NC_000117	TGCG	2	8	18526	18533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000117	CTTT	2	8	18565	18572	0 %	75 %	0 %	25 %	15604735
53	NC_000117	GAAG	2	8	19510	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	15604735
54	NC_000117	TTTG	2	8	19536	19543	0 %	75 %	25 %	0 %	15604735
55	NC_000117	TGTA	2	8	20228	20235	25 %	50 %	25 %	0 %	15604736
56	NC_000117	CGCT	2	8	21268	21275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000117	TTAA	2	8	21289	21296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000117	GTTA	2	8	21326	21333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000117	GATC	2	8	21381	21388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_000117	GATG	2	8	21644	21651	25 %	25 %	50 %	0 %	15604737
61	NC_000117	CATT	2	8	22703	22710	25 %	50 %	0 %	25 %	15604737
62	NC_000117	GCTT	2	8	23046	23053	0 %	50 %	25 %	25 %	15604737
63	NC_000117	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	15604737
64	NC_000117	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	15604737
65	NC_000117	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	15604737
66	NC_000117	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	15604737
67	NC_000117	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	15604737
68	NC_000117	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	15604738
69	NC_000117	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	15604738
70	NC_000117	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	15604738
71	NC_000117	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	15604738
72	NC_000117	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	15604738
73	NC_000117	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	15604739
74	NC_000117	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	15604739
75	NC_000117	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	15604739
76	NC_000117	GGGC	2	8	27274	27281	0 %	0 %	75 %	25 %	15604739
77	NC_000117	GTTT	2	8	27557	27564	0 %	75 %	25 %	0 %	15604740
78	NC_000117	CAGA	2	8	27579	27586	50 %	0 %	25 %	25 %	15604740
79	NC_000117	ATTG	2	8	27938	27945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000117	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	15604742
81	NC_000117	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	15604742
82	NC_000117	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	15604742
83	NC_000117	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	15604742
84	NC_000117	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	15604743
85	NC_000117	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	15604743
86	NC_000117	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	15604743
87	NC_000117	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	15604745
88	NC_000117	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	15604748
89	NC_000117	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	15604748
90	NC_000117	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	15604749
91	NC_000117	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	15604749
92	NC_000117	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	15604750
93	NC_000117	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	15604750
94	NC_000117	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	15604750
95	NC_000117	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	15604750
96	NC_000117	TTGG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	50 %	0 %	15604750
97	NC_000117	AGAT	2	8	36263	36270	50 %	25 %	25 %	0 %	15604750
98	NC_000117	CTTT	2	8	36636	36643	0 %	75 %	0 %	25 %	15604751
99	NC_000117	ATGA	2	8	37126	37133	50 %	25 %	25 %	0 %	15604751
100	NC_000117	TAGG	2	8	37285	37292	25 %	25 %	50 %	0 %	15604751
101	NC_000117	CAAT	2	8	37469	37476	50 %	25 %	0 %	25 %	15604751
102	NC_000117	AATG	2	8	38256	38263	50 %	25 %	25 %	0 %	15604751
103	NC_000117	AGAA	2	8	39093	39100	75 %	0 %	25 %	0 %	15604752
104	NC_000117	AAGA	2	8	39145	39152	75 %	0 %	25 %	0 %	15604752
105	NC_000117	ATCC	2	8	39153	39160	25 %	25 %	0 %	50 %	15604752
106	NC_000117	TAAT	2	8	39364	39371	50 %	50 %	0 %	0 %	15604752
107	NC_000117	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	15604754
108	NC_000117	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	15604754
109	NC_000117	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	15604754
110	NC_000117	AAAC	2	8	43233	43240	75 %	0 %	0 %	25 %	15604757
111	NC_000117	CAAT	2	8	43437	43444	50 %	25 %	0 %	25 %	15604757
112	NC_000117	TGTT	2	8	43817	43824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000117	AATA	2	8	44056	44063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000117	ATTT	2	8	44194	44201	25 %	75 %	0 %	0 %	15604759
115	NC_000117	GCTC	2	8	44502	44509	0 %	25 %	25 %	50 %	15604759
116	NC_000117	TTCT	2	8	44644	44651	0 %	75 %	0 %	25 %	15604759
117	NC_000117	TTGA	2	8	45244	45251	25 %	50 %	25 %	0 %	15604760
118	NC_000117	TGTT	2	8	45416	45423	0 %	75 %	25 %	0 %	15604760
119	NC_000117	CTAT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	0 %	25 %	15604760
120	NC_000117	TGTT	2	8	45475	45482	0 %	75 %	25 %	0 %	15604760
121	NC_000117	CTAT	2	8	45771	45778	25 %	50 %	0 %	25 %	15604760
122	NC_000117	AAGA	2	8	46266	46273	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
123	NC_000117	AAGA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
124	NC_000117	AAAG	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
125	NC_000117	AAGA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
126	NC_000117	ACTT	2	8	46739	46746	25 %	50 %	0 %	25 %	15604761
127	NC_000117	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	15604761
128	NC_000117	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	15604761
129	NC_000117	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	15604761
130	NC_000117	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000117	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	15604762
132	NC_000117	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	15604763
133	NC_000117	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	15604763
134	NC_000117	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	15604764
135	NC_000117	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	15604764
136	NC_000117	TATT	2	8	52180	52187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000117	GGAA	2	8	52411	52418	50 %	0 %	50 %	0 %	15604766
138	NC_000117	TTAA	2	8	53152	53159	50 %	50 %	0 %	0 %	15604766
139	NC_000117	CCTT	2	8	53359	53366	0 %	50 %	0 %	50 %	15604767
140	NC_000117	TTTA	2	8	53526	53533	25 %	75 %	0 %	0 %	15604767
141	NC_000117	AAAG	2	8	53750	53757	75 %	0 %	25 %	0 %	15604767
142	NC_000117	GATT	2	8	53887	53894	25 %	50 %	25 %	0 %	15604767
143	NC_000117	AATC	2	8	53942	53949	50 %	25 %	0 %	25 %	15604767
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145	NC_000117	GTTT	2	8	54040	54047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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