MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 2522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000117	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	15604719
2	NC_000117	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	15604720
3	NC_000117	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	15604720
4	NC_000117	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	15604721
5	NC_000117	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	15604721
6	NC_000117	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	15604721
7	NC_000117	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	15604722
8	NC_000117	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	15604722
9	NC_000117	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	15604722
10	NC_000117	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	15604722
11	NC_000117	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	15604723
12	NC_000117	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	15604723
13	NC_000117	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	15604723
14	NC_000117	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	15604724
15	NC_000117	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	15604724
16	NC_000117	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	15604725
17	NC_000117	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	15604726
18	NC_000117	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	15604726
19	NC_000117	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	15604726
20	NC_000117	CTTT	2	8	9047	9054	0 %	75 %	0 %	25 %	15604726
21	NC_000117	TTCG	2	8	9419	9426	0 %	50 %	25 %	25 %	15604727
22	NC_000117	AATT	2	8	9524	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	15604727
23	NC_000117	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	15604727
24	NC_000117	CTTT	2	8	10208	10215	0 %	75 %	0 %	25 %	15604728
25	NC_000117	GCAA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	25 %	25 %	15604728
26	NC_000117	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	15604728
27	NC_000117	GAAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	15604728
28	NC_000117	AATG	2	8	11541	11548	50 %	25 %	25 %	0 %	15604729
29	NC_000117	ATTT	2	8	12318	12325	25 %	75 %	0 %	0 %	15604729
30	NC_000117	GTTT	2	8	12573	12580	0 %	75 %	25 %	0 %	15604730
31	NC_000117	ATGC	2	8	13003	13010	25 %	25 %	25 %	25 %	15604730
32	NC_000117	TTGT	2	8	14039	14046	0 %	75 %	25 %	0 %	15604731
33	NC_000117	ATTT	2	8	14416	14423	25 %	75 %	0 %	0 %	15604731
34	NC_000117	TTTC	2	8	15078	15085	0 %	75 %	0 %	25 %	15604732
35	NC_000117	AAAT	2	8	15560	15567	75 %	25 %	0 %	0 %	15604732
36	NC_000117	GTAA	2	8	16402	16409	50 %	25 %	25 %	0 %	15604733
37	NC_000117	CTAA	2	8	16595	16602	50 %	25 %	0 %	25 %	15604733
38	NC_000117	AGAA	2	8	16858	16865	75 %	0 %	25 %	0 %	15604733
39	NC_000117	ATTT	2	8	17004	17011	25 %	75 %	0 %	0 %	15604733
40	NC_000117	CTTT	2	8	18565	18572	0 %	75 %	0 %	25 %	15604735
41	NC_000117	GAAG	2	8	19510	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	15604735
42	NC_000117	TTTG	2	8	19536	19543	0 %	75 %	25 %	0 %	15604735
43	NC_000117	TGTA	2	8	20228	20235	25 %	50 %	25 %	0 %	15604736
44	NC_000117	GATG	2	8	21644	21651	25 %	25 %	50 %	0 %	15604737
45	NC_000117	CATT	2	8	22703	22710	25 %	50 %	0 %	25 %	15604737
46	NC_000117	GCTT	2	8	23046	23053	0 %	50 %	25 %	25 %	15604737
47	NC_000117	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	15604737
48	NC_000117	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	15604737
49	NC_000117	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	15604737
50	NC_000117	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	15604737
51	NC_000117	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	15604737
52	NC_000117	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	15604738
53	NC_000117	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	15604738
54	NC_000117	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	15604738
55	NC_000117	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	15604738
56	NC_000117	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	15604738
57	NC_000117	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	15604739
58	NC_000117	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	15604739
59	NC_000117	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	15604739
60	NC_000117	GGGC	2	8	27274	27281	0 %	0 %	75 %	25 %	15604739
61	NC_000117	GTTT	2	8	27557	27564	0 %	75 %	25 %	0 %	15604740
62	NC_000117	CAGA	2	8	27579	27586	50 %	0 %	25 %	25 %	15604740
63	NC_000117	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	15604742
64	NC_000117	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	15604742
65	NC_000117	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	15604742
66	NC_000117	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	15604742
67	NC_000117	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	15604743
68	NC_000117	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	15604743
69	NC_000117	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	15604743
70	NC_000117	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	15604745
71	NC_000117	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	15604748
72	NC_000117	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	15604748
73	NC_000117	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	15604749
74	NC_000117	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	15604749
75	NC_000117	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	15604750
76	NC_000117	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	15604750
77	NC_000117	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	15604750
78	NC_000117	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	15604750
79	NC_000117	TTGG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	50 %	0 %	15604750
80	NC_000117	AGAT	2	8	36263	36270	50 %	25 %	25 %	0 %	15604750
81	NC_000117	CTTT	2	8	36636	36643	0 %	75 %	0 %	25 %	15604751
82	NC_000117	ATGA	2	8	37126	37133	50 %	25 %	25 %	0 %	15604751
83	NC_000117	TAGG	2	8	37285	37292	25 %	25 %	50 %	0 %	15604751
84	NC_000117	CAAT	2	8	37469	37476	50 %	25 %	0 %	25 %	15604751
85	NC_000117	AATG	2	8	38256	38263	50 %	25 %	25 %	0 %	15604751
86	NC_000117	AGAA	2	8	39093	39100	75 %	0 %	25 %	0 %	15604752
87	NC_000117	AAGA	2	8	39145	39152	75 %	0 %	25 %	0 %	15604752
88	NC_000117	ATCC	2	8	39153	39160	25 %	25 %	0 %	50 %	15604752
89	NC_000117	TAAT	2	8	39364	39371	50 %	50 %	0 %	0 %	15604752
90	NC_000117	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	15604754
91	NC_000117	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	15604754
92	NC_000117	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	15604754
93	NC_000117	AAAC	2	8	43233	43240	75 %	0 %	0 %	25 %	15604757
94	NC_000117	CAAT	2	8	43437	43444	50 %	25 %	0 %	25 %	15604757
95	NC_000117	ATTT	2	8	44194	44201	25 %	75 %	0 %	0 %	15604759
96	NC_000117	GCTC	2	8	44502	44509	0 %	25 %	25 %	50 %	15604759
97	NC_000117	TTCT	2	8	44644	44651	0 %	75 %	0 %	25 %	15604759
98	NC_000117	TTGA	2	8	45244	45251	25 %	50 %	25 %	0 %	15604760
99	NC_000117	TGTT	2	8	45416	45423	0 %	75 %	25 %	0 %	15604760
100	NC_000117	CTAT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	0 %	25 %	15604760
101	NC_000117	TGTT	2	8	45475	45482	0 %	75 %	25 %	0 %	15604760
102	NC_000117	CTAT	2	8	45771	45778	25 %	50 %	0 %	25 %	15604760
103	NC_000117	AAGA	2	8	46266	46273	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
104	NC_000117	AAGA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
105	NC_000117	AAAG	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
106	NC_000117	AAGA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	25 %	0 %	15604761
107	NC_000117	ACTT	2	8	46739	46746	25 %	50 %	0 %	25 %	15604761
108	NC_000117	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	15604761
109	NC_000117	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	15604761
110	NC_000117	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	15604761
111	NC_000117	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	15604762
112	NC_000117	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	15604763
113	NC_000117	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	15604763
114	NC_000117	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	15604764
115	NC_000117	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	15604764
116	NC_000117	GGAA	2	8	52411	52418	50 %	0 %	50 %	0 %	15604766
117	NC_000117	TTAA	2	8	53152	53159	50 %	50 %	0 %	0 %	15604766
118	NC_000117	CCTT	2	8	53359	53366	0 %	50 %	0 %	50 %	15604767
119	NC_000117	TTTA	2	8	53526	53533	25 %	75 %	0 %	0 %	15604767
120	NC_000117	AAAG	2	8	53750	53757	75 %	0 %	25 %	0 %	15604767
121	NC_000117	GATT	2	8	53887	53894	25 %	50 %	25 %	0 %	15604767
122	NC_000117	AATC	2	8	53942	53949	50 %	25 %	0 %	25 %	15604767
123	NC_000117	TATT	2	8	54003	54010	25 %	75 %	0 %	0 %	15604767
124	NC_000117	TCGA	2	8	54391	54398	25 %	25 %	25 %	25 %	15604768
125	NC_000117	CTTC	2	8	54485	54492	0 %	50 %	0 %	50 %	15604768
126	NC_000117	GAAT	2	8	54520	54527	50 %	25 %	25 %	0 %	15604768
127	NC_000117	TTGA	2	8	54590	54597	25 %	50 %	25 %	0 %	15604768
128	NC_000117	GGAA	2	8	54946	54953	50 %	0 %	50 %	0 %	15604768
129	NC_000117	ACAT	2	8	55468	55475	50 %	25 %	0 %	25 %	15604768
130	NC_000117	TTGC	2	8	55841	55848	0 %	50 %	25 %	25 %	15604769
131	NC_000117	AGCT	2	8	56340	56347	25 %	25 %	25 %	25 %	15604769
132	NC_000117	GTTG	2	8	57128	57135	0 %	50 %	50 %	0 %	15604769
133	NC_000117	AGAA	2	8	57988	57995	75 %	0 %	25 %	0 %	15604770
134	NC_000117	AGGT	2	8	58028	58035	25 %	25 %	50 %	0 %	15604770
135	NC_000117	GGAA	2	8	58582	58589	50 %	0 %	50 %	0 %	15604770
136	NC_000117	TAGA	2	8	58707	58714	50 %	25 %	25 %	0 %	15604770
137	NC_000117	TGAA	2	8	58812	58819	50 %	25 %	25 %	0 %	15604770
138	NC_000117	CGTT	2	8	59191	59198	0 %	50 %	25 %	25 %	15604771
139	NC_000117	GGAG	2	8	59200	59207	25 %	0 %	75 %	0 %	15604771
140	NC_000117	GTAA	2	8	59252	59259	50 %	25 %	25 %	0 %	15604771
141	NC_000117	ATGG	2	8	59479	59486	25 %	25 %	50 %	0 %	15604771
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143	NC_000117	ATGT	2	8	60075	60082	25 %	50 %	25 %	0 %	15604771
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