MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 1234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000117	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_000117	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_000117	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000117	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_000117	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000117	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000117	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000117	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000117	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000117	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000117	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_000117	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000117	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000117	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000117	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_000117	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_000117	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000117	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000117	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000117	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000117	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000117	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000117	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000117	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000117	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000117	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000117	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000117	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000117	TTC	3	9	9176	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000117	ATC	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000117	GAA	2	6	9230	9235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000117	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_000117	TAG	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000117	CTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000117	TCA	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000117	ATT	2	6	13373	13378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000117	AAG	2	6	13390	13395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000117	TTA	2	6	13416	13421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000117	AAG	2	6	13450	13455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000117	AAC	2	6	13534	13539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000117	CTT	2	6	14957	14962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_000117	GTT	2	6	17630	17635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000117	GAA	2	6	18374	18379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000117	AAT	3	9	18438	18446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000117	TCT	2	6	18466	18471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000117	CTT	3	9	19892	19900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_000117	GAA	2	6	20417	20422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000117	CCT	2	6	20565	20570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_000117	GGA	2	6	20611	20616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000117	AGA	3	9	20651	20659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000117	TGG	2	6	20870	20875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000117	AAC	2	6	20909	20914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_000117	AGC	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000117	AGG	2	6	21015	21020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000117	TGA	2	6	21127	21132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000117	TCC	2	6	21244	21249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_000117	AAT	2	6	21420	21425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000117	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000117	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_000117	TAA	2	6	27880	27885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000117	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000117	CTG	2	6	33121	33126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000117	CTT	2	6	36478	36483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_000117	TAA	2	6	38816	38821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000117	AAG	2	6	38857	38862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000117	CTC	2	6	40135	40140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_000117	AAG	2	6	40220	40225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000117	GAT	2	6	42676	42681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000117	AAG	2	6	42682	42687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000117	GGA	2	6	42734	42739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000117	TAA	2	6	42832	42837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000117	ACT	2	6	44064	44069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_000117	AAG	2	6	45915	45920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000117	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000117	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000117	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000117	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_000117	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000117	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000117	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000117	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000117	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_000117	ACT	2	6	49678	49683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_000117	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000117	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000117	GCC	2	6	49782	49787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_000117	ATT	2	6	49831	49836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000117	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_000117	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000117	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000117	GAT	2	6	52129	52134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000117	AAG	2	6	52207	52212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000117	AAT	2	6	52234	52239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000117	ATT	2	6	52246	52251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000117	CTT	2	6	57278	57283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_000117	TCC	2	6	57338	57343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_000117	TAA	2	6	60692	60697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000117	AAG	2	6	60754	60759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000117	AGG	2	6	60762	60767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000117	ACA	2	6	68568	68573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_000117	AGA	2	6	71763	71768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000117	CGT	2	6	71811	71816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_000117	AAG	2	6	74604	74609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000117	ACT	2	6	74619	74624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_000117	AGT	2	6	74655	74660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000117	CTT	2	6	76624	76629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_000117	GAG	3	9	78384	78392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000117	TTA	2	6	79118	79123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000117	CAT	2	6	79319	79324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_000117	TAG	2	6	79335	79340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000117	TTC	2	6	79369	79374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_000117	GTT	2	6	79387	79392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000117	GTT	2	6	79429	79434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000117	ATT	2	6	79438	79443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000117	AGG	2	6	79568	79573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000117	TAG	2	6	79640	79645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000117	GTG	2	6	84984	84989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000117	GTA	2	6	85008	85013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000117	AGC	2	6	85080	85085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_000117	ATT	2	6	87944	87949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000117	AAC	2	6	88035	88040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000117	ATT	2	6	90450	90455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000117	GAA	2	6	90469	90474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000117	AAG	3	9	90509	90517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000117	GTT	2	6	92809	92814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000117	TGA	2	6	92859	92864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000117	AGA	2	6	92877	92882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000117	GAA	2	6	93374	93379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000117	TGA	2	6	93385	93390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000117	TAA	2	6	93511	93516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000117	TAA	2	6	93934	93939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000117	TAA	2	6	94007	94012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000117	ATT	3	9	94224	94232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000117	TTA	2	6	97593	97598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000117	AAT	2	6	99468	99473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000117	GAA	2	6	99921	99926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000117	TTA	2	6	102029	102034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000117	TCT	2	6	103315	103320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_000117	TAA	3	9	106741	106749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000117	CTT	2	6	106785	106790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_000117	CTC	2	6	113853	113858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_000117	ATT	2	6	113949	113954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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