MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.01

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018146	GAA	2	6	9	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018146	ACG	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018146	TGCC	2	8	189	196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018146	GC	3	6	241	246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018146	GC	3	6	258	263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018146	A	7	7	281	287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018146	GCA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018146	GA	3	6	385	390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018146	TGC	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018146	AATCT	2	10	434	443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018146	CAA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018146	TCA	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018146	CA	3	6	560	565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018146	CGA	2	6	594	599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018146	CCGG	2	8	607	614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018146	A	8	8	650	657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018146	AT	3	6	705	710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018146	AATCA	2	10	1544	1553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018146	C	8	8	1618	1625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_018146	CAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018146	TCA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018146	TGACA	2	10	2305	2314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018146	T	8	8	3084	3091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018146	GAT	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018146	AAGCTG	2	12	3128	3139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018146	T	6	6	3544	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018146	CAT	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018146	TCT	2	6	3689	3694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018146	GTT	2	6	3740	3745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018146	TCA	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018146	TCG	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018146	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018146	TC	6	12	3989	4000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018146	CTGC	2	8	4025	4032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018146	GCA	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018146	CAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018146	TCCC	2	8	4095	4102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_018146	ATA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018146	T	6	6	4164	4169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018146	ACC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018146	TTA	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018146	ATAAA	2	10	4217	4226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018146	ATT	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018146	AATAA	2	10	4252	4261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018146	TAA	3	9	4282	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018146	AT	3	6	4293	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018146	T	7	7	4327	4333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018146	A	6	6	4338	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018146	T	7	7	4348	4354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018146	T	8	8	4382	4389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018146	ATA	2	6	4396	4401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018146	ATT	3	9	4402	4410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018146	T	6	6	4449	4454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018146	ACC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018146	ATT	2	6	4579	4584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018146	T	6	6	4598	4603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018146	T	6	6	4654	4659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018146	ACC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018146	GAA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018146	AGA	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018146	ATG	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018146	TAA	2	6	5147	5152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018146	TTA	2	6	5183	5188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018146	T	7	7	5258	5264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018146	AAG	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018146	AGG	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018146	ATG	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018146	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018146	TCT	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018146	C	6	6	5477	5482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_018146	T	6	6	5489	5494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018146	ATC	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018146	TTAT	2	8	5564	5571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018146	AAGA	2	8	5572	5579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018146	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018146	GAC	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018146	AC	3	6	5613	5618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018146	ATTT	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018146	CAG	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018146	ATT	2	6	5639	5644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018146	TTC	2	6	5670	5675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018146	AAC	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018146	AT	3	6	5710	5715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018146	CTTT	2	8	5750	5757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018146	AGCGA	2	10	5773	5782	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018146	TAT	2	6	5804	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018146	T	6	6	7124	7129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018146	ATC	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018146	GAT	2	6	7187	7192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018146	CAA	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018146	T	8	8	7258	7265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018146	AT	3	6	7848	7853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018146	CAA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018146	CAT	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018146	A	6	6	8009	8014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018146	T	6	6	8056	8061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018146	CAA	2	6	9463	9468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018146	AAGG	2	8	9502	9509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018146	GCG	2	6	9526	9531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018146	GAAG	2	8	9536	9543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018146	AGGA	2	8	9696	9703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018146	GGC	2	6	9854	9859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018146	CCTT	2	8	9919	9926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018146	AAG	2	6	10013	10018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018146	AAG	2	6	10034	10039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018146	TGT	2	6	10360	10365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018146	ACTT	2	8	10370	10377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018146	ACC	2	6	10406	10411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018146	AGC	2	6	10476	10481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018146	GAT	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018146	T	6	6	13037	13042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018146	TAATT	2	10	13045	13054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018146	TAA	2	6	13070	13075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018146	AGA	2	6	13078	13083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018146	A	6	6	13090	13095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018146	GAA	2	6	13202	13207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018146	TTA	2	6	13235	13240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018146	ATC	2	6	13254	13259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018146	TCA	2	6	13282	13287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018146	TTC	2	6	13305	13310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018146	TCT	2	6	13364	13369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018146	ATT	2	6	13469	13474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018146	ACAA	2	8	13601	13608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018146	GTAC	2	8	13619	13626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018146	CATT	2	8	13650	13657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018146	CAA	2	6	13697	13702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018146	CGTC	2	8	13708	13715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018146	ACT	2	6	13853	13858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018146	T	7	7	13948	13954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018146	AAAC	2	8	13958	13965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018146	TTAAG	2	10	13999	14008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018146	AGC	2	6	14035	14040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018146	GAG	2	6	14102	14107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018146	TTG	2	6	14198	14203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018146	GTT	2	6	14359	14364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018146	TATT	2	8	14391	14398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018146	AGC	2	6	14409	14414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018146	TAA	2	6	14481	14486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018146	ATT	2	6	14502	14507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018146	CAG	2	6	14559	14564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018146	AAG	2	6	14605	14610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018146	ATTC	2	8	14622	14629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018146	CTT	2	6	14721	14726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018146	GAT	2	6	14729	14734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018146	AGCAA	2	10	14766	14775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018146	AGG	2	6	14824	14829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018146	T	8	8	14906	14913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018146	CAAC	2	8	15029	15036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018146	A	7	7	15086	15092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018146	T	6	6	15124	15129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018146	A	6	6	15192	15197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018146	A	6	6	15203	15208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018146	CTG	2	6	15513	15518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018146	TAA	2	6	15607	15612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018146	TGA	2	6	15620	15625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018146	T	6	6	15646	15651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018146	AGC	2	6	15658	15663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018146	CAA	2	6	15735	15740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_018146	AAT	2	6	15790	15795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018146	GAG	2	6	15837	15842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018146	AAT	2	6	15850	15855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018146	AGT	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018146	A	6	6	15987	15992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018146	TTTAA	2	10	16004	16013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018146	ATTT	2	8	16615	16622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018146	TA	3	6	16641	16646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018146	AAGA	2	8	16667	16674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018146	TTTAT	2	10	16687	16696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018146	CTTT	2	8	17037	17044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_018146	TCT	2	6	17052	17057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_018146	T	6	6	17083	17088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018146	CAC	2	6	17186	17191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_018146	CA	3	6	17219	17224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_018146	GTTT	2	8	17302	17309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018146	GTT	2	6	17423	17428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018146	CTT	2	6	17500	17505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_018146	A	8	8	17532	17539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018146	AAGAA	2	10	17551	17560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018146	ATT	2	6	17563	17568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018146	TTC	2	6	17572	17577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_018146	ATT	2	6	17632	17637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018146	T	7	7	17648	17654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018146	T	6	6	18254	18259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018146	AAT	2	6	18262	18267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018146	T	6	6	18337	18342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.