MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 chromosome

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018145	TCCGAA	2	12	8815	8826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018145	GCGAAA	2	12	18170	18181	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018145	TAATTT	2	12	37761	37772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018145	TTTTTA	2	12	62745	62756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018145	GACATC	2	12	86077	86088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018145	TTTCCG	2	12	97043	97054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018145	AAAAAC	2	12	137752	137763	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018145	TTTTCT	2	12	183279	183290	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018145	CTTGGC	2	12	192420	192431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018145	CAAAAA	2	12	192585	192596	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018145	TCCCAG	2	12	228799	228810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018145	AGAGAA	2	12	294951	294962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018145	AATCGC	2	12	296997	297008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018145	GATAAA	2	12	298758	298769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018145	TGGTAT	2	12	314685	314696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018145	TAAGGC	2	12	343382	343393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018145	ATCTAT	2	12	357051	357062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018145	AAAAAT	2	12	414240	414251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018145	TAAAAA	2	12	415123	415134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018145	CATATT	2	12	415670	415681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018145	GACAAA	2	12	437919	437930	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018145	AAAATT	2	12	471702	471713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018145	TATTTT	2	12	511804	511815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018145	AAAGAT	2	12	543923	543934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018145	TGTCTT	2	12	652222	652233	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018145	ACCGCC	2	12	675646	675657	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018145	GATCTA	2	12	723382	723393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018145	TTTGCC	2	12	756795	756806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018145	ACGATC	2	12	772560	772571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018145	AGAAAA	2	12	775825	775836	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018145	AAAATC	2	12	802841	802852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018145	TGATTT	2	12	806326	806337	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018145	AAAAAT	2	12	813253	813264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018145	ATTTAT	2	12	836462	836473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018145	GCAAAA	2	12	839274	839285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018145	TCGCTT	2	12	842893	842904	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018145	GAACAG	2	12	874008	874019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018145	TAAAAT	2	12	893391	893402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018145	AAATTG	2	12	911737	911748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018145	CTTTTG	2	12	920076	920087	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018145	ACAATT	2	12	963724	963735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018145	TAAAAA	2	12	1062112	1062123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018145	AAAATA	2	12	1088558	1088569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018145	ATGAAA	2	12	1100619	1100630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018145	AGCAGA	2	12	1105029	1105040	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018145	AATATA	2	12	1105161	1105172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018145	AATCGC	2	12	1108830	1108841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018145	TTCAAA	2	12	1119939	1119950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018145	CAAAAA	2	12	1121305	1121316	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018145	ATAAAA	2	12	1154488	1154499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018145	ATTTTT	2	12	1154539	1154550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018145	AGAAAA	2	12	1165629	1165640	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018145	AAAAAG	2	12	1204772	1204783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018145	CATAAT	2	12	1223392	1223403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018145	TATATT	2	12	1249404	1249415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018145	CAAAAA	2	12	1262150	1262161	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018145	GTTTTT	2	12	1266265	1266276	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018145	TTATTT	2	12	1281417	1281428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018145	GGCAAA	2	12	1307926	1307937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018145	TAAAAA	2	12	1354282	1354293	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018145	AATTAA	2	12	1354298	1354309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018145	AGGCTC	2	12	1394404	1394415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018145	TTTTAA	2	12	1413543	1413554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018145	CTGTTT	2	12	1450910	1450921	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018145	TCCCTA	2	12	1465061	1465072	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018145	TTTCCT	2	12	1511614	1511625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018145	TTTTGA	2	12	1529414	1529425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018145	ATTCTT	2	12	1547822	1547833	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018145	AACATC	2	12	1561216	1561227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018145	GAAAAG	2	12	1565099	1565110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018145	ATTTGT	2	12	1580445	1580456	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018145	GAATAA	2	12	1582267	1582278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018145	AAATCG	2	12	1588990	1589001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018145	TTCTTT	2	12	1599017	1599028	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018145	GCTTTT	2	12	1610671	1610682	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018145	TAAAAA	2	12	1626005	1626016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018145	ATTTTT	2	12	1662070	1662081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018145	CAATAA	2	12	1680454	1680465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018145	CTTTTC	2	12	1696871	1696882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018145	ATTTTT	2	12	1708868	1708879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018145	TTTTAT	2	12	1712856	1712867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018145	AAACAA	2	12	1717972	1717983	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018145	TCTTTT	2	12	1725400	1725411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018145	GCGGTG	2	12	1725450	1725461	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018145	TTTAAT	2	12	1745172	1745183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018145	ATTTTT	2	12	1766312	1766323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018145	CGTGAT	2	12	1781096	1781107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018145	GTGATT	2	12	1785019	1785030	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018145	ATCAAA	2	12	1820701	1820712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018145	ATTGAT	2	12	1825642	1825653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018145	TATTTT	2	12	1826406	1826417	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018145	ATCTTG	2	12	1837843	1837854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018145	TAATTT	2	12	1849568	1849579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018145	ATGATA	2	12	1911318	1911329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018145	ATAAGT	2	12	1914780	1914791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018145	GAAAAA	2	12	1923754	1923765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018145	TAAAAA	2	12	1956206	1956217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.