MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	GCT	2	6	7	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017183	TCT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017183	TGT	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017183	GGT	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017183	CCG	2	6	649	654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017183	GCC	2	6	678	683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017183	ACC	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017183	TGC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017183	CAA	2	6	962	967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017183	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017183	CTG	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017183	GCA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017183	CAG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017183	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017183	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017183	TCT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017183	CAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017183	GCT	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017183	AGG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017183	CCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017183	ATA	2	6	3602	3607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017183	AAC	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017183	TTC	2	6	3750	3755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017183	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017183	AAT	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017183	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017183	GTG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017183	TCT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017183	TAA	2	6	4466	4471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017183	TGC	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017183	TGC	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017183	GAA	2	6	10781	10786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017183	TGC	2	6	10788	10793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017183	GCT	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017183	TCT	2	6	10977	10982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017183	GAC	2	6	10983	10988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017183	TCG	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017183	GGC	2	6	11217	11222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017183	TCA	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017183	AGG	2	6	11280	11285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017183	TGC	2	6	11336	11341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017183	TTC	2	6	11506	11511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017183	CTT	2	6	11543	11548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017183	ATA	2	6	11739	11744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017183	ATC	2	6	15623	15628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017183	AGA	2	6	15699	15704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017183	TCC	2	6	15773	15778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017183	CTG	2	6	15796	15801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017183	TCT	2	6	15819	15824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017183	TTG	2	6	15877	15882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017183	AGC	2	6	15978	15983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017183	CAT	2	6	16069	16074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017183	TCA	2	6	16147	16152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017183	TGT	2	6	16157	16162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017183	TTA	2	6	18130	18135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017183	GAT	2	6	18141	18146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017183	GGC	2	6	18153	18158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017183	AAC	2	6	18239	18244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017183	ATT	2	6	18384	18389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017183	ATG	2	6	18394	18399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017183	ATT	2	6	18558	18563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017183	AAG	2	6	18571	18576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017183	ATA	2	6	18639	18644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017183	TTA	2	6	18694	18699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017183	ACT	2	6	20713	20718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017183	TGG	2	6	20785	20790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017183	ATT	2	6	20874	20879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017183	GAA	2	6	22005	22010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017183	TTA	2	6	22016	22021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017183	ATA	2	6	22162	22167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017183	ATG	2	6	22278	22283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017183	TCT	2	6	23481	23486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017183	TAT	2	6	23640	23645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017183	TTA	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017183	ATA	2	6	25141	25146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017183	ATG	2	6	25315	25320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017183	AAT	2	6	25390	25395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017183	ATT	2	6	25400	25405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017183	GGC	2	6	25490	25495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017183	TAA	2	6	28223	28228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017183	AGT	2	6	28883	28888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017183	ATT	2	6	28945	28950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017183	GTC	2	6	28965	28970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017183	TTA	2	6	29228	29233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017183	ATG	2	6	29251	29256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017183	GAA	2	6	29322	29327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017183	AAT	2	6	29412	29417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017183	CAC	2	6	29427	29432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017183	AAG	2	6	29535	29540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017183	ACC	2	6	29564	29569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017183	TAT	2	6	29739	29744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017183	TCA	2	6	29854	29859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017183	TGA	2	6	29965	29970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017183	GAT	2	6	30112	30117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017183	ATG	2	6	30201	30206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017183	TAA	2	6	30472	30477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017183	CTT	2	6	30528	30533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017183	AAG	2	6	30663	30668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017183	TCT	2	6	30719	30724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017183	GAT	2	6	30749	30754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017183	AGA	2	6	30757	30762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017183	TCT	3	9	30780	30788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017183	CTT	2	6	30869	30874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017183	CTC	2	6	30933	30938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017183	TGA	2	6	31236	31241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017183	ATA	2	6	31336	31341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017183	GAC	2	6	31346	31351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017183	TCT	2	6	31534	31539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017183	GCA	2	6	31572	31577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017183	AAG	2	6	31627	31632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017183	TCG	2	6	31670	31675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017183	CCA	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017183	CCT	2	6	31837	31842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017183	AAG	2	6	31892	31897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017183	CCG	2	6	31926	31931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017183	TGA	2	6	32086	32091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.