MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP02

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015716	AAT	2	6	3	8	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015716	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015716	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015716	TAG	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015716	ACC	2	6	1795	1800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015716	TTG	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015716	CCT	2	6	1884	1889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015716	GTT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015716	AAG	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015716	ATA	2	6	2097	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015716	TCT	2	6	2368	2373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015716	GTC	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015716	CGC	2	6	2697	2702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015716	CGC	2	6	2709	2714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015716	TTC	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015716	AAC	2	6	2851	2856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015716	CAG	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015716	ATG	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015716	CGC	2	6	2985	2990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015716	AAT	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015716	GCT	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015716	ACG	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015716	CTG	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015716	TCC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015716	GCC	2	6	3437	3442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015716	CTT	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015716	GCT	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015716	TGC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015716	TCC	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015716	GCG	2	6	4299	4304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015716	ATC	2	6	11655	11660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015716	GCC	2	6	11846	11851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015716	GTT	2	6	12205	12210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015716	TGA	2	6	12240	12245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015716	GGA	2	6	12268	12273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015716	TCA	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015716	CAT	2	6	12431	12436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015716	CTT	2	6	12523	12528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015716	GTT	2	6	12573	12578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015716	CAG	2	6	12580	12585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015716	ATC	2	6	12665	12670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015716	GCA	2	6	12937	12942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015716	ATC	2	6	12982	12987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015716	CTG	2	6	13025	13030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015716	CGC	2	6	13180	13185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015716	CTT	2	6	13199	13204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015716	TCA	2	6	13218	13223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015716	CCT	2	6	13237	13242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015716	CTG	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015716	AAT	2	6	13411	13416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015716	CCG	2	6	13420	13425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015716	TGC	2	6	13631	13636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015716	CTG	2	6	13750	13755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015716	CAG	2	6	13779	13784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015716	GCG	2	6	13787	13792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015716	ACC	2	6	13811	13816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015716	TGA	2	6	17470	17475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015716	TAG	2	6	17644	17649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015716	TGG	2	6	17721	17726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015716	AAT	2	6	17961	17966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015716	AAT	2	6	17999	18004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015716	TCT	2	6	18462	18467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015716	GGC	2	6	18477	18482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015716	AAC	2	6	18686	18691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015716	GAA	2	6	18735	18740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015716	ATG	2	6	18828	18833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015716	TGA	2	6	18844	18849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015716	TCC	2	6	18990	18995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015716	GAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015716	TCA	2	6	19018	19023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015716	CGT	2	6	19128	19133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015716	GAT	2	6	19227	19232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015716	GAA	2	6	19360	19365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015716	ACA	2	6	19398	19403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015716	TTC	2	6	19460	19465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015716	TCT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015716	ATT	2	6	19680	19685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015716	ATG	2	6	19699	19704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015716	GTT	2	6	19746	19751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015716	TTG	2	6	19816	19821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015716	TAT	2	6	19823	19828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015716	AAG	2	6	19988	19993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015716	ACT	2	6	20054	20059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015716	TTC	2	6	20220	20225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015716	GTT	2	6	20277	20282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015716	GGA	2	6	20393	20398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015716	CTT	2	6	20531	20536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015716	GGC	2	6	20579	20584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015716	TGT	2	6	20617	20622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015716	TCG	2	6	20641	20646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015716	GCA	2	6	20708	20713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015716	GAT	2	6	20979	20984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015716	TTC	2	6	22116	22121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015716	TCG	2	6	22130	22135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015716	CTA	2	6	22360	22365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015716	TTA	2	6	22695	22700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015716	AGA	2	6	22831	22836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015716	TTG	2	6	22852	22857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015716	TAT	2	6	22898	22903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015716	TAT	2	6	22915	22920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015716	ATA	2	6	23129	23134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015716	ATA	2	6	23706	23711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015716	CTG	2	6	24832	24837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015716	AAG	2	6	24960	24965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015716	TGA	2	6	24987	24992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015716	TTG	2	6	25000	25005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015716	ATA	2	6	25014	25019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015716	AGA	2	6	25172	25177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015716	GCG	2	6	25229	25234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015716	ATA	2	6	25240	25245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015716	AAT	2	6	25749	25754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015716	TTG	2	6	25766	25771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015716	GTC	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015716	AGT	3	9	25841	25849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015716	AAT	2	6	26030	26035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015716	TAA	2	6	26109	26114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015716	ACA	2	6	26660	26665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015716	CTG	2	6	26746	26751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015716	ATC	2	6	26925	26930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015716	GGT	2	6	26931	26936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015716	CGT	2	6	26952	26957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015716	AAC	2	6	28308	28313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015716	CTT	2	6	28394	28399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015716	TCT	2	6	28645	28650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015716	TAA	2	6	28822	28827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015716	CTG	2	6	28843	28848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015716	GTT	2	6	28873	28878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015716	TTA	2	6	28881	28886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015716	AAC	2	6	28959	28964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015716	TTA	2	6	29571	29576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015716	GAT	2	6	29734	29739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015716	CAA	2	6	29793	29798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015716	TGC	2	6	29809	29814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015716	CGG	2	6	29818	29823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015716	TTC	2	6	29827	29832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015716	TGT	2	6	29906	29911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015716	TAA	2	6	29988	29993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015716	TCT	2	6	30553	30558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015716	GAA	2	6	30602	30607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015716	AGC	2	6	31110	31115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015716	AAT	2	6	31131	31136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015716	TTG	2	6	31186	31191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015716	TTA	2	6	31198	31203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015716	TAA	2	6	31208	31213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015716	GGT	2	6	31257	31262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015716	TTC	2	6	31370	31375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015716	TGA	2	6	31448	31453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015716	ATC	2	6	31545	31550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015716	CAG	2	6	31938	31943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015716	TCT	2	6	31989	31994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015716	AGC	2	6	34072	34077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015716	AGG	2	6	34148	34153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.