MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 chromosome

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015709	TCAGTG	2	12	161	172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015709	AAGCAA	2	12	4906	4917	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015709	ATAAAA	2	12	43747	43758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015709	TTACGG	2	12	74392	74403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015709	GTATTT	2	12	110410	110421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015709	CTTTCA	2	12	121025	121036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015709	CTTTCT	2	12	149287	149298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015709	AAAATA	2	12	160958	160969	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015709	TAAAAA	2	12	203641	203652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015709	AAAAAT	2	12	204565	204576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015709	AAAAAT	2	12	214006	214017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015709	CTTCAT	2	12	214338	214349	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015709	CAAAAA	2	12	251011	251022	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015709	TTTTTA	2	12	257356	257367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015709	TTTAAT	2	12	266224	266235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015709	AATTTA	2	12	276183	276194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015709	TAAATC	2	12	282441	282452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015709	TAATTT	2	12	298068	298079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015709	TAGAAA	2	12	305720	305731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015709	ATTTAA	2	12	308381	308392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015709	ATTTTT	2	12	375944	375955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015709	ATAATT	2	12	376024	376035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015709	AACAAG	2	12	379536	379547	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015709	ACAAAA	2	12	399262	399273	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015709	TTTTAG	2	12	406314	406325	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015709	ATTTTT	2	12	435890	435901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015709	TTAATT	2	12	440152	440163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015709	ATGCTA	2	12	448637	448648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015709	CGTTTT	2	12	470138	470149	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015709	GGTAAG	2	12	470316	470327	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015709	TATATT	2	12	482088	482099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015709	TATAAA	2	12	484054	484065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015709	TCCAAG	2	12	521875	521886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015709	GCTTTT	2	12	526716	526727	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015709	TATAAT	2	12	558470	558481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015709	TCTTTT	2	12	568757	568768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015709	ACATAA	2	12	571743	571754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015709	AAATAA	2	12	576581	576592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015709	GAAAGA	2	12	578680	578691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015709	AAATAT	2	12	631161	631172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015709	TTTTAT	2	12	660526	660537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015709	GCAAGC	2	12	663803	663814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015709	TAAAAA	2	12	664651	664662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015709	ATCTTA	2	12	695143	695154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015709	ATAAGA	2	12	748067	748078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015709	TTTTTA	2	12	749621	749632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015709	TTTTAA	2	12	756867	756878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015709	CAAAAG	2	12	760754	760765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015709	ATTTAT	2	12	783078	783089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015709	TCGCTT	2	12	789657	789668	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015709	ACTGCC	2	12	848178	848189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015709	TAAGAG	2	12	853712	853723	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015709	CATCCT	2	12	860847	860858	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015709	GTTGGT	2	12	868644	868655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015709	ATTACC	2	12	869358	869369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015709	TTATTT	2	12	886802	886813	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015709	AATTTA	2	12	894763	894774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015709	ATATTT	2	12	934825	934836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015709	AATTTT	2	12	939759	939770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015709	TAATTA	2	12	941477	941488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015709	TTAAAA	2	12	942080	942091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015709	TAAATA	2	12	1000217	1000228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015709	AAAGAG	2	12	1016618	1016629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015709	TTATAT	2	12	1041501	1041512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015709	ATTAAT	2	12	1080685	1080696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015709	AGTGAC	2	12	1095000	1095011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015709	AAGTTT	2	12	1131142	1131153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015709	ATTTTA	2	12	1133230	1133241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015709	TGTATT	2	12	1135276	1135287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015709	AATATA	2	12	1173933	1173944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015709	TTATAT	2	12	1185132	1185143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015709	AAAAAT	2	12	1186038	1186049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015709	TCTTTT	2	12	1199070	1199081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015709	ATAAAA	2	12	1219306	1219317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015709	AAATAG	2	12	1233228	1233239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015709	TAAAAG	2	12	1254019	1254030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015709	TAAATT	2	12	1259389	1259400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015709	TATTAA	2	12	1307896	1307907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015709	TATTTT	2	12	1321097	1321108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015709	TAAAAA	2	12	1358985	1358996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015709	TATAAC	2	12	1396290	1396301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015709	TTTATA	2	12	1410139	1410150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015709	AGGAAG	2	12	1458787	1458798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015709	CAACAC	2	12	1472985	1472996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015709	TAATTT	2	12	1476307	1476318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015709	ATTGAT	2	12	1496214	1496225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015709	ATATTA	2	12	1502925	1502936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015709	TCGGTA	2	12	1540421	1540432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015709	TCCATA	2	12	1542388	1542399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015709	TTTCCT	2	12	1555807	1555818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015709	TAATTT	2	12	1596652	1596663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015709	TTTAAA	2	12	1650395	1650406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015709	TCCTGC	2	12	1664894	1664905	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015709	ATTGAT	2	12	1692466	1692477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015709	AAAATA	2	12	1715583	1715594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015709	ACGGCG	2	12	1739722	1739733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015709	GCAATA	2	12	1759875	1759886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015709	TAATTA	2	12	1760193	1760204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015709	TAAAAA	2	12	1807736	1807747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015709	ATATTT	2	12	1807768	1807779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015709	TTATGT	2	12	1818668	1818679	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015709	TAAAAA	2	12	1825493	1825504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015709	ATATAA	2	12	1842465	1842476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015709	ATATAA	2	12	1842601	1842612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015709	TAAATA	2	12	1842681	1842692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015709	ATTTTT	2	12	1842752	1842763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015709	CAAAAA	2	12	1842839	1842850	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015709	ATTATA	2	12	1867344	1867355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015709	GGAAAC	2	12	1870867	1870878	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015709	AAGGCG	2	12	1880045	1880056	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015709	CAAAGG	2	12	1880428	1880439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015709	TTTTTA	2	12	1880860	1880871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015709	TATTAA	2	12	1903228	1903239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015709	AACAAA	2	12	1933474	1933485	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015709	GCTGTT	2	12	1941009	1941020	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015709	ATTCTC	2	12	1959718	1959729	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015709	CTCTTC	2	12	1964499	1964510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015709	CATGGA	2	12	1965883	1965894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015709	ATTTTA	2	12	1967507	1967518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015709	AGTATA	2	12	1971272	1971283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015709	AGTATA	2	12	1971287	1971298	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015709	TCAATG	2	12	1976566	1976577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015709	TAAGTT	2	12	1982155	1982166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015709	AAAAAG	2	12	1985655	1985666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.