MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zunongwangia profunda SM-A87 chromosome

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014041	TAAATG	2	12	186	197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014041	CTAAAA	2	12	21337	21348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014041	TTAGGT	2	12	23880	23891	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014041	ATATTT	2	12	42411	42422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014041	TTTGTA	2	12	59733	59744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014041	TTATAA	2	12	103912	103923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014041	TAATTA	2	12	167882	167893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014041	AAATAT	2	12	186705	186716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014041	AAATTT	2	12	205153	205164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014041	TTAAAA	2	12	216984	216995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014041	TTATTT	2	12	217249	217260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014041	TAAAAA	2	12	242020	242031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014041	TAAAAA	2	12	271145	271156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014041	TTTATC	2	12	284864	284875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014041	CTAGAT	2	12	326732	326743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014041	TTTTAA	2	12	344647	344658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014041	ATTTTT	2	12	353799	353810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014041	TTAGGG	2	12	373161	373172	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014041	ATTTAT	2	12	373611	373622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014041	GTTAAT	2	12	382465	382476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014041	TTTTTC	2	12	392375	392386	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014041	CTTTTT	2	12	393588	393599	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014041	ATTTTG	2	12	409056	409067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014041	TAAAAA	2	12	425043	425054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014041	CTAAAT	2	12	425114	425125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014041	GTATGG	2	12	450872	450883	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014041	TATATT	2	12	453451	453462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014041	AAATTT	2	12	456047	456058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014041	AAATTA	2	12	470395	470406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014041	ATTTAA	2	12	490450	490461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014041	TTAATT	2	12	504081	504092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014041	ATATTG	2	12	523071	523082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014041	ACTATC	2	12	531917	531928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014041	TAGCTT	2	12	546773	546784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014041	TTGTTT	2	12	563158	563169	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014041	AAATAA	2	12	650219	650230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014041	GTATTT	2	12	664930	664941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014041	AAAAAG	2	12	682338	682349	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014041	GTATTT	2	12	699597	699608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014041	AATTAA	2	12	751958	751969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014041	GTTACC	2	12	762091	762102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014041	CGTTGA	2	12	762247	762258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014041	TTTGCA	2	12	772945	772956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014041	AATTAG	2	12	778200	778211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014041	AGGTTG	2	12	785012	785023	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014041	TTAAAA	2	12	804791	804802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014041	GTTAGT	2	12	832909	832920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014041	TCAACT	2	12	874617	874628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014041	AATTTA	2	12	897704	897715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014041	AATTTA	2	12	897887	897898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014041	ATTCTA	2	12	898620	898631	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014041	TAAAAT	2	12	926004	926015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014041	CTTAAT	2	12	928771	928782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014041	AAAAAT	2	12	938164	938175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014041	AAACTG	2	12	945295	945306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014041	AAAATC	2	12	955274	955285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014041	TCGTTT	2	12	981680	981691	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014041	GTTTTT	2	12	1035646	1035657	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014041	TAAAAA	2	12	1054936	1054947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014041	TCCTCT	2	12	1074633	1074644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014041	AATTTT	2	12	1075587	1075598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014041	TAAAGC	2	12	1082837	1082848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014041	TCAATT	2	12	1086401	1086412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014041	CTTTTT	2	12	1087016	1087027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014041	TTAAAC	2	12	1106701	1106712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014041	AAATAA	2	12	1108149	1108160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014041	AAGAAA	2	12	1161930	1161941	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014041	TGAGAT	2	12	1215434	1215445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014041	GATTTT	2	12	1263366	1263377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014041	TTTAGG	2	12	1270831	1270842	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014041	TAATAT	2	12	1295928	1295939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014041	TATAAA	2	12	1299256	1299267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014041	AAAAAT	2	12	1331878	1331889	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014041	CTTTTT	2	12	1353191	1353202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014041	TTTTAT	2	12	1376446	1376457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014041	TTCGTT	2	12	1385091	1385102	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014041	AATTCA	2	12	1400923	1400934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014041	AAAAAT	2	12	1402646	1402657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014041	TGAAGA	2	12	1407482	1407493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014041	AATCAC	2	12	1409624	1409635	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014041	GTTATT	2	12	1410710	1410721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014041	TTTTTC	2	12	1427796	1427807	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014041	TTAGGA	2	12	1430906	1430917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014041	ATTAAA	2	12	1455848	1455859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014041	TATTTT	2	12	1475803	1475814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014041	CTATAG	2	12	1507643	1507654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014041	AAAATC	2	12	1520879	1520890	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014041	TTCTTT	2	12	1534632	1534643	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014041	GAAAAC	2	12	1552535	1552546	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014041	AAATTT	2	12	1552650	1552661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014041	AATCTA	2	12	1555366	1555377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014041	CATTAG	2	12	1563340	1563351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014041	CTAAAT	2	12	1594567	1594578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014041	ATAGCA	2	12	1595975	1595986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014041	TCATTA	2	12	1628388	1628399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014041	TTTTGA	2	12	1644350	1644361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014041	CTTCCA	2	12	1647157	1647168	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014041	TAAATT	2	12	1691813	1691824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014041	AATTTT	2	12	1711827	1711838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014041	TTAATT	2	12	1713053	1713064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014041	AAATCC	2	12	1716420	1716431	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014041	AAAAAC	2	12	1727902	1727913	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014041	TAAAGG	2	12	1740410	1740421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014041	ATTAAA	2	12	1744868	1744879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014041	TATATT	2	12	1777535	1777546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014041	TTATTT	2	12	1792033	1792044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014041	AATTTT	2	12	1821130	1821141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014041	CTACTG	2	12	1871958	1871969	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014041	AATTTT	2	12	1896397	1896408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014041	TACATC	2	12	1901822	1901833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014041	CTGATT	2	12	1903787	1903798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014041	AAAACG	2	12	1917180	1917191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014041	ATTTTG	2	12	1918422	1918433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014041	CTATGC	2	12	1918714	1918725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014041	ATTACA	2	12	1919828	1919839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014041	CATTTT	2	12	1972293	1972304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014041	AAAGGT	2	12	1981525	1981536	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014041	GTTACC	2	12	1987169	1987180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014041	CGTTGA	2	12	1987325	1987336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014041	AATTTT	2	12	1992567	1992578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014041	AACAGC	2	12	1997116	1997127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014041	TTTATC	2	12	2010611	2010622	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014041	AAATTT	2	12	2043379	2043390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014041	AAAAAG	2	12	2052154	2052165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014041	GCTTTA	2	12	2056846	2056857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014041	ATAAAA	2	12	2093989	2094000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014041	CTTTTT	2	12	2103319	2103330	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014041	TTCCAC	2	12	2104009	2104020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014041	TTTTAA	2	12	2104198	2104209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014041	ATTTTT	2	12	2134913	2134924	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014041	TTTTTC	2	12	2140319	2140330	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014041	ATTTTT	2	12	2149895	2149906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014041	ATAACT	2	12	2200843	2200854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014041	ATTTTT	2	12	2224355	2224366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_014041	TTTTTA	2	12	2269648	2269659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_014041	ATTTTT	2	12	2286203	2286214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_014041	ATTGTT	2	12	4269808	4269819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_014041	CTCCAT	2	12	4281017	4281028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
257	NC_014041	TAAAAT	2	12	4287921	4287932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_014041	TTTAAT	2	12	4314267	4314278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.