MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.03

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018148	ATT	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677556
2	NC_018148	A	6	6	168	173	100 %	0 %	0 %	0 %	397677556
3	NC_018148	GAA	2	6	218	223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677556
4	NC_018148	AGG	2	6	249	254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677556
5	NC_018148	GCT	2	6	262	267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677556
6	NC_018148	ATT	2	6	273	278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677556
7	NC_018148	A	7	7	329	335	100 %	0 %	0 %	0 %	397677556
8	NC_018148	T	6	6	661	666	0 %	100 %	0 %	0 %	397677557
9	NC_018148	TCT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677557
10	NC_018148	GAC	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677557
11	NC_018148	T	7	7	880	886	0 %	100 %	0 %	0 %	397677557
12	NC_018148	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677558
13	NC_018148	TAAA	2	8	1004	1011	75 %	25 %	0 %	0 %	397677558
14	NC_018148	CT	3	6	1046	1051	0 %	50 %	0 %	50 %	397677558
15	NC_018148	TCT	2	6	1113	1118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677558
16	NC_018148	CTA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677559
17	NC_018148	TGT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677559
18	NC_018148	ATG	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677559
19	NC_018148	ATG	2	6	1951	1956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677559
20	NC_018148	GAA	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677559
21	NC_018148	AGG	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677559
22	NC_018148	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677559
23	NC_018148	CTG	2	6	2179	2184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677559
24	NC_018148	TGC	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677559
25	NC_018148	CCG	2	6	2320	2325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677559
26	NC_018148	CTG	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677559
27	NC_018148	CTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677559
28	NC_018148	GGCA	2	8	2422	2429	25 %	0 %	50 %	25 %	397677559
29	NC_018148	GCA	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677559
30	NC_018148	ACC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677559
31	NC_018148	GCT	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677559
32	NC_018148	CAT	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677559
33	NC_018148	GCC	2	6	2706	2711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677559
34	NC_018148	CTG	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677559
35	NC_018148	TTC	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677559
36	NC_018148	GCC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677559
37	NC_018148	AGGC	2	8	2990	2997	25 %	0 %	50 %	25 %	397677559
38	NC_018148	GAG	2	6	3019	3024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677559
39	NC_018148	GAA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677559
40	NC_018148	AATGGG	2	12	3320	3331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	397677560
41	NC_018148	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677560
42	NC_018148	TCAA	2	8	3531	3538	50 %	25 %	0 %	25 %	397677560
43	NC_018148	AT	3	6	3540	3545	50 %	50 %	0 %	0 %	397677560
44	NC_018148	AAC	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677560
45	NC_018148	GATC	2	8	3600	3607	25 %	25 %	25 %	25 %	397677560
46	NC_018148	A	6	6	3662	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	397677560
47	NC_018148	C	6	6	3697	3702	0 %	0 %	0 %	100 %	397677560
48	NC_018148	AGA	3	9	3714	3722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677560
49	NC_018148	CAGC	2	8	3784	3791	25 %	0 %	25 %	50 %	397677560
50	NC_018148	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	397677560
51	NC_018148	GCA	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677560
52	NC_018148	CTC	2	6	3818	3823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677560
53	NC_018148	A	6	6	3830	3835	100 %	0 %	0 %	0 %	397677560
54	NC_018148	TGC	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677560
55	NC_018148	CGT	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677560
56	NC_018148	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677560
57	NC_018148	TCA	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677560
58	NC_018148	CAG	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677560
59	NC_018148	A	6	6	4133	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	397677560
60	NC_018148	TGA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677560
61	NC_018148	AAG	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677560
62	NC_018148	C	7	7	4265	4271	0 %	0 %	0 %	100 %	397677560
63	NC_018148	GAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677560
64	NC_018148	AAAG	2	8	4363	4370	75 %	0 %	25 %	0 %	397677560
65	NC_018148	GCA	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677560
66	NC_018148	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677561
67	NC_018148	TGGC	2	8	4522	4529	0 %	25 %	50 %	25 %	397677561
68	NC_018148	GTG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
69	NC_018148	A	6	6	4616	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
70	NC_018148	CGC	2	6	4622	4627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677561
71	NC_018148	ACC	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677561
72	NC_018148	TTA	2	6	4779	4784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677561
73	NC_018148	CCAAC	2	10	4797	4806	40 %	0 %	0 %	60 %	397677561
74	NC_018148	CAA	2	6	4837	4842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677561
75	NC_018148	CTTTAC	2	12	4846	4857	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677561
76	NC_018148	GAA	2	6	4859	4864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677561
77	NC_018148	CTT	3	9	5066	5074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677561
78	NC_018148	A	6	6	5120	5125	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
79	NC_018148	GGAA	2	8	5139	5146	50 %	0 %	50 %	0 %	397677561
80	NC_018148	CAGA	2	8	5204	5211	50 %	0 %	25 %	25 %	397677561
81	NC_018148	T	6	6	5216	5221	0 %	100 %	0 %	0 %	397677561
82	NC_018148	CCT	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677561
83	NC_018148	T	6	6	5348	5353	0 %	100 %	0 %	0 %	397677561
84	NC_018148	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677561
85	NC_018148	CAG	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677561
86	NC_018148	CCG	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677561
87	NC_018148	GGCG	2	8	5453	5460	0 %	0 %	75 %	25 %	397677561
88	NC_018148	GGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677561
89	NC_018148	GAT	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677561
90	NC_018148	TGG	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
91	NC_018148	TGAC	2	8	5574	5581	25 %	25 %	25 %	25 %	397677561
92	NC_018148	CAC	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677561
93	NC_018148	GGT	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
94	NC_018148	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
95	NC_018148	AGA	2	6	5653	5658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677561
96	NC_018148	GCA	2	6	5689	5694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677561
97	NC_018148	TAT	2	6	5716	5721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677561
98	NC_018148	TTA	2	6	5730	5735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677561
99	NC_018148	CAA	2	6	5751	5756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677561
100	NC_018148	CAT	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677561
101	NC_018148	TGG	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
102	NC_018148	GCT	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677561
103	NC_018148	ACC	2	6	5915	5920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677561
104	NC_018148	ATC	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677561
105	NC_018148	GCA	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677561
106	NC_018148	GGACG	2	10	5971	5980	20 %	0 %	60 %	20 %	397677561
107	NC_018148	AGA	2	6	6076	6081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677561
108	NC_018148	A	6	6	6098	6103	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
109	NC_018148	AAC	2	6	6185	6190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677561
110	NC_018148	C	7	7	6301	6307	0 %	0 %	0 %	100 %	397677561
111	NC_018148	TGG	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
112	NC_018148	GAC	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677561
113	NC_018148	CG	3	6	6408	6413	0 %	0 %	50 %	50 %	397677561
114	NC_018148	ATT	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677561
115	NC_018148	GTT	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677561
116	NC_018148	TGA	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677561
117	NC_018148	AGC	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677561
118	NC_018148	A	6	6	6584	6589	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
119	NC_018148	TGG	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
120	NC_018148	CCCTA	2	10	6742	6751	20 %	20 %	0 %	60 %	397677561
121	NC_018148	TGG	2	6	6834	6839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677561
122	NC_018148	GCC	2	6	6911	6916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677561
123	NC_018148	T	6	6	6947	6952	0 %	100 %	0 %	0 %	397677561
124	NC_018148	CAC	2	6	6982	6987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677561
125	NC_018148	AAC	2	6	7005	7010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677561
126	NC_018148	GGC	2	6	7133	7138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677561
127	NC_018148	A	6	6	7164	7169	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
128	NC_018148	GAA	2	6	7199	7204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677561
129	NC_018148	A	6	6	7203	7208	100 %	0 %	0 %	0 %	397677561
130	NC_018148	GAC	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677561
131	NC_018148	GAA	2	6	7322	7327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677561
132	NC_018148	T	6	6	7337	7342	0 %	100 %	0 %	0 %	397677561
133	NC_018148	ATC	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677561
134	NC_018148	GAG	2	6	7382	7387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677561
135	NC_018148	ACAG	2	8	7501	7508	50 %	0 %	25 %	25 %	397677561
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.