MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.01

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018146	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677587
2	NC_018146	TCC	2	6	957	962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677587
3	NC_018146	CTG	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677587
4	NC_018146	GAA	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677587
5	NC_018146	CAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677587
6	NC_018146	TCA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677587
7	NC_018146	TTG	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677588
8	NC_018146	TCT	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677588
9	NC_018146	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677588
10	NC_018146	TTG	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677588
11	NC_018146	CTT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677588
12	NC_018146	ATC	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677589
13	NC_018146	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677589
14	NC_018146	AGC	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677590
15	NC_018146	TTG	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677590
16	NC_018146	TTC	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677590
17	NC_018146	CTT	2	6	3033	3038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677590
18	NC_018146	CTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677591
19	NC_018146	TGG	2	6	3227	3232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677591
20	NC_018146	TGA	2	6	3281	3286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677591
21	NC_018146	AGA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677591
22	NC_018146	AGA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677592
23	NC_018146	GGC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677592
24	NC_018146	GCT	2	6	4948	4953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677592
25	NC_018146	CAT	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677592
26	NC_018146	TTA	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677592
27	NC_018146	CTT	3	9	5076	5084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677592
28	NC_018146	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
29	NC_018146	GTG	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677593
30	NC_018146	TGT	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677593
31	NC_018146	TCT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
32	NC_018146	TAT	2	6	6087	6092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677593
33	NC_018146	TGG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677593
34	NC_018146	TCC	3	9	6257	6265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677593
35	NC_018146	GGA	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677593
36	NC_018146	CTT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
37	NC_018146	ATC	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
38	NC_018146	TAA	2	6	6571	6576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677593
39	NC_018146	AAC	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677593
40	NC_018146	CAA	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677593
41	NC_018146	GCA	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677593
42	NC_018146	TCA	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
43	NC_018146	TCT	2	6	7008	7013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
44	NC_018146	CGG	2	6	7014	7019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677593
45	NC_018146	GCT	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677593
46	NC_018146	TGC	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677594
47	NC_018146	TTG	2	6	7433	7438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677594
48	NC_018146	CAG	2	6	7540	7545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677594
49	NC_018146	GAA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677594
50	NC_018146	TTC	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677594
51	NC_018146	CAG	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677595
52	NC_018146	AAT	2	6	7636	7641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677595
53	NC_018146	CAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677595
54	NC_018146	CGA	2	6	7658	7663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677595
55	NC_018146	CTC	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677595
56	NC_018146	ATG	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677595
57	NC_018146	TCG	2	6	7717	7722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677595
58	NC_018146	GTC	2	6	7734	7739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677595
59	NC_018146	TTG	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677595
60	NC_018146	GCT	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677596
61	NC_018146	ACG	2	6	8193	8198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677596
62	NC_018146	GTT	2	6	8250	8255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677596
63	NC_018146	TTC	2	6	8406	8411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677596
64	NC_018146	TCC	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677596
65	NC_018146	CGG	2	6	8512	8517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677596
66	NC_018146	TTC	2	6	8562	8567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677596
67	NC_018146	TTG	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677596
68	NC_018146	CTG	2	6	8813	8818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677596
69	NC_018146	ATC	3	9	8860	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677596
70	NC_018146	GCC	2	6	9062	9067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677596
71	NC_018146	CTT	2	6	9090	9095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677596
72	NC_018146	GAC	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677596
73	NC_018146	GCC	2	6	9221	9226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677596
74	NC_018146	AAC	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677596
75	NC_018146	TCA	2	6	9422	9427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677596
76	NC_018146	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677597
77	NC_018146	ATG	2	6	10695	10700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677597
78	NC_018146	CAT	2	6	10704	10709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677597
79	NC_018146	CAA	2	6	10725	10730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677597
80	NC_018146	CAG	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677597
81	NC_018146	AGA	3	9	10829	10837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677597
82	NC_018146	ATA	3	9	10960	10968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677597
83	NC_018146	AGA	2	6	11075	11080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677597
84	NC_018146	CTA	2	6	11276	11281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677597
85	NC_018146	AGA	2	6	11306	11311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677597
86	NC_018146	AAT	2	6	11324	11329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677597
87	NC_018146	ATT	2	6	11421	11426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677598
88	NC_018146	CTT	2	6	11618	11623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677598
89	NC_018146	GAC	2	6	11629	11634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677598
90	NC_018146	CAG	2	6	11666	11671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677598
91	NC_018146	GAA	2	6	11813	11818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677598
92	NC_018146	ATT	2	6	11924	11929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677598
93	NC_018146	GCA	2	6	12010	12015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677598
94	NC_018146	ATT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677598
95	NC_018146	TGA	2	6	12183	12188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677598
96	NC_018146	TAT	2	6	12368	12373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677598
97	NC_018146	CTT	2	6	12425	12430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677598
98	NC_018146	AAG	2	6	12452	12457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677598
99	NC_018146	AAT	2	6	12523	12528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677598
100	NC_018146	GCC	2	6	12583	12588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677598
101	NC_018146	CAA	2	6	12603	12608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677598
102	NC_018146	ATA	2	6	12620	12625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677598
103	NC_018146	AGA	2	6	12659	12664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677598
104	NC_018146	AAT	2	6	12702	12707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677598
105	NC_018146	AGC	2	6	12804	12809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677598
106	NC_018146	ATC	2	6	15267	15272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677599
107	NC_018146	ATC	2	6	15362	15367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677599
108	NC_018146	GAC	2	6	15380	15385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677599
109	NC_018146	GCC	2	6	16211	16216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677600
110	NC_018146	CTT	2	6	16284	16289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677600
111	NC_018146	CGC	2	6	16446	16451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677600
112	NC_018146	CTT	2	6	16452	16457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677600
113	NC_018146	TTA	2	6	16541	16546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677600
114	NC_018146	GAA	2	6	16600	16605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677600
115	NC_018146	CTG	2	6	16859	16864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677601
116	NC_018146	CAT	2	6	16928	16933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677601
117	NC_018146	GAA	4	12	17819	17830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677602
118	NC_018146	CGT	2	6	17892	17897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677602
119	NC_018146	TCA	2	6	17986	17991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677602
120	NC_018146	GAT	2	6	18041	18046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677602
121	NC_018146	AAT	2	6	18062	18067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677602

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.