MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 chromosome

Total Repeats: 33167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_017262	GC	3	6	2007106	2007111	0 %	0 %	50 %	50 %	384412627
33002	NC_017262	CGGCG	2	10	2007117	2007126	0 %	0 %	60 %	40 %	384412627
33003	NC_017262	TCT	2	6	2007176	2007181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412627
33004	NC_017262	GCC	2	6	2007295	2007300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412627
33005	NC_017262	CCG	2	6	2007306	2007311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412627
33006	NC_017262	GCT	3	9	2007439	2007447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412627
33007	NC_017262	TCA	2	6	2007803	2007808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412628
33008	NC_017262	GAT	2	6	2007860	2007865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412628
33009	NC_017262	TCA	2	6	2007991	2007996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412628
33010	NC_017262	GCC	2	6	2008001	2008006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412628
33011	NC_017262	G	6	6	2008049	2008054	0 %	0 %	100 %	0 %	384412628
33012	NC_017262	CAT	2	6	2008067	2008072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412628
33013	NC_017262	ATC	2	6	2008101	2008106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412628
33014	NC_017262	TCT	2	6	2008123	2008128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412628
33015	NC_017262	GAAA	2	8	2008759	2008766	75 %	0 %	25 %	0 %	384412629
33016	NC_017262	TGC	2	6	2008804	2008809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412629
33017	NC_017262	GCA	2	6	2008840	2008845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412629
33018	NC_017262	CT	3	6	2008865	2008870	0 %	50 %	0 %	50 %	384412629
33019	NC_017262	AAT	2	6	2008949	2008954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412629
33020	NC_017262	CGGTT	2	10	2008972	2008981	0 %	40 %	40 %	20 %	384412629
33021	NC_017262	TCGC	2	8	2009058	2009065	0 %	25 %	25 %	50 %	384412629
33022	NC_017262	A	6	6	2009081	2009086	100 %	0 %	0 %	0 %	384412629
33023	NC_017262	AGA	2	6	2009362	2009367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412629
33024	NC_017262	CAA	2	6	2009376	2009381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412629
33025	NC_017262	TTCTG	2	10	2009386	2009395	0 %	60 %	20 %	20 %	384412629
33026	NC_017262	TGCC	2	8	2009427	2009434	0 %	25 %	25 %	50 %	384412629
33027	NC_017262	ATCA	2	8	2009462	2009469	50 %	25 %	0 %	25 %	384412629
33028	NC_017262	AAT	2	6	2009489	2009494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412629
33029	NC_017262	GCCT	2	8	2009554	2009561	0 %	25 %	25 %	50 %	384412629
33030	NC_017262	GAT	2	6	2010170	2010175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412630
33031	NC_017262	CG	3	6	2010213	2010218	0 %	0 %	50 %	50 %	384412630
33032	NC_017262	TGT	2	6	2010220	2010225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412630
33033	NC_017262	CGC	2	6	2010260	2010265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412630
33034	NC_017262	CGATG	2	10	2010363	2010372	20 %	20 %	40 %	20 %	384412630
33035	NC_017262	CGC	2	6	2010412	2010417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412630
33036	NC_017262	CAT	2	6	2010501	2010506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412630
33037	NC_017262	GCC	2	6	2010564	2010569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412630
33038	NC_017262	TTC	2	6	2010618	2010623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412630
33039	NC_017262	TAA	2	6	2010706	2010711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412630
33040	NC_017262	A	6	6	2010729	2010734	100 %	0 %	0 %	0 %	384412630
33041	NC_017262	TAGC	2	8	2010764	2010771	25 %	25 %	25 %	25 %	384412630
33042	NC_017262	AAT	2	6	2010851	2010856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412630
33043	NC_017262	AAT	2	6	2010865	2010870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412630
33044	NC_017262	AAT	2	6	2010882	2010887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412630
33045	NC_017262	GCC	2	6	2010901	2010906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412630
33046	NC_017262	CTT	2	6	2010908	2010913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412630
33047	NC_017262	ATC	2	6	2010951	2010956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412630
33048	NC_017262	TCA	2	6	2010995	2011000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412630
33049	NC_017262	CGA	2	6	2011081	2011086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412631
33050	NC_017262	AAC	3	9	2011157	2011165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412631
33051	NC_017262	TCA	3	9	2011212	2011220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412631
33052	NC_017262	TCCG	2	8	2011228	2011235	0 %	25 %	25 %	50 %	384412631
33053	NC_017262	ATC	2	6	2011313	2011318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412631
33054	NC_017262	GAC	2	6	2011337	2011342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412631
33055	NC_017262	AC	3	6	2011426	2011431	50 %	0 %	0 %	50 %	384412631
33056	NC_017262	TTC	2	6	2011514	2011519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412631
33057	NC_017262	ACCATC	2	12	2011541	2011552	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384412631
33058	NC_017262	T	7	7	2011578	2011584	0 %	100 %	0 %	0 %	384412631
33059	NC_017262	TC	3	6	2011728	2011733	0 %	50 %	0 %	50 %	384412631
33060	NC_017262	GCT	2	6	2011803	2011808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412631
33061	NC_017262	GGC	2	6	2011817	2011822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412631
33062	NC_017262	CAT	2	6	2011951	2011956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412631
33063	NC_017262	CGA	2	6	2012516	2012521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412632
33064	NC_017262	CGAA	2	8	2012575	2012582	50 %	0 %	25 %	25 %	384412632
33065	NC_017262	TGC	2	6	2012678	2012683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412632
33066	NC_017262	TCA	2	6	2012695	2012700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412632
33067	NC_017262	GCA	2	6	2012779	2012784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412632
33068	NC_017262	GAC	2	6	2012828	2012833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412632
33069	NC_017262	TCA	2	6	2012887	2012892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412632
33070	NC_017262	ACG	2	6	2012898	2012903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412632
33071	NC_017262	ATA	2	6	2012928	2012933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412632
33072	NC_017262	TGCTT	2	10	2012947	2012956	0 %	60 %	20 %	20 %	384412632
33073	NC_017262	ACG	2	6	2013024	2013029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412632
33074	NC_017262	GAC	2	6	2013047	2013052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412632
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33077	NC_017262	CCG	2	6	2016817	2016822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412633
33078	NC_017262	CGA	2	6	2016823	2016828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412633
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33082	NC_017262	CTT	2	6	2017015	2017020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412633
33083	NC_017262	AT	3	6	2017024	2017029	50 %	50 %	0 %	0 %	384412633
33084	NC_017262	TTC	2	6	2017058	2017063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412633
33085	NC_017262	GGT	2	6	2017169	2017174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412633
33086	NC_017262	GCG	2	6	2017190	2017195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412633
33087	NC_017262	CTT	2	6	2017199	2017204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412633
33088	NC_017262	ATC	2	6	2017229	2017234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412633
33089	NC_017262	TTG	2	6	2017277	2017282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412633
33090	NC_017262	GCC	2	6	2017302	2017307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412633
33091	NC_017262	TTTGG	2	10	2017322	2017331	0 %	60 %	40 %	0 %	384412633
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33093	NC_017262	CTTTC	2	10	2017366	2017375	0 %	60 %	0 %	40 %	384412633
33094	NC_017262	CTGA	2	8	2017499	2017506	25 %	25 %	25 %	25 %	384412633
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33097	NC_017262	AG	3	6	2017787	2017792	50 %	0 %	50 %	0 %	384412633
33098	NC_017262	GAT	2	6	2017807	2017812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412633
33099	NC_017262	CGG	2	6	2017884	2017889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412633
33100	NC_017262	AAT	2	6	2017912	2017917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412633
33101	NC_017262	GCT	2	6	2017924	2017929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412633
33102	NC_017262	GCC	2	6	2018031	2018036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412633
33103	NC_017262	GGC	2	6	2018109	2018114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412633
33104	NC_017262	TTTCT	2	10	2018145	2018154	0 %	80 %	0 %	20 %	384412634
33105	NC_017262	CGA	2	6	2018193	2018198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412634
33106	NC_017262	A	6	6	2018228	2018233	100 %	0 %	0 %	0 %	384412634
33107	NC_017262	A	7	7	2018249	2018255	100 %	0 %	0 %	0 %	384412634
33108	NC_017262	ACC	2	6	2018282	2018287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412634
33109	NC_017262	T	7	7	2018288	2018294	0 %	100 %	0 %	0 %	384412634
33110	NC_017262	TCT	2	6	2018316	2018321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412634
33111	NC_017262	AAAT	2	8	2018334	2018341	75 %	25 %	0 %	0 %	384412634
33112	NC_017262	AAC	2	6	2018348	2018353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412634
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33114	NC_017262	GCT	2	6	2018716	2018721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412635
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33116	NC_017262	CAT	2	6	2018861	2018866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.