MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB01

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017180	ACAA	2	8	8	15	75 %	0 %	0 %	25 %	384410830
2	NC_017180	CTCA	2	8	70	77	25 %	25 %	0 %	50 %	384410830
3	NC_017180	TTAT	2	8	569	576	25 %	75 %	0 %	0 %	384410831
4	NC_017180	CAAC	2	8	1109	1116	50 %	0 %	0 %	50 %	384410831
5	NC_017180	TCTG	2	8	1977	1984	0 %	50 %	25 %	25 %	384410832
6	NC_017180	TGCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	384410832
7	NC_017180	GCCG	2	8	2590	2597	0 %	0 %	50 %	50 %	384410832
8	NC_017180	TGCC	2	8	2787	2794	0 %	25 %	25 %	50 %	384410832
9	NC_017180	GGTG	2	8	2847	2854	0 %	25 %	75 %	0 %	384410832
10	NC_017180	CGCC	2	8	2916	2923	0 %	0 %	25 %	75 %	384410832
11	NC_017180	GACC	2	8	3153	3160	25 %	0 %	25 %	50 %	384410832
12	NC_017180	TATT	2	8	3414	3421	25 %	75 %	0 %	0 %	384410832
13	NC_017180	ATGT	2	8	3931	3938	25 %	50 %	25 %	0 %	384410832
14	NC_017180	AGCT	2	8	4499	4506	25 %	25 %	25 %	25 %	384410832
15	NC_017180	GTAA	2	8	5991	5998	50 %	25 %	25 %	0 %	384410833
16	NC_017180	ATAA	3	12	6330	6341	75 %	25 %	0 %	0 %	384410833
17	NC_017180	AGGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	384410834
18	NC_017180	TCTT	2	8	7692	7699	0 %	75 %	0 %	25 %	384410834
19	NC_017180	GAAA	2	8	7872	7879	75 %	0 %	25 %	0 %	384410834
20	NC_017180	GTCA	2	8	7961	7968	25 %	25 %	25 %	25 %	384410834
21	NC_017180	CTAT	2	8	8009	8016	25 %	50 %	0 %	25 %	384410834
22	NC_017180	AAAT	2	8	9497	9504	75 %	25 %	0 %	0 %	384410834
23	NC_017180	CAGC	2	8	10400	10407	25 %	0 %	25 %	50 %	384410835
24	NC_017180	CCGG	2	8	10420	10427	0 %	0 %	50 %	50 %	384410835
25	NC_017180	CAGC	2	8	10627	10634	25 %	0 %	25 %	50 %	384410836
26	NC_017180	TGAT	2	8	10849	10856	25 %	50 %	25 %	0 %	384410836
27	NC_017180	AATT	2	8	13887	13894	50 %	50 %	0 %	0 %	384410839
28	NC_017180	AGTC	2	8	15214	15221	25 %	25 %	25 %	25 %	384410840
29	NC_017180	CATC	2	8	15734	15741	25 %	25 %	0 %	50 %	384410842
30	NC_017180	TTTG	2	8	15810	15817	0 %	75 %	25 %	0 %	384410842
31	NC_017180	CATG	2	8	16599	16606	25 %	25 %	25 %	25 %	384410843
32	NC_017180	AAAT	2	8	16858	16865	75 %	25 %	0 %	0 %	384410844
33	NC_017180	TCAT	2	8	17036	17043	25 %	50 %	0 %	25 %	384410844
34	NC_017180	CTGA	2	8	17590	17597	25 %	25 %	25 %	25 %	384410847
35	NC_017180	TTCT	2	8	18039	18046	0 %	75 %	0 %	25 %	384410848
36	NC_017180	TCAA	2	8	18770	18777	50 %	25 %	0 %	25 %	384410848
37	NC_017180	GAAA	2	8	18994	19001	75 %	0 %	25 %	0 %	384410848
38	NC_017180	TTAT	2	8	19231	19238	25 %	75 %	0 %	0 %	384410848
39	NC_017180	TCAA	2	8	19731	19738	50 %	25 %	0 %	25 %	384410849
40	NC_017180	CATA	2	8	20193	20200	50 %	25 %	0 %	25 %	384410849
41	NC_017180	AAGG	2	8	22835	22842	50 %	0 %	50 %	0 %	384410851
42	NC_017180	AACA	2	8	23042	23049	75 %	0 %	0 %	25 %	384410852
43	NC_017180	TGGA	2	8	23793	23800	25 %	25 %	50 %	0 %	384410853
44	NC_017180	GAGC	2	8	23910	23917	25 %	0 %	50 %	25 %	384410853
45	NC_017180	GTCA	2	8	23954	23961	25 %	25 %	25 %	25 %	384410853
46	NC_017180	TTGT	2	8	24129	24136	0 %	75 %	25 %	0 %	384410853
47	NC_017180	TCCA	2	8	27484	27491	25 %	25 %	0 %	50 %	384410855
48	NC_017180	CACC	2	8	27503	27510	25 %	0 %	0 %	75 %	384410855
49	NC_017180	AGTA	2	8	27771	27778	50 %	25 %	25 %	0 %	384410855
50	NC_017180	GGGA	2	8	28277	28284	25 %	0 %	75 %	0 %	384410855
51	NC_017180	CAAG	4	16	30925	30940	50 %	0 %	25 %	25 %	384410857
52	NC_017180	ACGC	2	8	31489	31496	25 %	0 %	25 %	50 %	384410857
53	NC_017180	GCCT	2	8	32051	32058	0 %	25 %	25 %	50 %	384410857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.