MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP02

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015716	GTA	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708712
2	NC_015716	AGA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708712
3	NC_015716	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708712
4	NC_015716	TTG	2	6	573	578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708712
5	NC_015716	TTA	2	6	614	619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708712
6	NC_015716	TCA	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708712
7	NC_015716	TAC	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708712
8	NC_015716	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708712
9	NC_015716	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708712
10	NC_015716	ATG	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708712
11	NC_015716	TAA	3	9	1057	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708712
12	NC_015716	TCA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708713
13	NC_015716	TGC	2	6	1314	1319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708713
14	NC_015716	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708713
15	NC_015716	TAT	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708714
16	NC_015716	CTT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708715
17	NC_015716	TTC	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
18	NC_015716	CGA	2	6	4725	4730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
19	NC_015716	ACG	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
20	NC_015716	GAC	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
21	NC_015716	ATC	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
22	NC_015716	CAG	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
23	NC_015716	GTC	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
24	NC_015716	TCA	3	9	5039	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
25	NC_015716	ATG	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708717
26	NC_015716	TCG	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
27	NC_015716	TCA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
28	NC_015716	TCT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
29	NC_015716	GAC	2	6	5254	5259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
30	NC_015716	CGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
31	NC_015716	ACG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
32	NC_015716	CAT	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
33	NC_015716	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
34	NC_015716	TAA	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708717
35	NC_015716	GGC	2	6	5677	5682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708717
36	NC_015716	GCT	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
37	NC_015716	TTC	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
38	NC_015716	ATA	2	6	5842	5847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708717
39	NC_015716	GCT	2	6	5866	5871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
40	NC_015716	CGG	3	9	6000	6008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708717
41	NC_015716	CTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
42	NC_015716	TCG	2	6	6095	6100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
43	NC_015716	CGT	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
44	NC_015716	TTC	2	6	6242	6247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
45	NC_015716	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
46	NC_015716	GAC	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
47	NC_015716	TCA	2	6	6333	6338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
48	NC_015716	TTG	2	6	6341	6346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
49	NC_015716	GAT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708717
50	NC_015716	TTG	2	6	6374	6379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
51	NC_015716	GCC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
52	NC_015716	CCG	2	6	6596	6601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
53	NC_015716	CGC	2	6	6667	6672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
54	NC_015716	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
55	NC_015716	CAA	2	6	6742	6747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708717
56	NC_015716	GAA	2	6	6760	6765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708717
57	NC_015716	GTT	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
58	NC_015716	CGC	2	6	6993	6998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
59	NC_015716	TGA	2	6	7092	7097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708717
60	NC_015716	TTG	2	6	7106	7111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
61	NC_015716	CAT	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
62	NC_015716	GTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
63	NC_015716	CAT	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
64	NC_015716	GCC	2	6	7427	7432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
65	NC_015716	TCA	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
66	NC_015716	ATC	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
67	NC_015716	TTG	2	6	7557	7562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
68	NC_015716	GTT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
69	NC_015716	CAT	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
70	NC_015716	GAT	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708718
71	NC_015716	CTT	2	6	7922	7927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708718
72	NC_015716	TGA	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708718
73	NC_015716	TCA	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
74	NC_015716	TTG	2	6	8106	8111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
75	NC_015716	CTT	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708718
76	NC_015716	CGT	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708718
77	NC_015716	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
78	NC_015716	TTG	2	6	8331	8336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
79	NC_015716	CGT	2	6	8362	8367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708718
80	NC_015716	TCG	2	6	8535	8540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708718
81	NC_015716	CTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708718
82	NC_015716	TAA	2	6	8733	8738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708719
83	NC_015716	GTC	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708719
84	NC_015716	CGA	2	6	8824	8829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708719
85	NC_015716	TTC	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708719
86	NC_015716	CAG	3	9	9018	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708719
87	NC_015716	ATA	2	6	9093	9098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708719
88	NC_015716	GGC	2	6	9122	9127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708719
89	NC_015716	CAT	2	6	9223	9228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708719
90	NC_015716	CCG	2	6	9244	9249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708719
91	NC_015716	TCA	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708719
92	NC_015716	ATC	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708719
93	NC_015716	GGA	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338708719
94	NC_015716	CGT	2	6	9554	9559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708719
95	NC_015716	GTT	2	6	9620	9625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708719
96	NC_015716	TGT	2	6	9742	9747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708719
97	NC_015716	GTA	2	6	9755	9760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708719
98	NC_015716	CAC	2	6	9854	9859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338708719
99	NC_015716	CAG	2	6	9872	9877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708719
100	NC_015716	CGC	2	6	9893	9898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708719
101	NC_015716	ATG	2	6	9920	9925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708720
102	NC_015716	GAT	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708720
103	NC_015716	GGC	2	6	10087	10092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708720
104	NC_015716	TCA	2	6	10128	10133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708720
105	NC_015716	CTT	2	6	10177	10182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708720
106	NC_015716	CGC	2	6	10194	10199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708720
107	NC_015716	GTT	2	6	10318	10323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708720
108	NC_015716	CGA	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708720
109	NC_015716	CGC	2	6	10393	10398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708720
110	NC_015716	CCG	2	6	10476	10481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708720
111	NC_015716	GTC	2	6	10576	10581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708720
112	NC_015716	CGC	2	6	10608	10613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708720
113	NC_015716	GAA	2	6	10702	10707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708720
114	NC_015716	ATG	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708720
115	NC_015716	CTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708720
116	NC_015716	GCA	3	9	10749	10757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708720
117	NC_015716	TTG	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708720
118	NC_015716	CGC	2	6	10863	10868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708720
119	NC_015716	GGC	2	6	10885	10890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708720
120	NC_015716	TGT	2	6	10941	10946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708720
121	NC_015716	CCA	2	6	11166	11171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338708720
122	NC_015716	TCA	2	6	11237	11242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708720
123	NC_015716	TGA	2	6	11244	11249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708720
124	NC_015716	TGA	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708720
125	NC_015716	AGA	2	6	11331	11336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708720
126	NC_015716	GTT	2	6	11430	11435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708720
127	NC_015716	GCC	2	6	11523	11528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708721
128	NC_015716	TCA	2	6	11608	11613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708721
129	NC_015716	ATG	2	6	11620	11625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708721
130	NC_015716	CTT	2	6	13959	13964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708723
131	NC_015716	TCT	2	6	14037	14042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708723
132	NC_015716	TTC	2	6	14046	14051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708723
133	NC_015716	TAA	2	6	14059	14064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708723
134	NC_015716	TAT	2	6	14213	14218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708723
135	NC_015716	AAT	2	6	14264	14269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708723
136	NC_015716	ATC	2	6	14286	14291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708723
137	NC_015716	CTA	2	6	14510	14515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708723
138	NC_015716	GCA	2	6	14566	14571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708723
139	NC_015716	TAA	2	6	14762	14767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708723
140	NC_015716	ACC	2	6	14811	14816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338708723
141	NC_015716	CTT	2	6	14854	14859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708723
142	NC_015716	CTT	2	6	14957	14962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708723
143	NC_015716	TGC	2	6	14980	14985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708723
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145	NC_015716	AGT	2	6	15026	15031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708723
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147	NC_015716	TAC	2	6	15218	15223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708723
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149	NC_015716	CAA	2	6	15611	15616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708723
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151	NC_015716	ATT	2	6	15712	15717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708723
152	NC_015716	ATA	2	6	15811	15816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708723
153	NC_015716	TCA	2	6	15817	15822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708723
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155	NC_015716	ATG	2	6	15926	15931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708723
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158	NC_015716	TCT	2	6	16123	16128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708724
159	NC_015716	TGT	2	6	16148	16153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708724
160	NC_015716	TAT	2	6	16212	16217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708724
161	NC_015716	CAT	3	9	16482	16490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708724
162	NC_015716	GAT	2	6	16545	16550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708724
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204	NC_015716	AGA	2	6	26633	26638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708731
205	NC_015716	TCG	2	6	27034	27039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708732
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240	NC_015716	CTG	2	6	30351	30356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708739
241	NC_015716	TCA	2	6	30646	30651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708740
242	NC_015716	GAC	2	6	30675	30680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708740
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244	NC_015716	TTA	2	6	30820	30825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708740
245	NC_015716	GAT	2	6	30838	30843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708740
246	NC_015716	GCT	3	9	30852	30860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708740
247	NC_015716	TGT	2	6	30921	30926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708740
248	NC_015716	CTT	2	6	30970	30975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708740
249	NC_015716	TGT	2	6	31049	31054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708740
250	NC_015716	GAT	2	6	31059	31064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708740
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252	NC_015716	AGA	2	6	31726	31731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708741
253	NC_015716	GAA	3	9	32073	32081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708742
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.