MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 chromosome

Total Repeats: 572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015709	ATGGTA	2	12	3797	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706996
2	NC_015709	TTAGCT	2	12	4072	4083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706996
3	NC_015709	CTTTGA	2	12	5808	5819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706997
4	NC_015709	ACAATT	2	12	7725	7736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338706999
5	NC_015709	GCGCAA	2	12	8602	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707000
6	NC_015709	TTTTAT	2	12	12592	12603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338707004
7	NC_015709	CTGTCG	2	12	14394	14405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707005
8	NC_015709	CGGGGG	2	12	16062	16073	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	338707006
9	NC_015709	TACTAA	2	12	22434	22445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707011
10	NC_015709	TCTTCA	2	12	23943	23954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338707013
11	NC_015709	CGGTAA	2	12	25894	25905	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338707015
12	NC_015709	CCCTAG	2	12	28846	28857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338707017
13	NC_015709	TCAATA	2	12	44885	44896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707032
14	NC_015709	AGCGGG	2	12	45118	45129	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338707032
15	NC_015709	CACCCT	2	12	45342	45353	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338707032
16	NC_015709	TATCAA	2	12	46271	46282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707033
17	NC_015709	AAGGAA	2	12	46907	46918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338707034
18	NC_015709	TGCCTT	2	12	47401	47412	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338707034
19	NC_015709	AACAAA	2	12	49729	49740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338707037
20	NC_015709	ATACCC	2	12	50129	50140	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338707037
21	NC_015709	CCTGAT	2	12	50800	50811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707037
22	NC_015709	TCTTGT	2	12	51702	51713	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338707038
23	NC_015709	GTCTTT	2	12	56120	56131	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338707042
24	NC_015709	TTCAGC	2	12	58012	58023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707044
25	NC_015709	ATCGAA	2	12	64666	64677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707049
26	NC_015709	TATTCC	2	12	77603	77614	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338707064
27	NC_015709	AGCTAA	2	12	78856	78867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707065
28	NC_015709	TTCTAT	2	12	82752	82763	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707068
29	NC_015709	TAAAAG	2	12	89241	89252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707073
30	NC_015709	GATTCT	2	12	90298	90309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338707074
31	NC_015709	TCAGGC	2	12	90763	90774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707076
32	NC_015709	TGTTCA	2	12	90851	90862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338707076
33	NC_015709	TGGATG	2	12	93770	93781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338707079
34	NC_015709	AACCTC	2	12	94987	94998	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338707081
35	NC_015709	TTTTAT	2	12	95478	95489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338707082
36	NC_015709	AATATC	2	12	96421	96432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707084
37	NC_015709	GGCCAA	2	12	118117	118128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707101
38	NC_015709	GGGAAG	2	12	118338	118349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338707101
39	NC_015709	GCGCTG	2	12	120350	120361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338707101
40	NC_015709	CAGAAG	2	12	124508	124519	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338707105
41	NC_015709	TCATAA	2	12	129438	129449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707109
42	NC_015709	GGGCAG	2	12	137033	137044	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338707115
43	NC_015709	GATGCG	2	12	137233	137244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338707115
44	NC_015709	ACAAGA	2	12	138620	138631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338707116
45	NC_015709	TCCCGT	2	12	139109	139120	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338707117
46	NC_015709	GAACAT	2	12	139274	139285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707117
47	NC_015709	TCTTAT	2	12	139491	139502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707118
48	NC_015709	CAGGGG	2	12	139817	139828	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338707118
49	NC_015709	AAAGAT	2	12	141408	141419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707119
50	NC_015709	AGATAA	2	12	141973	141984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707120
51	NC_015709	TCGTGT	2	12	143413	143424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338707120
52	NC_015709	TGATAA	2	12	143817	143828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338707121
53	NC_015709	GATATT	2	12	146380	146391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338707121
54	NC_015709	GCAACG	2	12	148531	148542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707122
55	NC_015709	CAAGAC	2	12	158034	158045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338707131
56	NC_015709	TGGATG	2	12	159520	159531	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338707132
57	NC_015709	GAAGGT	2	12	164273	164284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338707136
58	NC_015709	AGCCGC	2	12	166377	166388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338707140
59	NC_015709	CGGGTA	2	12	173244	173255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338707144
60	NC_015709	CGCCAC	2	12	175923	175934	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338707148
61	NC_015709	TAAGAA	2	12	184517	184528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707155
62	NC_015709	GTGCTT	2	12	185992	186003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338707157
63	NC_015709	GGCATT	2	12	196628	196639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338707168
64	NC_015709	ATTTCT	2	12	198997	199008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707169
65	NC_015709	CAATAG	2	12	199265	199276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707169
66	NC_015709	GTATTG	2	12	220117	220128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707182
67	NC_015709	AGCCTT	2	12	221495	221506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707183
68	NC_015709	ATTTTG	2	12	221914	221925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338707183
69	NC_015709	GAACAA	2	12	223254	223265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338707183
70	NC_015709	TTTATC	2	12	227969	227980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707186
71	NC_015709	GCTCTT	2	12	232558	232569	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338707190
72	NC_015709	GATAAC	2	12	242598	242609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707198
73	NC_015709	ACCCCT	2	12	246570	246581	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338707199
74	NC_015709	AGGACG	2	12	252316	252327	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338707207
75	NC_015709	TTAGAA	2	12	254994	255005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338707209
76	NC_015709	ACTATC	2	12	262029	262040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338707220
77	NC_015709	ACCTTA	2	12	265345	265356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338707223
78	NC_015709	CCTGTT	2	12	267290	267301	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338707224
79	NC_015709	GCAATA	2	12	272211	272222	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707228
80	NC_015709	GCAACC	2	12	276895	276906	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338707232
81	NC_015709	GACATC	2	12	285357	285368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338707240
82	NC_015709	CCCATC	2	12	286611	286622	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338707241
83	NC_015709	TCTGGT	2	12	287925	287936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338707242
84	NC_015709	GTAATG	2	12	290146	290157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338707246
85	NC_015709	CCGTGA	2	12	303847	303858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707259
86	NC_015709	GCAATA	2	12	308721	308732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707264
87	NC_015709	TTGTAA	2	12	309275	309286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338707264
88	NC_015709	ATGGCC	2	12	311101	311112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707266
89	NC_015709	CTTCGG	2	12	312418	312429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707268
90	NC_015709	CTTCAG	2	12	312499	312510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707268
91	NC_015709	ATACCG	2	12	314659	314670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338707269
92	NC_015709	AGCCAG	2	12	317982	317993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707271
93	NC_015709	GCAGCG	2	12	322328	322339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338707276
94	NC_015709	GCGAAG	2	12	331736	331747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338707286
95	NC_015709	TTATGG	2	12	331851	331862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707286
96	NC_015709	ATCGCT	2	12	334026	334037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707287
97	NC_015709	TATTGG	2	12	334133	334144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707287
98	NC_015709	TGTTTA	2	12	342936	342947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338707293
99	NC_015709	TTTCAA	2	12	344888	344899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338707295
100	NC_015709	CGTTTA	2	12	353204	353215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338707301
101	NC_015709	GTTCCG	2	12	358210	358221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707307
102	NC_015709	ATGGTT	2	12	362464	362475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338707312
103	NC_015709	TGATCG	3	18	366145	366162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338707316
104	NC_015709	TAGAAA	2	12	368726	368737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338707317
105	NC_015709	AGTAAT	2	12	379002	379013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338707325
106	NC_015709	TTTAAT	2	12	380319	380330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338707327
107	NC_015709	ATCGAA	2	12	383321	383332	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707332
108	NC_015709	TTCTCC	2	12	385379	385390	0 %	50 %	0 %	50 %	338707335
109	NC_015709	CATCGG	2	12	385784	385795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707336
110	NC_015709	TACCTC	2	12	389421	389432	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338707337
111	NC_015709	AACGGT	2	12	394955	394966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338707341
112	NC_015709	ATGACA	2	12	396979	396990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707342
113	NC_015709	CCTTTA	2	12	403379	403390	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338707347
114	NC_015709	TGATCT	2	12	405885	405896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338707348
115	NC_015709	CACCTA	2	12	406177	406188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338707348
116	NC_015709	TAAAAA	2	12	408003	408014	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338707350
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226	NC_015709	CAACAT	2	12	756099	756110	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338707644
227	NC_015709	AAAGCC	2	12	757667	757678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338707646
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229	NC_015709	ATTTTT	2	12	760196	760207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338707648
230	NC_015709	CTTGCA	2	12	763472	763483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338707651
231	NC_015709	TGGCCG	2	12	764708	764719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338707652
232	NC_015709	GAAAAA	2	12	765024	765035	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338707652
233	NC_015709	GCTGAG	2	12	765102	765113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338707652
234	NC_015709	TGCACG	2	12	765344	765355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338707652
235	NC_015709	TCGCGG	2	12	766241	766252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338707652
236	NC_015709	GCTCGT	2	12	766458	766469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338707652
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259	NC_015709	CTTTAT	2	12	838108	838119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707721
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331	NC_015709	AGTTTT	2	12	1096545	1096556	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338707924
332	NC_015709	CCGATA	2	12	1097468	1097479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338707925
333	NC_015709	TGAAGG	2	12	1097790	1097801	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338707925
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335	NC_015709	AGCCAA	2	12	1100914	1100925	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338707929
336	NC_015709	CCCGCC	2	12	1104037	1104048	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	338707930
337	NC_015709	GCCTCT	2	12	1119778	1119789	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338707944
338	NC_015709	CAGATT	2	12	1120169	1120180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338707944
339	NC_015709	ATTTTC	2	12	1130166	1130177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707954
340	NC_015709	AGGGGT	2	12	1131315	1131326	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338707955
341	NC_015709	TATTTG	2	12	1132547	1132558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338707955
342	NC_015709	CTGGGA	2	12	1137185	1137196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338707958
343	NC_015709	GAAATC	2	12	1137558	1137569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707959
344	NC_015709	TTATCC	2	12	1137908	1137919	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338707959
345	NC_015709	TCAATA	2	12	1138607	1138618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338707960
346	NC_015709	TCGGCC	2	12	1139036	1139047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338707960
347	NC_015709	ACGGCA	2	12	1144903	1144914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338707964
348	NC_015709	CGTAAA	2	12	1145311	1145322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338707964
349	NC_015709	ACTACC	2	12	1153691	1153702	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338707969
350	NC_015709	GAAGAG	2	12	1153770	1153781	50 %	0 %	50 %	0 %	338707969
351	NC_015709	AATCGC	2	12	1155155	1155166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338707970
352	NC_015709	TTTTAA	2	12	1160173	1160184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338707973
353	NC_015709	AAGGTC	2	12	1161441	1161452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338707974
354	NC_015709	TTCATT	2	12	1164398	1164409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338707976
355	NC_015709	CGATCC	2	12	1171141	1171152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338707980
356	NC_015709	CGCTGC	2	12	1173682	1173693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338707983
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360	NC_015709	GTTGCT	2	12	1197717	1197728	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338708001
361	NC_015709	GAATAC	2	12	1205400	1205411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338708007
362	NC_015709	TAGGCC	2	12	1207499	1207510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338708009
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364	NC_015709	CAGATC	2	12	1216394	1216405	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338708019
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438	NC_015709	TTTGTC	2	12	1500607	1500618	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338708253
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440	NC_015709	TCTATT	2	12	1501189	1501200	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338708254
441	NC_015709	TTTATC	2	12	1503067	1503078	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338708256
442	NC_015709	AATATC	2	12	1503898	1503909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338708256
443	NC_015709	GCTGGC	2	12	1508848	1508859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338708262
444	NC_015709	CTTAAT	2	12	1516978	1516989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338708273
445	NC_015709	TATCAT	2	12	1523450	1523461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338708277
446	NC_015709	AATTTC	2	12	1538504	1538515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338708294
447	NC_015709	TGCTAC	2	12	1540079	1540090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338708296
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449	NC_015709	TGGTGA	2	12	1553249	1553260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338708307
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451	NC_015709	GTGACA	2	12	1556832	1556843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338708311
452	NC_015709	ACTTCG	2	12	1557999	1558010	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338708311
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