MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Zunongwangia profunda SM-A87 chromosome

Total Repeats: 1976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014041	TTTTAT	2	12	1468	1479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295131885
2	NC_014041	GGAGCG	2	12	2766	2777	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	295131886
3	NC_014041	GGTTTT	2	12	3628	3639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295131886
4	NC_014041	GGAAAA	2	12	5126	5137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295131887
5	NC_014041	CTTTTC	2	12	6884	6895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295131888
6	NC_014041	ATTATG	2	12	9799	9810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295131890
7	NC_014041	ATGAAT	2	12	9904	9915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295131890
8	NC_014041	AAGATG	2	12	13945	13956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295131895
9	NC_014041	ACCATA	2	12	15450	15461	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	295131896
10	NC_014041	TACCGC	2	12	16011	16022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295131897
11	NC_014041	AAGGAT	2	12	25547	25558	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295131906
12	NC_014041	TTCCAG	2	12	25646	25657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295131906
13	NC_014041	TCTTTT	2	12	28213	28224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295131910
14	NC_014041	CTTTTT	2	12	28864	28875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295131911
15	NC_014041	CAAAAA	2	12	30531	30542	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	295131911
16	NC_014041	GCAGCC	2	12	32375	32386	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	295131913
17	NC_014041	AAGAAC	2	12	36122	36133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	295131916
18	NC_014041	ATTTTA	2	12	38154	38165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295131919
19	NC_014041	GGTACA	2	12	38905	38916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295131919
20	NC_014041	GATCCA	2	12	39649	39660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295131920
21	NC_014041	GGTGTA	2	12	40795	40806	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	295131920
22	NC_014041	GAAAAA	2	12	42682	42693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295131923
23	NC_014041	GCATTT	2	12	43477	43488	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295131923
24	NC_014041	TTTTAA	2	12	50435	50446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295131929
25	NC_014041	AAGTTT	2	12	56016	56027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295131936
26	NC_014041	TCGCAT	2	12	57175	57186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295131937
27	NC_014041	TATTTT	2	12	59206	59217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295131939
28	NC_014041	AGCTTT	2	12	61152	61163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295131940
29	NC_014041	TTTTGT	2	12	63212	63223	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	295131943
30	NC_014041	TAATTT	3	18	64562	64579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295131944
31	NC_014041	ATTTTA	2	12	64969	64980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295131946
32	NC_014041	AATGAA	2	12	80649	80660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295131962
33	NC_014041	ATTTTT	2	12	82240	82251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295131964
34	NC_014041	TCAATA	2	12	86286	86297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295131969
35	NC_014041	GAAAAA	2	12	89900	89911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295131973
36	NC_014041	TCTTTT	2	12	91351	91362	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295131975
37	NC_014041	AAAATC	2	12	96529	96540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	295131980
38	NC_014041	TAATCG	2	12	101460	101471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295131983
39	NC_014041	TCTTTA	2	12	103168	103179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295131985
40	NC_014041	TACATT	2	12	104817	104828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295131988
41	NC_014041	GCCACC	2	12	106848	106859	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	295131990
42	NC_014041	TTATCG	2	12	109916	109927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295131995
43	NC_014041	ACCAGA	2	12	116652	116663	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295132001
44	NC_014041	GCTGGC	2	12	117771	117782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295132002
45	NC_014041	GGTGAA	2	12	120516	120527	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	295132004
46	NC_014041	TTTTGA	2	12	121425	121436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295132005
47	NC_014041	CTGATG	2	12	121884	121895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295132005
48	NC_014041	AATTAA	2	12	122784	122795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295132006
49	NC_014041	GAAGGC	2	12	123191	123202	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295132006
50	NC_014041	ACAGGA	2	12	124022	124033	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295132007
51	NC_014041	ATTTTT	2	12	129287	129298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295132013
52	NC_014041	AAATTC	2	12	130730	130741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295132015
53	NC_014041	GTAAAC	2	12	132479	132490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132019
54	NC_014041	AATGTG	2	12	132818	132829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295132020
55	NC_014041	ACGGGA	2	12	136520	136531	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295132023
56	NC_014041	TCACCA	2	12	145497	145508	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295132031
57	NC_014041	ACAGGA	2	12	149851	149862	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295132037
58	NC_014041	GAAAAC	2	12	150077	150088	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	295132037
59	NC_014041	TCTGGT	2	12	153292	153303	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	295132041
60	NC_014041	ATACCT	2	12	154255	154266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295132042
61	NC_014041	TAGGTT	2	12	157117	157128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295132043
62	NC_014041	GCCAGA	3	18	158725	158742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295132047
63	NC_014041	CTTAGC	2	12	160357	160368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295132049
64	NC_014041	ATCGCT	2	12	165484	165495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295132054
65	NC_014041	GTTATA	2	12	167261	167272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295132055
66	NC_014041	TGTAGA	2	12	169640	169651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295132056
67	NC_014041	TGCAAA	2	12	169871	169882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132056
68	NC_014041	GCCAAA	2	12	171841	171852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295132057
69	NC_014041	GTGGAG	2	12	180044	180055	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	295132066
70	NC_014041	TTACGA	2	12	186745	186756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132072
71	NC_014041	ATCCTG	2	12	195822	195833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295132077
72	NC_014041	TATTGA	2	12	196403	196414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295132078
73	NC_014041	AAGATA	2	12	198359	198370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295132080
74	NC_014041	TAAAAT	2	12	201714	201725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295132081
75	NC_014041	TACCGA	2	12	201979	201990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295132081
76	NC_014041	AAGCAC	2	12	202973	202984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295132082
77	NC_014041	TAAACG	2	12	203242	203253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132082
78	NC_014041	TCGCAA	2	12	203373	203384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295132082
79	NC_014041	TTTTCT	2	12	205347	205358	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295132086
80	NC_014041	CTAATT	2	12	208026	208037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295132089
81	NC_014041	TTTTAA	2	12	214997	215008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295132098
82	NC_014041	ATTCCT	2	12	220556	220567	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	295132103
83	NC_014041	GATTGC	2	12	220641	220652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295132103
84	NC_014041	CTCCTG	2	12	225116	225127	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	295132104
85	NC_014041	TCTATT	2	12	225606	225617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295132105
86	NC_014041	TTCTTT	2	12	230498	230509	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295132109
87	NC_014041	TCAAAA	2	12	237366	237377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	295132115
88	NC_014041	CCTAAC	2	12	238489	238500	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295132117
89	NC_014041	ATTTGG	2	12	239129	239140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295132117
90	NC_014041	AGGAGC	2	12	239489	239500	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	295132117
91	NC_014041	AGATGT	2	12	240671	240682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295132119
92	NC_014041	AGAATT	2	12	241021	241032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295132119
93	NC_014041	ATCTAA	2	12	243711	243722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295132122
94	NC_014041	GGAAAT	2	12	250234	250245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	295132130
95	NC_014041	TATGGG	2	12	252622	252633	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	295132132
96	NC_014041	TTTCTT	2	12	253198	253209	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295132132
97	NC_014041	TTACTT	2	12	263217	263228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295132142
98	NC_014041	CGATAT	2	12	266993	267004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132147
99	NC_014041	GGTTTT	2	12	268295	268306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295132148
100	NC_014041	TCTTTA	2	12	271228	271239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	295132150
101	NC_014041	ACCATC	2	12	271830	271841	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295132150
102	NC_014041	CCATCA	2	12	271993	272004	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295132150
103	NC_014041	GATAAC	2	12	273534	273545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132151
104	NC_014041	TGATCC	2	12	282318	282329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295132157
105	NC_014041	CAAAAA	2	12	284587	284598	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	295132160
106	NC_014041	AAAGCA	2	12	286500	286511	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	295132162
107	NC_014041	GATTTC	2	12	287379	287390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295132163
108	NC_014041	ATATTT	2	12	288516	288527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295132164
109	NC_014041	CTGAAA	2	12	289114	289125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132165
110	NC_014041	AGAAAT	2	12	291075	291086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295132169
111	NC_014041	TTCTTT	2	12	292966	292977	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295132171
112	NC_014041	CTTGTT	2	12	293073	293084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295132171
113	NC_014041	TGTTAA	2	12	293224	293235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295132171
114	NC_014041	TAAATT	2	12	294147	294158	50 %	50 %	0 %	0 %	295132171
115	NC_014041	AAGAAA	2	12	296181	296192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295132172
116	NC_014041	TACGTT	2	12	296792	296803	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295132172
117	NC_014041	AAAGGC	2	12	297382	297393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295132173
118	NC_014041	TTTTGC	2	12	298050	298061	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295132173
119	NC_014041	GCTGAA	2	12	303124	303135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295132178
120	NC_014041	TTTCAG	2	12	305995	306006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295132180
121	NC_014041	TCCGCT	2	12	306100	306111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	295132180
122	NC_014041	CAAAAA	2	12	307128	307139	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	295132181
123	NC_014041	AAAGAA	2	12	307410	307421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	295132181
124	NC_014041	TTAAAT	2	12	308718	308729	50 %	50 %	0 %	0 %	295132183
125	NC_014041	GGCTTC	2	12	313211	313222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295132187
126	NC_014041	ATTGAT	2	12	314827	314838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295132189
127	NC_014041	ACTTTA	2	12	316617	316628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295132190
128	NC_014041	AAACTT	2	12	318420	318431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295132192
129	NC_014041	CGATGA	2	12	318826	318837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295132193
130	NC_014041	CGAAGC	2	12	320938	320949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295132195
131	NC_014041	GTTTGG	2	12	322461	322472	0 %	50 %	50 %	0 %	295132197
132	NC_014041	ACTATT	2	12	324571	324582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295132198
133	NC_014041	CAGGAC	2	12	326237	326248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295132200
134	NC_014041	CAGGAT	2	12	326363	326374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295132200
135	NC_014041	GATCAA	2	12	326396	326407	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132200
136	NC_014041	CAACCT	2	12	326447	326458	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295132200
137	NC_014041	AAAGCT	2	12	326552	326563	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295132200
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139	NC_014041	CTGAAG	2	12	339742	339753	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295132216
140	NC_014041	GTTTTT	2	12	341119	341130	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	295132218
141	NC_014041	TATCGA	2	12	343890	343901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132221
142	NC_014041	TTTTTC	2	12	345309	345320	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295132223
143	NC_014041	GTCTTT	2	12	345399	345410	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	295132223
144	NC_014041	AAGTTC	2	12	346658	346669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132224
145	NC_014041	TTTATT	2	12	346698	346709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295132224
146	NC_014041	TTTTCT	2	12	349199	349210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	295132225
147	NC_014041	CATCGA	2	12	350069	350080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295132226
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149	NC_014041	ATGGTG	2	12	358629	358640	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	295132230
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152	NC_014041	TTTGGG	2	12	363675	363686	0 %	50 %	50 %	0 %	295132234
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155	NC_014041	CAGGTA	2	12	380062	380073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295132244
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159	NC_014041	TTTGAT	2	12	388360	388371	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295132253
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164	NC_014041	AGCTAT	2	12	400585	400596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132262
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210	NC_014041	AATGTA	2	12	507766	507777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295132365
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218	NC_014041	TTGATT	2	12	525601	525612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	295132382
219	NC_014041	TTAAAA	2	12	527421	527432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295132385
220	NC_014041	ATATGA	2	12	528511	528522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295132386
221	NC_014041	ACCGGT	2	12	531753	531764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295132390
222	NC_014041	ATATAA	2	12	533953	533964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295132392
223	NC_014041	TTTCCT	2	12	534532	534543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295132393
224	NC_014041	ATCCAG	2	12	536645	536656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295132395
225	NC_014041	ATTTCA	2	12	536703	536714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295132395
226	NC_014041	GCAATG	2	12	540628	540639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295132397
227	NC_014041	CCCAAT	2	12	543888	543899	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	295132401
228	NC_014041	TCGATA	2	12	544148	544159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132401
229	NC_014041	AAATTA	2	12	546066	546077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295132401
230	NC_014041	GTAAAA	2	12	546206	546217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295132401
231	NC_014041	GCAGCT	2	12	548627	548638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295132402
232	NC_014041	TAGAAA	2	12	553679	553690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295132405
233	NC_014041	ATCAAT	2	12	558710	558721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295132407
234	NC_014041	GATATT	2	12	567753	567764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	295132418
235	NC_014041	TGATCA	2	12	575391	575402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295132425
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462	NC_014041	CACCGG	2	12	1096013	1096024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	295132875
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