MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1002

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013357	GTT	2	6	69	74	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738803
2	NC_013357	TGT	2	6	202	207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738803
3	NC_013357	CTT	2	6	296	301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738803
4	NC_013357	CCG	2	6	432	437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738803
5	NC_013357	CCT	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260738803
6	NC_013357	GTT	2	6	674	679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738803
7	NC_013357	GAT	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
8	NC_013357	TGT	2	6	751	756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738803
9	NC_013357	CAT	2	6	758	763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738803
10	NC_013357	ATC	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738803
11	NC_013357	ATG	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
12	NC_013357	ATT	2	6	978	983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738803
13	NC_013357	ACA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738803
14	NC_013357	CAA	2	6	1031	1036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738803
15	NC_013357	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738803
16	NC_013357	CGG	2	6	1085	1090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260738803
17	NC_013357	GAT	2	6	1097	1102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
18	NC_013357	GAT	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
19	NC_013357	GTC	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738803
20	NC_013357	AAT	2	6	1267	1272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738803
21	NC_013357	TGA	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
22	NC_013357	TCT	2	6	1381	1386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738803
23	NC_013357	GCT	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738803
24	NC_013357	AAC	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738803
25	NC_013357	GAT	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
26	NC_013357	CCA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738803
27	NC_013357	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738803
28	NC_013357	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738803
29	NC_013357	AAT	2	6	1927	1932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738803
30	NC_013357	ATA	2	6	1945	1950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738803
31	NC_013357	CCG	2	6	1963	1968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738803
32	NC_013357	ACA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738803
33	NC_013357	ATC	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738803
34	NC_013357	GAC	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738803
35	NC_013357	GCG	2	6	2200	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260738803
36	NC_013357	GAA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738803
37	NC_013357	GAT	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738803
38	NC_013357	CTG	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738803
39	NC_013357	GCC	2	6	2659	2664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738803
40	NC_013357	GTC	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738803
41	NC_013357	AAT	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738803
42	NC_013357	TCA	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738803
43	NC_013357	GCA	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738803
44	NC_013357	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738803
45	NC_013357	AAT	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738803
46	NC_013357	CCG	2	6	3040	3045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738803
47	NC_013357	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738803
48	NC_013357	TCC	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260738804
49	NC_013357	TCT	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738804
50	NC_013357	ATA	2	6	3480	3485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738804
51	NC_013357	GAT	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738804
52	NC_013357	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738804
53	NC_013357	AAT	2	6	3652	3657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738804
54	NC_013357	GCG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260738804
55	NC_013357	AGC	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738804
56	NC_013357	TCT	2	6	3777	3782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738804
57	NC_013357	ATA	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738804
58	NC_013357	CAG	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738804
59	NC_013357	TAA	2	6	4163	4168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738805
60	NC_013357	TAT	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738805
61	NC_013357	GAT	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738805
62	NC_013357	GCT	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738805
63	NC_013357	GCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738805
64	NC_013357	CTT	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738805
65	NC_013357	GAA	2	6	4745	4750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738805
66	NC_013357	GAA	2	6	4800	4805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738805
67	NC_013357	AAT	2	6	4949	4954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738805
68	NC_013357	CGC	2	6	4963	4968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738805
69	NC_013357	ATA	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738805
70	NC_013357	ATA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738805
71	NC_013357	TGA	2	6	5128	5133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738805
72	NC_013357	TTG	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738805
73	NC_013357	TTG	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738805
74	NC_013357	ATA	2	6	5249	5254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738805
75	NC_013357	ACT	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738805
76	NC_013357	GCA	2	6	5334	5339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738805
77	NC_013357	CAA	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738805
78	NC_013357	GGC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260738805
79	NC_013357	TGC	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738805
80	NC_013357	CAA	3	9	5640	5648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738805
81	NC_013357	CAT	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738805
82	NC_013357	ATT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738805
83	NC_013357	CAT	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738805
84	NC_013357	GCT	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738806
85	NC_013357	TGC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738806
86	NC_013357	GTA	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738806
87	NC_013357	GTC	2	6	5954	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738806
88	NC_013357	CGA	2	6	5966	5971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
89	NC_013357	ACC	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738806
90	NC_013357	ACC	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738806
91	NC_013357	CTT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738806
92	NC_013357	TCA	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738806
93	NC_013357	TAA	2	6	6387	6392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738806
94	NC_013357	AAC	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738806
95	NC_013357	ATC	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738806
96	NC_013357	ATC	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738806
97	NC_013357	GCA	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
98	NC_013357	CAG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
99	NC_013357	ATT	2	6	6873	6878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738806
100	NC_013357	TTG	2	6	7062	7067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738806
101	NC_013357	GCA	2	6	7115	7120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
102	NC_013357	GAC	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
103	NC_013357	CGA	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
104	NC_013357	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738806
105	NC_013357	CGT	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738806
106	NC_013357	GGT	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260738806
107	NC_013357	CCA	2	6	7408	7413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738806
108	NC_013357	ACT	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738807
109	NC_013357	TAA	2	6	7788	7793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738807
110	NC_013357	AAG	2	6	7868	7873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738807
111	NC_013357	TGC	2	6	7894	7899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738807
112	NC_013357	CCG	2	6	7922	7927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738807
113	NC_013357	CAA	2	6	8074	8079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738807
114	NC_013357	CAA	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738807
115	NC_013357	TGC	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738807
116	NC_013357	ATT	2	6	8285	8290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738807
117	NC_013357	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738807
118	NC_013357	CGC	2	6	8512	8517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738807
119	NC_013357	AGA	2	6	8543	8548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738807
120	NC_013357	GTT	2	6	8634	8639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738807
121	NC_013357	GTA	2	6	8652	8657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738807
122	NC_013357	ATA	2	6	8666	8671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738807
123	NC_013357	CGC	2	6	8725	8730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738807
124	NC_013357	CTG	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738807
125	NC_013357	GCC	2	6	9011	9016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738807
126	NC_013357	CCA	2	6	9092	9097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738807
127	NC_013357	GCC	2	6	9107	9112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738807
128	NC_013357	TAT	2	6	9115	9120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738807
129	NC_013357	CAG	2	6	9154	9159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738807
130	NC_013357	CGC	2	6	9346	9351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260738807
131	NC_013357	GAA	2	6	9438	9443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738807
132	NC_013357	TCT	2	6	9453	9458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738807
133	NC_013357	AAC	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738807
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145	NC_013357	TTC	2	6	11264	11269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738809
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.