MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.01

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018146	TGCC	2	8	189	196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018146	CCGG	2	8	607	614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018146	ATCA	2	8	1228	1235	50 %	25 %	0 %	25 %	397677587
4	NC_018146	GATG	2	8	1927	1934	25 %	25 %	50 %	0 %	397677588
5	NC_018146	ATAG	2	8	2664	2671	50 %	25 %	25 %	0 %	397677589
6	NC_018146	GGTC	2	8	3351	3358	0 %	25 %	50 %	25 %	397677591
7	NC_018146	CTGC	2	8	4025	4032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018146	TCCC	2	8	4095	4102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_018146	TCTA	2	8	4781	4788	25 %	50 %	0 %	25 %	397677592
10	NC_018146	TTAT	2	8	5564	5571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018146	AAGA	2	8	5572	5579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018146	ATTT	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018146	CTTT	2	8	5750	5757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018146	GTTA	2	8	5822	5829	25 %	50 %	25 %	0 %	397677593
15	NC_018146	CTGC	2	8	6484	6491	0 %	25 %	25 %	50 %	397677593
16	NC_018146	ATTG	2	8	6766	6773	25 %	50 %	25 %	0 %	397677593
17	NC_018146	GCGA	2	8	7325	7332	25 %	0 %	50 %	25 %	397677594
18	NC_018146	CAAA	2	8	7618	7625	75 %	0 %	0 %	25 %	397677595
19	NC_018146	GCGT	2	8	8777	8784	0 %	25 %	50 %	25 %	397677596
20	NC_018146	CGCA	2	8	9252	9259	25 %	0 %	25 %	50 %	397677596
21	NC_018146	AAGG	2	8	9300	9307	50 %	0 %	50 %	0 %	397677596
22	NC_018146	CGCA	2	8	9308	9315	25 %	0 %	25 %	50 %	397677596
23	NC_018146	AAGG	2	8	9502	9509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018146	GAAG	2	8	9536	9543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018146	AGGA	2	8	9696	9703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018146	CCTT	2	8	9919	9926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018146	ACTT	2	8	10370	10377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018146	CCAT	2	8	10735	10742	25 %	25 %	0 %	50 %	397677597
29	NC_018146	GTTT	2	8	10783	10790	0 %	75 %	25 %	0 %	397677597
30	NC_018146	ACTT	2	8	11393	11400	25 %	50 %	0 %	25 %	397677598
31	NC_018146	AAAG	2	8	11446	11453	75 %	0 %	25 %	0 %	397677598
32	NC_018146	CAAT	2	8	11594	11601	50 %	25 %	0 %	25 %	397677598
33	NC_018146	TTAA	2	8	11890	11897	50 %	50 %	0 %	0 %	397677598
34	NC_018146	GATA	2	8	12216	12223	50 %	25 %	25 %	0 %	397677598
35	NC_018146	TGAA	2	8	12266	12273	50 %	25 %	25 %	0 %	397677598
36	NC_018146	TTTC	3	12	12311	12322	0 %	75 %	0 %	25 %	397677598
37	NC_018146	ACAA	2	8	13601	13608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018146	GTAC	2	8	13619	13626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018146	CATT	2	8	13650	13657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018146	CGTC	2	8	13708	13715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018146	AAAC	2	8	13958	13965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018146	TATT	2	8	14391	14398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018146	ATTC	2	8	14622	14629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018146	CAAC	2	8	15029	15036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018146	CAAT	2	8	16160	16167	50 %	25 %	0 %	25 %	397677600
46	NC_018146	ATTT	2	8	16615	16622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018146	AAGA	2	8	16667	16674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018146	CTTT	2	8	17037	17044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018146	GTTT	2	8	17302	17309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018146	TTGA	2	8	17711	17718	25 %	50 %	25 %	0 %	397677602
51	NC_018146	TGCT	2	8	17767	17774	0 %	50 %	25 %	25 %	397677602
52	NC_018146	CAAA	2	8	17946	17953	75 %	0 %	0 %	25 %	397677602
53	NC_018146	TATT	2	8	18094	18101	25 %	75 %	0 %	0 %	397677602

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.