MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	GGGA	2	8	531	538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017183	CGAT	2	8	566	573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017183	ACCT	2	8	638	645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017183	ACCG	2	8	844	851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017183	GGCG	2	8	1265	1272	0 %	0 %	75 %	25 %	384410889
6	NC_017183	TCGA	2	8	1321	1328	25 %	25 %	25 %	25 %	384410889
7	NC_017183	CTGA	2	8	1509	1516	25 %	25 %	25 %	25 %	384410889
8	NC_017183	AGAC	2	8	1879	1886	50 %	0 %	25 %	25 %	384410889
9	NC_017183	CTAC	2	8	1906	1913	25 %	25 %	0 %	50 %	384410889
10	NC_017183	TTTG	2	8	2638	2645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017183	CCCG	2	8	3647	3654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017183	GGTT	2	8	3734	3741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017183	CAAG	2	8	5197	5204	50 %	0 %	25 %	25 %	384410890
14	NC_017183	CAGA	2	8	6021	6028	50 %	0 %	25 %	25 %	384410890
15	NC_017183	GGCA	2	8	6494	6501	25 %	0 %	50 %	25 %	384410890
16	NC_017183	CAGG	2	8	6608	6615	25 %	0 %	50 %	25 %	384410890
17	NC_017183	CGTT	2	8	6834	6841	0 %	50 %	25 %	25 %	384410890
18	NC_017183	AAAT	2	8	6997	7004	75 %	25 %	0 %	0 %	384410890
19	NC_017183	CGTC	2	8	7642	7649	0 %	25 %	25 %	50 %	384410890
20	NC_017183	GACC	2	8	7748	7755	25 %	0 %	25 %	50 %	384410890
21	NC_017183	ACCT	2	8	8040	8047	25 %	25 %	0 %	50 %	384410891
22	NC_017183	CTTC	2	8	8542	8549	0 %	50 %	0 %	50 %	384410891
23	NC_017183	CCCG	2	8	9079	9086	0 %	0 %	25 %	75 %	384410891
24	NC_017183	CTGA	2	8	9273	9280	25 %	25 %	25 %	25 %	384410891
25	NC_017183	GGAT	2	8	9422	9429	25 %	25 %	50 %	0 %	384410892
26	NC_017183	TGGC	2	8	9993	10000	0 %	25 %	50 %	25 %	384410892
27	NC_017183	GATC	2	8	10504	10511	25 %	25 %	25 %	25 %	384410892
28	NC_017183	GCGG	2	8	10797	10804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017183	TGCA	2	8	10910	10917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017183	CGTT	2	8	11311	11318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017183	GTAA	2	8	11752	11759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017183	TATC	2	8	11777	11784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017183	TTTC	2	8	11961	11968	0 %	75 %	0 %	25 %	384410893
34	NC_017183	ATCC	2	8	12320	12327	25 %	25 %	0 %	50 %	384410893
35	NC_017183	TCCA	2	8	12848	12855	25 %	25 %	0 %	50 %	384410893
36	NC_017183	CAAG	2	8	13467	13474	50 %	0 %	25 %	25 %	384410893
37	NC_017183	ATAA	2	8	13891	13898	75 %	25 %	0 %	0 %	384410893
38	NC_017183	CCTT	2	8	14021	14028	0 %	50 %	0 %	50 %	384410893
39	NC_017183	TGTT	2	8	14312	14319	0 %	75 %	25 %	0 %	384410893
40	NC_017183	AAAT	2	8	14455	14462	75 %	25 %	0 %	0 %	384410893
41	NC_017183	TCGT	2	8	14596	14603	0 %	50 %	25 %	25 %	384410893
42	NC_017183	CATC	2	8	14930	14937	25 %	25 %	0 %	50 %	384410893
43	NC_017183	TAAA	2	8	15174	15181	75 %	25 %	0 %	0 %	384410893
44	NC_017183	ACGA	2	8	15727	15734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017183	ATCT	2	8	15741	15748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017183	TCAA	2	8	16189	16196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017183	AGTC	2	8	16592	16599	25 %	25 %	25 %	25 %	384410895
48	NC_017183	CGGG	2	8	16762	16769	0 %	0 %	75 %	25 %	384410895
49	NC_017183	AACC	2	8	17535	17542	50 %	0 %	0 %	50 %	384410897
50	NC_017183	AGGC	2	8	17754	17761	25 %	0 %	50 %	25 %	384410897
51	NC_017183	TAAA	2	8	17859	17866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017183	TTTG	2	8	19127	19134	0 %	75 %	25 %	0 %	384410898
53	NC_017183	ATGT	2	8	19562	19569	25 %	50 %	25 %	0 %	384410898
54	NC_017183	TTCA	2	8	19780	19787	25 %	50 %	0 %	25 %	384410898
55	NC_017183	GTAA	2	8	19833	19840	50 %	25 %	25 %	0 %	384410898
56	NC_017183	GCCT	2	8	21414	21421	0 %	25 %	25 %	50 %	384410901
57	NC_017183	TCAC	2	8	21661	21668	25 %	25 %	0 %	50 %	384410901
58	NC_017183	GACT	2	8	21861	21868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017183	CGCC	2	8	22883	22890	0 %	0 %	25 %	75 %	384410902
60	NC_017183	AGAA	2	8	23757	23764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017183	TTAA	2	8	23780	23787	50 %	50 %	0 %	0 %	384410903
62	NC_017183	AAAC	2	8	24591	24598	75 %	0 %	0 %	25 %	384410905
63	NC_017183	TTCA	2	8	25026	25033	25 %	50 %	0 %	25 %	384410905
64	NC_017183	TTTC	2	8	25205	25212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017183	TCAA	2	8	25221	25228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017183	CTGA	2	8	25995	26002	25 %	25 %	25 %	25 %	384410908
67	NC_017183	GAAA	2	8	27573	27580	75 %	0 %	25 %	0 %	384410909
68	NC_017183	TATT	2	8	28117	28124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017183	GGAT	2	8	28335	28342	25 %	25 %	50 %	0 %	384410910
70	NC_017183	AAGC	2	8	28428	28435	50 %	0 %	25 %	25 %	384410910
71	NC_017183	GATG	2	8	28550	28557	25 %	25 %	50 %	0 %	384410911
72	NC_017183	GTAC	2	8	29096	29103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017183	AAGG	2	8	29126	29133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017183	GAAG	2	8	29160	29167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017183	CTAT	2	8	29492	29499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017183	CATG	2	8	29612	29619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017183	ACGC	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017183	AAGA	2	8	30635	30642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017183	TTAT	2	8	31120	31127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017183	TGGG	2	8	31186	31193	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017183	ATAA	2	8	31296	31303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017183	GCCA	2	8	31702	31709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.