MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	GCT	2	6	7	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017183	GCA	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410888
3	NC_017183	TCT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017183	TGT	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017183	GGT	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017183	CCG	2	6	649	654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017183	GCC	2	6	678	683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017183	ACC	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017183	TGC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017183	CAA	2	6	962	967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017183	GAA	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410889
12	NC_017183	TGG	2	6	1048	1053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410889
13	NC_017183	GCG	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
14	NC_017183	TGG	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410889
15	NC_017183	TCG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410889
16	NC_017183	CAG	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410889
17	NC_017183	GCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
18	NC_017183	CGC	2	6	1673	1678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410889
19	NC_017183	GAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410889
20	NC_017183	TCC	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410889
21	NC_017183	GCG	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
22	NC_017183	CGA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410889
23	NC_017183	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017183	CTG	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017183	GCA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017183	CAG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017183	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017183	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017183	TCT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017183	CAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017183	GCT	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017183	AGG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017183	CCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017183	ATA	2	6	3602	3607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017183	AAC	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017183	TTC	2	6	3750	3755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017183	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017183	AAT	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017183	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017183	GTG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017183	TCT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017183	TAA	2	6	4466	4471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017183	TGC	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017183	GCT	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
45	NC_017183	TGA	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
46	NC_017183	GAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
47	NC_017183	AGG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
48	NC_017183	TGC	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
49	NC_017183	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
50	NC_017183	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
51	NC_017183	GAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
52	NC_017183	GCC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410890
53	NC_017183	GCT	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
54	NC_017183	TGG	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
55	NC_017183	CGA	2	6	5300	5305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
56	NC_017183	CTG	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
57	NC_017183	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410890
58	NC_017183	GGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
59	NC_017183	CCG	2	6	5696	5701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410890
60	NC_017183	AAC	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410890
61	NC_017183	GTA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
62	NC_017183	CGA	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
63	NC_017183	TGC	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
64	NC_017183	TGC	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
65	NC_017183	GAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
66	NC_017183	AGT	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
67	NC_017183	ACC	2	6	6461	6466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410890
68	NC_017183	AGC	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
69	NC_017183	CGA	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
70	NC_017183	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410890
71	NC_017183	GCA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
72	NC_017183	TGG	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
73	NC_017183	AAG	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
74	NC_017183	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
75	NC_017183	TGC	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
76	NC_017183	GAA	2	6	6791	6796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
77	NC_017183	GAT	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
78	NC_017183	AGG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
79	NC_017183	CGT	3	9	7076	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
80	NC_017183	ATG	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
81	NC_017183	AGC	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
82	NC_017183	AAG	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
83	NC_017183	TGC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
84	NC_017183	TGA	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
85	NC_017183	CCA	2	6	7432	7437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410890
86	NC_017183	TGC	2	6	7496	7501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
87	NC_017183	CGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
88	NC_017183	GGC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410890
89	NC_017183	CGG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410890
90	NC_017183	GAA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
91	NC_017183	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
92	NC_017183	ACT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410891
93	NC_017183	TCG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
94	NC_017183	TGA	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410891
95	NC_017183	GGA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
96	NC_017183	AGG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
97	NC_017183	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
98	NC_017183	TCG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
99	NC_017183	CGA	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410891
100	NC_017183	ATG	2	6	8607	8612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410891
101	NC_017183	CTG	3	9	8616	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
102	NC_017183	GGC	2	6	8637	8642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
103	NC_017183	GAA	2	6	8726	8731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
104	NC_017183	TCG	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
105	NC_017183	CGG	2	6	8831	8836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
106	NC_017183	ATA	2	6	8878	8883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410891
107	NC_017183	GCC	3	9	8887	8895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410891
108	NC_017183	TTC	2	6	8991	8996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410891
109	NC_017183	GCG	2	6	9152	9157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
110	NC_017183	AGA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
111	NC_017183	CGC	2	6	9293	9298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410891
112	NC_017183	ATC	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410891
113	NC_017183	GCG	2	6	9321	9326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
114	NC_017183	GCT	2	6	9381	9386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
115	NC_017183	GGA	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
116	NC_017183	ACA	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410892
117	NC_017183	CAT	2	6	9586	9591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410892
118	NC_017183	AAC	2	6	9819	9824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410892
119	NC_017183	GGA	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410892
120	NC_017183	TCG	2	6	9903	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
121	NC_017183	CCG	2	6	9933	9938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
122	NC_017183	CGC	2	6	10122	10127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
123	NC_017183	GGT	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410892
124	NC_017183	TGC	2	6	10248	10253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
125	NC_017183	TGC	2	6	10333	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
126	NC_017183	GCC	2	6	10409	10414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
127	NC_017183	CGC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
128	NC_017183	TGC	2	6	10483	10488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
129	NC_017183	CGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410892
130	NC_017183	TGC	2	6	10618	10623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
131	NC_017183	TGC	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017183	GAA	2	6	10781	10786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017183	TGC	2	6	10788	10793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017183	GCT	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017183	TCT	2	6	10977	10982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017183	GAC	2	6	10983	10988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017183	TCG	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017183	GGC	2	6	11217	11222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017183	TCA	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_017183	TGC	2	6	11336	11341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017183	TTC	2	6	11506	11511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017183	CTT	2	6	11543	11548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017183	ATA	2	6	11739	11744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_017183	ATG	2	6	19216	19221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410898
255	NC_017183	TTC	2	6	19292	19297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410898
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257	NC_017183	TCT	2	6	19413	19418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410898
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259	NC_017183	GGA	2	6	19551	19556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410898
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263	NC_017183	TAT	2	6	19742	19747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410898
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380	NC_017183	GAA	2	6	29322	29327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_017183	AAG	2	6	29535	29540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_017183	ACC	2	6	29564	29569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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386	NC_017183	TCA	2	6	29854	29859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_017183	TGA	2	6	29965	29970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
388	NC_017183	GAT	2	6	30112	30117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017183	ATG	2	6	30201	30206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
390	NC_017183	TAA	2	6	30472	30477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017183	CTT	2	6	30528	30533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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410	NC_017183	TGA	2	6	32086	32091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.