MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB03

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017181	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410859
2	NC_017181	AAT	2	6	292	297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410859
3	NC_017181	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410859
4	NC_017181	TTG	2	6	489	494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410859
5	NC_017181	GAA	2	6	531	536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410859
6	NC_017181	TCT	2	6	584	589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410859
7	NC_017181	TTC	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017181	AAT	2	6	978	983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017181	TAT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017181	ATT	2	6	1089	1094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410860
11	NC_017181	GAA	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410860
12	NC_017181	TTC	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410860
13	NC_017181	GTT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410860
14	NC_017181	TTA	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410860
15	NC_017181	CCA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410861
16	NC_017181	AAT	3	9	1788	1796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410861
17	NC_017181	CAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410861
18	NC_017181	AAC	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410861
19	NC_017181	CTG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410861
20	NC_017181	TTG	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410861
21	NC_017181	CCT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410861
22	NC_017181	ATA	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410861
23	NC_017181	AAT	2	6	2095	2100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017181	TGA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017181	ATA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017181	AAG	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017181	AAT	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017181	TAT	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410862
29	NC_017181	GCC	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410862
30	NC_017181	ATG	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410862
31	NC_017181	AAG	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410862
32	NC_017181	TGA	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410862
33	NC_017181	TGG	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410862
34	NC_017181	ATC	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410862
35	NC_017181	TCT	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410862
36	NC_017181	CGA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410862
37	NC_017181	GAT	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410862
38	NC_017181	TGG	2	6	2891	2896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410862
39	NC_017181	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017181	TTG	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
41	NC_017181	ACT	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410863
42	NC_017181	CAA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410863
43	NC_017181	CGT	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410863
44	NC_017181	GTT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
45	NC_017181	GCA	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410863
46	NC_017181	TTC	2	6	4006	4011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410863
47	NC_017181	TCC	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410863
48	NC_017181	TTA	2	6	4094	4099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410863
49	NC_017181	GTG	2	6	4166	4171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410863
50	NC_017181	GTC	2	6	4322	4327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410863
51	NC_017181	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410863
52	NC_017181	TGT	2	6	4391	4396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
53	NC_017181	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410863
54	NC_017181	CAT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410863
55	NC_017181	TGT	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
56	NC_017181	AAG	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410863
57	NC_017181	CTG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410863
58	NC_017181	CAC	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410863
59	NC_017181	TTG	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
60	NC_017181	TCT	2	6	5051	5056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410863
61	NC_017181	TCT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410863
62	NC_017181	GAA	2	6	5108	5113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410863
63	NC_017181	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017181	ATT	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017181	AAT	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017181	ATC	2	6	5528	5533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410864
67	NC_017181	TTC	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410864
68	NC_017181	CAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410864
69	NC_017181	CTG	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410865
70	NC_017181	TTG	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410865
71	NC_017181	TCA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017181	AAT	2	6	6065	6070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017181	CAT	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017181	GAA	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017181	GAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017181	TCA	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410866
77	NC_017181	GAT	2	6	6580	6585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410866
78	NC_017181	AGC	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410866
79	NC_017181	TTA	2	6	6725	6730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410866
80	NC_017181	GAT	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410866
81	NC_017181	GCT	2	6	6760	6765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410866
82	NC_017181	CTT	2	6	6875	6880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410866
83	NC_017181	TGT	2	6	6954	6959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410866
84	NC_017181	GAT	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410866
85	NC_017181	ATA	2	6	6982	6987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410866
86	NC_017181	AGT	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410867
87	NC_017181	TTC	2	6	7210	7215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410867
88	NC_017181	CTG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410867
89	NC_017181	CTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410867
90	NC_017181	TTC	2	6	7495	7500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410867
91	NC_017181	TGG	2	6	7501	7506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410867
92	NC_017181	ATT	2	6	7508	7513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410867
93	NC_017181	GCT	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410868
94	NC_017181	TCA	2	6	7916	7921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410868
95	NC_017181	GTT	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410868
96	NC_017181	TAA	2	6	8058	8063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017181	AGT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017181	ATC	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017181	TCG	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017181	ATG	2	6	8155	8160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017181	ATG	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410869
102	NC_017181	TCA	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017181	CTC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017181	ATC	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017181	CAG	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410870
106	NC_017181	AGA	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410870
107	NC_017181	GAA	2	6	8675	8680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410870
108	NC_017181	ATG	2	6	8790	8795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410870
109	NC_017181	TCT	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410871
110	NC_017181	GAA	3	9	9021	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410872
111	NC_017181	AAG	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410872
112	NC_017181	TCT	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
113	NC_017181	TCT	2	6	9490	9495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
114	NC_017181	TTC	2	6	9606	9611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
115	NC_017181	CTC	2	6	9636	9641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410873
116	NC_017181	GCT	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410873
117	NC_017181	CGA	2	6	9912	9917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410873
118	NC_017181	CGT	2	6	10042	10047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410873
119	NC_017181	CGC	2	6	10393	10398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410873
120	NC_017181	CTT	2	6	10422	10427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
121	NC_017181	GGA	2	6	10484	10489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410873
122	NC_017181	GCC	2	6	10566	10571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410873
123	NC_017181	AAC	2	6	10664	10669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410873
124	NC_017181	AAG	2	6	10690	10695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410873
125	NC_017181	GCA	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410873
126	NC_017181	AAG	2	6	10712	10717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410873
127	NC_017181	AGG	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410873
128	NC_017181	AGA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410873
129	NC_017181	ACC	2	6	11122	11127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017181	GCT	2	6	11143	11148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017181	TCA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017181	GCA	2	6	11503	11508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017181	ACC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017181	ACT	2	6	11536	11541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017181	ATT	2	6	11644	11649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410874
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138	NC_017181	AAG	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410874
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142	NC_017181	GCG	2	6	12471	12476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410874
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153	NC_017181	ATC	2	6	13541	13546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410874
154	NC_017181	TGG	2	6	13577	13582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410874
155	NC_017181	GTT	2	6	13694	13699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410874
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161	NC_017181	GCT	2	6	14231	14236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017181	CTG	2	6	14358	14363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017181	GAA	2	6	14522	14527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017181	GTC	2	6	14562	14567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_017181	TAT	2	6	15182	15187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017181	ACC	2	6	15211	15216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410875
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373	NC_017181	TTA	2	6	31575	31580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NC_017181	AAT	2	6	31660	31665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.