MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017180	AAAGT	2	10	1797	1806	60 %	20 %	20 %	0 %	384410831
2	NC_017180	ACGCT	2	10	2465	2474	20 %	20 %	20 %	40 %	384410832
3	NC_017180	GGCAA	2	10	6094	6103	40 %	0 %	40 %	20 %	384410833
4	NC_017180	AAATG	2	10	6965	6974	60 %	20 %	20 %	0 %	384410834
5	NC_017180	CCTCT	2	10	8771	8780	0 %	40 %	0 %	60 %	384410834
6	NC_017180	ATATA	2	10	9420	9429	60 %	40 %	0 %	0 %	384410834
7	NC_017180	AAGAT	2	10	10775	10784	60 %	20 %	20 %	0 %	384410836
8	NC_017180	ATCTG	2	10	11313	11322	20 %	40 %	20 %	20 %	384410837
9	NC_017180	ATGAG	2	10	12412	12421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017180	ATCAG	2	10	12776	12785	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017180	TAAAA	2	10	15099	15108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017180	TGTCT	2	10	16942	16951	0 %	60 %	20 %	20 %	384410844
13	NC_017180	GCGGT	2	10	17005	17014	0 %	20 %	60 %	20 %	384410844
14	NC_017180	CTGTT	2	10	17476	17485	0 %	60 %	20 %	20 %	384410846
15	NC_017180	TTCGC	2	10	19558	19567	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017180	AGTTC	2	10	19963	19972	20 %	40 %	20 %	20 %	384410849
17	NC_017180	ATCTT	2	10	20298	20307	20 %	60 %	0 %	20 %	384410849
18	NC_017180	ATTGA	2	10	25635	25644	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017180	CGGCG	2	10	27798	27807	0 %	0 %	60 %	40 %	384410855
20	NC_017180	CCATA	2	10	28630	28639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017180	GGGTC	2	10	31402	31411	0 %	20 %	60 %	20 %	384410857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.