MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1002

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013357	TGAT	2	8	46	53	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013357	GGAT	2	8	159	166	25 %	25 %	50 %	0 %	260738803
3	NC_013357	CGAG	2	8	867	874	25 %	0 %	50 %	25 %	260738803
4	NC_013357	TAAA	2	8	2105	2112	75 %	25 %	0 %	0 %	260738803
5	NC_013357	GTTT	2	8	2521	2528	0 %	75 %	25 %	0 %	260738803
6	NC_013357	TGCC	2	8	2849	2856	0 %	25 %	25 %	50 %	260738803
7	NC_013357	CCCG	2	8	3644	3651	0 %	0 %	25 %	75 %	260738804
8	NC_013357	GATG	2	8	3877	3884	25 %	25 %	50 %	0 %	260738804
9	NC_013357	TTAC	2	8	4035	4042	25 %	50 %	0 %	25 %	260738804
10	NC_013357	GATA	2	8	4408	4415	50 %	25 %	25 %	0 %	260738805
11	NC_013357	TCTT	2	8	5860	5867	0 %	75 %	0 %	25 %	260738806
12	NC_013357	CGGT	2	8	6113	6120	0 %	25 %	50 %	25 %	260738806
13	NC_013357	AAAC	2	8	6368	6375	75 %	0 %	0 %	25 %	260738806
14	NC_013357	AGCC	2	8	6903	6910	25 %	0 %	25 %	50 %	260738806
15	NC_013357	ATAC	2	8	7092	7099	50 %	25 %	0 %	25 %	260738806
16	NC_013357	AGGC	2	8	7305	7312	25 %	0 %	50 %	25 %	260738806
17	NC_013357	ATCT	2	8	7319	7326	25 %	50 %	0 %	25 %	260738806
18	NC_013357	GGAT	2	8	7640	7647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013357	ATGG	2	8	8114	8121	25 %	25 %	50 %	0 %	260738807
20	NC_013357	AGAA	2	8	8207	8214	75 %	0 %	25 %	0 %	260738807
21	NC_013357	TCGA	2	8	8235	8242	25 %	25 %	25 %	25 %	260738807
22	NC_013357	TGAT	2	8	8480	8487	25 %	50 %	25 %	0 %	260738807
23	NC_013357	TGAT	2	8	9018	9025	25 %	50 %	25 %	0 %	260738807
24	NC_013357	CTGT	2	8	9063	9070	0 %	50 %	25 %	25 %	260738807
25	NC_013357	TCAT	2	8	9838	9845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013357	TTTA	2	8	9982	9989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013357	GCTT	2	8	10498	10505	0 %	50 %	25 %	25 %	260738808
28	NC_013357	AGAA	2	8	10715	10722	75 %	0 %	25 %	0 %	260738808
29	NC_013357	AAAT	2	8	11038	11045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013357	CGCA	2	8	11686	11693	25 %	0 %	25 %	50 %	260738810
31	NC_013357	GGCT	2	8	12624	12631	0 %	25 %	50 %	25 %	260738811
32	NC_013357	AGCT	2	8	12822	12829	25 %	25 %	25 %	25 %	260738811
33	NC_013357	AAGG	2	8	13124	13131	50 %	0 %	50 %	0 %	260738812
34	NC_013357	ATCA	2	8	13349	13356	50 %	25 %	0 %	25 %	260738812
35	NC_013357	AATA	2	8	14244	14251	75 %	25 %	0 %	0 %	260738812
36	NC_013357	TGCC	2	8	14488	14495	0 %	25 %	25 %	50 %	260738812
37	NC_013357	ATAC	2	8	14989	14996	50 %	25 %	0 %	25 %	260738812
38	NC_013357	ATAA	2	8	15411	15418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013357	CAAG	2	8	15710	15717	50 %	0 %	25 %	25 %	260738813
40	NC_013357	TCAG	2	8	16278	16285	25 %	25 %	25 %	25 %	260738815
41	NC_013357	GGGC	2	8	16742	16749	0 %	0 %	75 %	25 %	260738815
42	NC_013357	ATAA	2	8	16941	16948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013357	TCCA	2	8	17098	17105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013357	GGTT	2	8	17436	17443	0 %	50 %	50 %	0 %	260738816
45	NC_013357	TTTC	2	8	17479	17486	0 %	75 %	0 %	25 %	260738816
46	NC_013357	AAAC	2	8	17581	17588	75 %	0 %	0 %	25 %	260738816
47	NC_013357	TTTG	2	8	18175	18182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013357	AAAC	2	8	18240	18247	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013357	CTGA	2	8	18899	18906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013357	CTGA	2	8	18979	18986	25 %	25 %	25 %	25 %	260738819
51	NC_013357	AGTC	2	8	19845	19852	25 %	25 %	25 %	25 %	260738820
52	NC_013357	ATCA	2	8	20104	20111	50 %	25 %	0 %	25 %	260738820
53	NC_013357	GCGG	2	8	20401	20408	0 %	0 %	75 %	25 %	260738820
54	NC_013357	ATGG	3	12	20769	20780	25 %	25 %	50 %	0 %	260738820
55	NC_013357	CCGC	2	8	20799	20806	0 %	0 %	25 %	75 %	260738820
56	NC_013357	ACAA	2	8	20815	20822	75 %	0 %	0 %	25 %	260738820
57	NC_013357	CCGT	2	8	20868	20875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013357	GCTG	2	8	21162	21169	0 %	25 %	50 %	25 %	260738821
59	NC_013357	CCTG	2	8	21345	21352	0 %	25 %	25 %	50 %	260738821
60	NC_013357	GAGC	2	8	21601	21608	25 %	0 %	50 %	25 %	260738821
61	NC_013357	TATT	2	8	22589	22596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013357	ATTT	2	8	22637	22644	25 %	75 %	0 %	0 %	260738822
63	NC_013357	TAAT	2	8	23068	23075	50 %	50 %	0 %	0 %	260738822
64	NC_013357	AACC	2	8	23139	23146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013357	CTAT	2	8	23463	23470	25 %	50 %	0 %	25 %	260738823
66	NC_013357	ACGC	2	8	23672	23679	25 %	0 %	25 %	50 %	260738823
67	NC_013357	CGTC	2	8	23728	23735	0 %	25 %	25 %	50 %	260738823
68	NC_013357	AAAT	2	8	24084	24091	75 %	25 %	0 %	0 %	260738824
69	NC_013357	CCCA	2	8	25044	25051	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_013357	AAGA	2	8	25361	25368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013357	ATTT	2	8	25650	25657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013357	GATC	2	8	26058	26065	25 %	25 %	25 %	25 %	260738826
73	NC_013357	TGCT	2	8	26078	26085	0 %	50 %	25 %	25 %	260738826
74	NC_013357	AAAT	2	8	26401	26408	75 %	25 %	0 %	0 %	260738826
75	NC_013357	CGTC	2	8	26435	26442	0 %	25 %	25 %	50 %	260738826
76	NC_013357	GATG	2	8	26657	26664	25 %	25 %	50 %	0 %	260738826
77	NC_013357	TAGG	2	8	26956	26963	25 %	25 %	50 %	0 %	260738826
78	NC_013357	TGCT	2	8	28118	28125	0 %	50 %	25 %	25 %	260738827
79	NC_013357	ACCT	2	8	28666	28673	25 %	25 %	0 %	50 %	260738827
80	NC_013357	GCGG	2	8	28939	28946	0 %	0 %	75 %	25 %	260738828
81	NC_013357	GAAA	2	8	29005	29012	75 %	0 %	25 %	0 %	260738828
82	NC_013357	TATT	2	8	29212	29219	25 %	75 %	0 %	0 %	260738828
83	NC_013357	AAAC	2	8	29561	29568	75 %	0 %	0 %	25 %	260738828
84	NC_013357	TTCG	2	8	29952	29959	0 %	50 %	25 %	25 %	260738828
85	NC_013357	AGGA	2	8	30086	30093	50 %	0 %	50 %	0 %	260738828
86	NC_013357	TCGA	2	8	31295	31302	25 %	25 %	25 %	25 %	260738829
87	NC_013357	ATCC	2	8	31333	31340	25 %	25 %	0 %	50 %	260738829
88	NC_013357	ATCG	2	8	31402	31409	25 %	25 %	25 %	25 %	260738829
89	NC_013357	CCAC	2	8	31990	31997	25 %	0 %	0 %	75 %	260738830
90	NC_013357	ATGT	2	8	32145	32152	25 %	50 %	25 %	0 %	260738831
91	NC_013357	GGTT	2	8	32813	32820	0 %	50 %	50 %	0 %	260738831
92	NC_013357	GGCG	2	8	33729	33736	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013357	CCAT	3	12	34960	34971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013357	GTTT	2	8	36180	36187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013357	TCGC	2	8	36905	36912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013357	GACG	2	8	37551	37558	25 %	0 %	50 %	25 %	260738833
97	NC_013357	TGCG	2	8	37606	37613	0 %	25 %	50 %	25 %	260738833
98	NC_013357	GATA	2	8	37815	37822	50 %	25 %	25 %	0 %	260738833
99	NC_013357	AAGG	2	8	37875	37882	50 %	0 %	50 %	0 %	260738833
100	NC_013357	GATA	2	8	38006	38013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013357	TCCT	2	8	38098	38105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013357	CCTT	2	8	38257	38264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013357	CCTT	2	8	38292	38299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013357	CAGG	2	8	38618	38625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013357	CATG	2	8	39073	39080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013357	GATA	2	8	39178	39185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013357	AAGG	2	8	39238	39245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013357	ACAA	2	8	39254	39261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013357	CCGG	2	8	39743	39750	0 %	0 %	50 %	50 %	260738834
110	NC_013357	GGTG	2	8	39784	39791	0 %	25 %	75 %	0 %	260738834
111	NC_013357	AGTG	2	8	40752	40759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.