MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1001

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013356	GA	3	6	660	665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013356	AT	3	6	690	695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013356	TA	3	6	2018	2023	50 %	50 %	0 %	0 %	260712888
4	NC_013356	GA	3	6	2228	2233	50 %	0 %	50 %	0 %	260712888
5	NC_013356	AG	3	6	4118	4123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013356	CA	3	6	4204	4209	50 %	0 %	0 %	50 %	260712890
7	NC_013356	AC	3	6	5717	5722	50 %	0 %	0 %	50 %	260712892
8	NC_013356	AG	3	6	8022	8027	50 %	0 %	50 %	0 %	260712897
9	NC_013356	GC	3	6	8706	8711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013356	GT	3	6	8850	8855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013356	GA	3	6	9585	9590	50 %	0 %	50 %	0 %	260712898
12	NC_013356	TC	3	6	11038	11043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013356	GC	3	6	11223	11228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013356	AT	3	6	11480	11485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013356	GA	3	6	12018	12023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013356	GA	3	6	12130	12135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013356	TC	3	6	12274	12279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013356	AG	4	8	12501	12508	50 %	0 %	50 %	0 %	260712899
19	NC_013356	GA	3	6	12741	12746	50 %	0 %	50 %	0 %	260712899
20	NC_013356	CT	3	6	13144	13149	0 %	50 %	0 %	50 %	260712899
21	NC_013356	GA	3	6	15403	15408	50 %	0 %	50 %	0 %	260712900
22	NC_013356	AT	3	6	16170	16175	50 %	50 %	0 %	0 %	260712900
23	NC_013356	TC	3	6	17925	17930	0 %	50 %	0 %	50 %	260712901
24	NC_013356	GT	3	6	18064	18069	0 %	50 %	50 %	0 %	260712901
25	NC_013356	TA	3	6	18285	18290	50 %	50 %	0 %	0 %	260712901
26	NC_013356	AT	3	6	18913	18918	50 %	50 %	0 %	0 %	260712901
27	NC_013356	TA	3	6	19248	19253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013356	AT	4	8	19641	19648	50 %	50 %	0 %	0 %	260712902
29	NC_013356	CA	3	6	20568	20573	50 %	0 %	0 %	50 %	260712902
30	NC_013356	CA	3	6	20904	20909	50 %	0 %	0 %	50 %	260712902
31	NC_013356	AT	3	6	20942	20947	50 %	50 %	0 %	0 %	260712902
32	NC_013356	TC	3	6	21845	21850	0 %	50 %	0 %	50 %	260712903
33	NC_013356	TA	3	6	22784	22789	50 %	50 %	0 %	0 %	260712904
34	NC_013356	AT	3	6	23650	23655	50 %	50 %	0 %	0 %	260712905
35	NC_013356	TA	3	6	24387	24392	50 %	50 %	0 %	0 %	260712905
36	NC_013356	CT	3	6	24404	24409	0 %	50 %	0 %	50 %	260712905
37	NC_013356	TC	3	6	25436	25441	0 %	50 %	0 %	50 %	260712905
38	NC_013356	AT	3	6	26376	26381	50 %	50 %	0 %	0 %	260712905
39	NC_013356	TA	3	6	27234	27239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013356	CT	3	6	27324	27329	0 %	50 %	0 %	50 %	260712908
41	NC_013356	AG	3	6	27397	27402	50 %	0 %	50 %	0 %	260712908
42	NC_013356	TA	3	6	27892	27897	50 %	50 %	0 %	0 %	260712908
43	NC_013356	TA	3	6	27908	27913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013356	TA	3	6	28237	28242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013356	CA	3	6	28270	28275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013356	CG	3	6	28828	28833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013356	TA	3	6	29915	29920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013356	GC	3	6	30650	30655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013356	AG	3	6	30742	30747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013356	TA	3	6	31352	31357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013356	TA	3	6	31625	31630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013356	AG	3	6	31929	31934	50 %	0 %	50 %	0 %	260712912
53	NC_013356	AT	3	6	32055	32060	50 %	50 %	0 %	0 %	260712912
54	NC_013356	AT	3	6	32361	32366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013356	TA	3	6	32387	32392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013356	AT	3	6	32434	32439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013356	GA	3	6	33133	33138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013356	TC	3	6	35046	35051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013356	AG	3	6	36083	36088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013356	AT	3	6	37506	37511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013356	TA	3	6	37953	37958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013356	AT	3	6	38095	38100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013356	AG	3	6	39189	39194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013356	AT	3	6	39409	39414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013356	AT	3	6	40195	40200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013356	CG	3	6	41218	41223	0 %	0 %	50 %	50 %	260712919
67	NC_013356	GC	3	6	42232	42237	0 %	0 %	50 %	50 %	260712919
68	NC_013356	AG	3	6	42341	42346	50 %	0 %	50 %	0 %	260712919
69	NC_013356	TA	3	6	42368	42373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013356	TC	3	6	43260	43265	0 %	50 %	0 %	50 %	260712920
71	NC_013356	GT	3	6	43326	43331	0 %	50 %	50 %	0 %	260712920
72	NC_013356	CT	3	6	43397	43402	0 %	50 %	0 %	50 %	260712920
73	NC_013356	CT	4	8	43440	43447	0 %	50 %	0 %	50 %	260712920
74	NC_013356	TC	3	6	43678	43683	0 %	50 %	0 %	50 %	260712920
75	NC_013356	GA	3	6	44500	44505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013356	AC	3	6	44530	44535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013356	GT	3	6	45239	45244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013356	GC	3	6	45392	45397	0 %	0 %	50 %	50 %	260712923
79	NC_013356	AG	3	6	45620	45625	50 %	0 %	50 %	0 %	260712923
80	NC_013356	AT	3	6	46117	46122	50 %	50 %	0 %	0 %	260712923
81	NC_013356	CG	3	6	46123	46128	0 %	0 %	50 %	50 %	260712923
82	NC_013356	AC	3	6	48120	48125	50 %	0 %	0 %	50 %	260712923
83	NC_013356	GA	3	6	48280	48285	50 %	0 %	50 %	0 %	260712923
84	NC_013356	GA	3	6	48555	48560	50 %	0 %	50 %	0 %	260712924
85	NC_013356	AG	3	6	48981	48986	50 %	0 %	50 %	0 %	260712924
86	NC_013356	GC	3	6	49914	49919	0 %	0 %	50 %	50 %	260712924
87	NC_013356	TC	3	6	49942	49947	0 %	50 %	0 %	50 %	260712924
88	NC_013356	TA	3	6	50127	50132	50 %	50 %	0 %	0 %	260712924
89	NC_013356	AT	4	8	51451	51458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013356	TC	3	6	51559	51564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013356	TA	3	6	51683	51688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013356	CT	3	6	52129	52134	0 %	50 %	0 %	50 %	260712926
93	NC_013356	CT	3	6	52512	52517	0 %	50 %	0 %	50 %	260712927
94	NC_013356	GC	3	6	53043	53048	0 %	0 %	50 %	50 %	260712928
95	NC_013356	GC	3	6	53065	53070	0 %	0 %	50 %	50 %	260712928
96	NC_013356	TA	3	6	53363	53368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.