MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 chromosome

Total Repeats: 1517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013355	GCAAA	2	10	213	222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013355	CTTTT	2	10	2710	2719	0 %	80 %	0 %	20 %	260752247
3	NC_013355	TATTT	2	10	3860	3869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013355	ACAAA	2	10	3898	3907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013355	TCCGT	2	10	4310	4319	0 %	40 %	20 %	40 %	260752248
6	NC_013355	GGTCT	2	10	4728	4737	0 %	40 %	40 %	20 %	260752248
7	NC_013355	GGCAA	2	10	5916	5925	40 %	0 %	40 %	20 %	260752249
8	NC_013355	GCTAT	2	10	9379	9388	20 %	40 %	20 %	20 %	260752253
9	NC_013355	TTGAT	2	10	10371	10380	20 %	60 %	20 %	0 %	260752254
10	NC_013355	TTATT	2	10	11237	11246	20 %	80 %	0 %	0 %	260752255
11	NC_013355	GAAAT	2	10	11322	11331	60 %	20 %	20 %	0 %	260752255
12	NC_013355	AGCAT	2	10	13933	13942	40 %	20 %	20 %	20 %	260752256
13	NC_013355	CTTTC	2	10	18223	18232	0 %	60 %	0 %	40 %	260752259
14	NC_013355	ATAAA	2	10	18914	18923	80 %	20 %	0 %	0 %	260752259
15	NC_013355	CCATG	2	10	19426	19435	20 %	20 %	20 %	40 %	260752260
16	NC_013355	TCGGC	2	10	21896	21905	0 %	20 %	40 %	40 %	260752263
17	NC_013355	TTCTC	2	10	23705	23714	0 %	60 %	0 %	40 %	260752266
18	NC_013355	ACTGA	2	10	24628	24637	40 %	20 %	20 %	20 %	260752266
19	NC_013355	TGACG	2	10	26589	26598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013355	CGCCA	2	10	27045	27054	20 %	0 %	20 %	60 %	260752267
21	NC_013355	GATCA	2	10	27893	27902	40 %	20 %	20 %	20 %	260752268
22	NC_013355	CCAAT	2	10	29153	29162	40 %	20 %	0 %	40 %	260752270
23	NC_013355	TCCCA	2	10	30014	30023	20 %	20 %	0 %	60 %	260752271
24	NC_013355	TTTCA	2	10	30206	30215	20 %	60 %	0 %	20 %	260752272
25	NC_013355	GATCC	2	10	31992	32001	20 %	20 %	20 %	40 %	260752273
26	NC_013355	AAAGC	2	10	33283	33292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013355	TGATC	2	10	34107	34116	20 %	40 %	20 %	20 %	260752275
28	NC_013355	CTTTG	2	10	37304	37313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013355	GCAAA	2	10	38074	38083	60 %	0 %	20 %	20 %	260752278
30	NC_013355	CTTGG	2	10	38320	38329	0 %	40 %	40 %	20 %	260752279
31	NC_013355	TGGAC	2	10	39283	39292	20 %	20 %	40 %	20 %	260752280
32	NC_013355	AACAC	2	10	39722	39731	60 %	0 %	0 %	40 %	260752280
33	NC_013355	CATCG	2	10	41756	41765	20 %	20 %	20 %	40 %	260752282
34	NC_013355	GACAT	2	10	43389	43398	40 %	20 %	20 %	20 %	260752284
35	NC_013355	AGAAA	2	10	43862	43871	80 %	0 %	20 %	0 %	260752284
36	NC_013355	GATAT	2	10	43880	43889	40 %	40 %	20 %	0 %	260752284
37	NC_013355	CAAAG	2	10	44267	44276	60 %	0 %	20 %	20 %	260752284
38	NC_013355	ATTCC	2	10	45648	45657	20 %	40 %	0 %	40 %	260752285
39	NC_013355	TATTT	2	10	49179	49188	20 %	80 %	0 %	0 %	260752287
40	NC_013355	TGTTC	2	10	52836	52845	0 %	60 %	20 %	20 %	260752291
41	NC_013355	ACTTT	2	10	53304	53313	20 %	60 %	0 %	20 %	260752292
42	NC_013355	TGCTT	2	10	55293	55302	0 %	60 %	20 %	20 %	260752294
43	NC_013355	TATCA	2	10	56869	56878	40 %	40 %	0 %	20 %	260752294
44	NC_013355	GAAAA	2	10	57272	57281	80 %	0 %	20 %	0 %	260752294
45	NC_013355	ACCCC	2	10	57310	57319	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_013355	TAAAA	2	10	57387	57396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013355	TGGCA	2	10	61065	61074	20 %	20 %	40 %	20 %	260752299
48	NC_013355	TCACC	2	10	67154	67163	20 %	20 %	0 %	60 %	260752304
49	NC_013355	CTTTC	2	10	67407	67416	0 %	60 %	0 %	40 %	260752304
50	NC_013355	CCAGA	2	10	69103	69112	40 %	0 %	20 %	40 %	260752305
51	NC_013355	AGTGA	2	10	70071	70080	40 %	20 %	40 %	0 %	260752306
52	NC_013355	GTCTT	2	10	70440	70449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013355	AAGCG	2	10	72674	72683	40 %	0 %	40 %	20 %	260752309
54	NC_013355	CACAG	2	10	73910	73919	40 %	0 %	20 %	40 %	260752311
55	NC_013355	GCCGC	2	10	75825	75834	0 %	0 %	40 %	60 %	260752312
56	NC_013355	CAGGG	2	10	76854	76863	20 %	0 %	60 %	20 %	260752313
57	NC_013355	CTTGC	2	10	76875	76884	0 %	40 %	20 %	40 %	260752313
58	NC_013355	GCTTT	2	10	80988	80997	0 %	60 %	20 %	20 %	260752317
59	NC_013355	ATGGC	2	10	81130	81139	20 %	20 %	40 %	20 %	260752317
60	NC_013355	TTCTA	2	10	88434	88443	20 %	60 %	0 %	20 %	260752324
61	NC_013355	TTTGC	2	10	88678	88687	0 %	60 %	20 %	20 %	260752324
62	NC_013355	AATCC	2	10	89949	89958	40 %	20 %	0 %	40 %	260752324
63	NC_013355	TAAAA	2	10	90938	90947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013355	TGGGG	2	10	93335	93344	0 %	20 %	80 %	0 %	260752328
65	NC_013355	ATTCC	2	10	93411	93420	20 %	40 %	0 %	40 %	260752328
66	NC_013355	TGAAA	2	10	94754	94763	60 %	20 %	20 %	0 %	260752329
67	NC_013355	GGCAG	2	10	95663	95672	20 %	0 %	60 %	20 %	260752331
68	NC_013355	TATCT	2	10	96212	96221	20 %	60 %	0 %	20 %	260752332
69	NC_013355	GTCAG	2	10	98447	98456	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013355	CTGAA	2	10	101927	101936	40 %	20 %	20 %	20 %	260752338
71	NC_013355	AAGGT	2	10	105169	105178	40 %	20 %	40 %	0 %	260752340
72	NC_013355	CTATC	2	10	107723	107732	20 %	40 %	0 %	40 %	260752342
73	NC_013355	ACACC	2	10	110841	110850	40 %	0 %	0 %	60 %	260752344
74	NC_013355	AAATT	2	10	112714	112723	60 %	40 %	0 %	0 %	260752346
75	NC_013355	ATTTT	2	10	114069	114078	20 %	80 %	0 %	0 %	260752347
76	NC_013355	CCATT	2	10	116563	116572	20 %	40 %	0 %	40 %	260752349
77	NC_013355	GAGGG	2	10	116771	116780	20 %	0 %	80 %	0 %	260752349
78	NC_013355	ATTGA	2	10	117267	117276	40 %	40 %	20 %	0 %	260752349
79	NC_013355	GCCGC	2	10	117464	117473	0 %	0 %	40 %	60 %	260752349
80	NC_013355	GAGGG	2	10	119252	119261	20 %	0 %	80 %	0 %	260752351
81	NC_013355	GCCGT	2	10	123338	123347	0 %	20 %	40 %	40 %	260752356
82	NC_013355	TCAGT	2	10	123392	123401	20 %	40 %	20 %	20 %	260752356
83	NC_013355	TTACC	2	10	124205	124214	20 %	40 %	0 %	40 %	260752357
84	NC_013355	GGGCA	2	10	125268	125277	20 %	0 %	60 %	20 %	260752359
85	NC_013355	ATTGA	2	10	127269	127278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013355	CAGAA	2	10	128190	128199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013355	CTCGG	2	10	128381	128390	0 %	20 %	40 %	40 %	260752362
88	NC_013355	GCTTT	2	10	129185	129194	0 %	60 %	20 %	20 %	260752362
89	NC_013355	GAAAA	2	10	130450	130459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013355	AGGGC	2	10	132260	132269	20 %	0 %	60 %	20 %	260752365
91	NC_013355	ATCAA	2	10	132311	132320	60 %	20 %	0 %	20 %	260752365
92	NC_013355	GGCGG	2	10	132534	132543	0 %	0 %	80 %	20 %	260752365
93	NC_013355	ATGGA	2	10	133499	133508	40 %	20 %	40 %	0 %	260752366
94	NC_013355	AAAGG	2	10	134517	134526	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013355	GGCAT	2	10	135225	135234	20 %	20 %	40 %	20 %	260752367
96	NC_013355	ATATT	2	10	136218	136227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013355	CAGCC	2	10	137021	137030	20 %	0 %	20 %	60 %	260752368
98	NC_013355	TCCTA	2	10	138372	138381	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013355	TAAAA	2	10	138766	138775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013355	CGCAG	2	10	140535	140544	20 %	0 %	40 %	40 %	260752369
101	NC_013355	TCTGC	2	10	140950	140959	0 %	40 %	20 %	40 %	260752369
102	NC_013355	ATGAT	2	10	141120	141129	40 %	40 %	20 %	0 %	260752370
103	NC_013355	AATAA	2	10	142263	142272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013355	TAAAA	2	10	146446	146455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013355	TGCCA	2	10	147362	147371	20 %	20 %	20 %	40 %	260752376
106	NC_013355	AGGGC	2	10	148397	148406	20 %	0 %	60 %	20 %	260752377
107	NC_013355	AAACC	2	10	153107	153116	60 %	0 %	0 %	40 %	260752381
108	NC_013355	AAGCC	2	10	154617	154626	40 %	0 %	20 %	40 %	260752381
109	NC_013355	ATTTT	2	10	157665	157674	20 %	80 %	0 %	0 %	260752384
110	NC_013355	ACTTT	2	10	157895	157904	20 %	60 %	0 %	20 %	260752384
111	NC_013355	ATGTT	2	10	161438	161447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013355	CCAAG	2	10	162064	162073	40 %	0 %	20 %	40 %	260752387
113	NC_013355	CGGCT	2	10	162849	162858	0 %	20 %	40 %	40 %	260752388
114	NC_013355	AAGAT	2	10	163021	163030	60 %	20 %	20 %	0 %	260752388
115	NC_013355	TAGCA	2	10	164660	164669	40 %	20 %	20 %	20 %	260752389
116	NC_013355	TTCCT	2	10	165194	165203	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013355	CTGCA	2	10	166917	166926	20 %	20 %	20 %	40 %	260752390
118	NC_013355	TTTCT	2	10	167285	167294	0 %	80 %	0 %	20 %	260752391
119	NC_013355	TTTCT	2	10	170914	170923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013355	GATCA	2	10	171217	171226	40 %	20 %	20 %	20 %	260752394
121	NC_013355	GTTGC	2	10	173299	173308	0 %	40 %	40 %	20 %	260752395
122	NC_013355	GGTTC	2	10	173580	173589	0 %	40 %	40 %	20 %	260752395
123	NC_013355	TGATC	2	10	175313	175322	20 %	40 %	20 %	20 %	260752398
124	NC_013355	GCAGG	2	10	178451	178460	20 %	0 %	60 %	20 %	260752399
125	NC_013355	AAATC	2	10	179116	179125	60 %	20 %	0 %	20 %	260752400
126	NC_013355	TGAAC	2	10	180615	180624	40 %	20 %	20 %	20 %	260752400
127	NC_013355	TGGTT	2	10	181359	181368	0 %	60 %	40 %	0 %	260752400
128	NC_013355	TTGCC	2	10	183450	183459	0 %	40 %	20 %	40 %	260752401
129	NC_013355	GCAAG	2	10	183570	183579	40 %	0 %	40 %	20 %	260752401
130	NC_013355	ATCAG	2	10	184234	184243	40 %	20 %	20 %	20 %	260752402
131	NC_013355	GCCAA	2	10	184716	184725	40 %	0 %	20 %	40 %	260752402
132	NC_013355	AATCT	2	10	189893	189902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013355	GGGCG	2	10	191202	191211	0 %	0 %	80 %	20 %	260752408
134	NC_013355	CATAT	2	10	191811	191820	40 %	40 %	0 %	20 %	260752409
135	NC_013355	CTGTT	2	10	193202	193211	0 %	60 %	20 %	20 %	260752410
136	NC_013355	AGGGA	2	10	193565	193574	40 %	0 %	60 %	0 %	260752410
137	NC_013355	ATGGT	2	10	194216	194225	20 %	40 %	40 %	0 %	260752411
138	NC_013355	CGAAA	2	10	194451	194460	60 %	0 %	20 %	20 %	260752411
139	NC_013355	CAAGC	2	10	194680	194689	40 %	0 %	20 %	40 %	260752411
140	NC_013355	AAAGA	2	10	195477	195486	80 %	0 %	20 %	0 %	260752412
141	NC_013355	TTGTT	2	10	196659	196668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013355	TGCGA	2	10	197633	197642	20 %	20 %	40 %	20 %	260752415
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145	NC_013355	GAAAA	2	10	200065	200074	80 %	0 %	20 %	0 %	260752418
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147	NC_013355	TTGGC	2	10	202384	202393	0 %	40 %	40 %	20 %	260752421
148	NC_013355	GGGGT	2	10	203905	203914	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013355	AGGGC	2	10	204809	204818	20 %	0 %	60 %	20 %	260752423
150	NC_013355	CTATT	2	10	206392	206401	20 %	60 %	0 %	20 %	260752423
151	NC_013355	TTGGC	2	10	210339	210348	0 %	40 %	40 %	20 %	260752428
152	NC_013355	AGATC	2	10	211944	211953	40 %	20 %	20 %	20 %	260752429
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155	NC_013355	AGATC	2	10	214959	214968	40 %	20 %	20 %	20 %	260752431
156	NC_013355	TTTTA	2	10	217049	217058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013355	ATGAT	2	10	217785	217794	40 %	40 %	20 %	0 %	260752434
158	NC_013355	ATTGA	2	10	218648	218657	40 %	40 %	20 %	0 %	260752434
159	NC_013355	GCAGG	2	10	219540	219549	20 %	0 %	60 %	20 %	260752435
160	NC_013355	GATAG	2	10	221289	221298	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013355	CACGA	2	10	221733	221742	40 %	0 %	20 %	40 %	260752437
162	NC_013355	CCGAT	2	10	222066	222075	20 %	20 %	20 %	40 %	260752438
163	NC_013355	TGATT	2	10	223148	223157	20 %	60 %	20 %	0 %	260752439
164	NC_013355	GGTCT	2	10	223547	223556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013355	CTGTC	2	10	226525	226534	0 %	40 %	20 %	40 %	260752443
166	NC_013355	TCCAA	2	10	231530	231539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
167	NC_013355	AAAGG	2	10	233253	233262	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013355	TGGCG	2	10	234311	234320	0 %	20 %	60 %	20 %	260752449
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172	NC_013355	CAACC	2	10	239788	239797	40 %	0 %	0 %	60 %	260752450
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182	NC_013355	AGAAA	2	10	260191	260200	80 %	0 %	20 %	0 %	260752463
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199	NC_013355	ACGAT	2	10	285724	285733	40 %	20 %	20 %	20 %	260752483
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201	NC_013355	GAAAA	2	10	287574	287583	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
202	NC_013355	CATTA	2	10	288425	288434	40 %	40 %	0 %	20 %	260752486
203	NC_013355	GCTGC	2	10	288616	288625	0 %	20 %	40 %	40 %	260752486
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216	NC_013355	ATTTT	2	10	317920	317929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_013355	TTCAT	2	10	360400	360409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
243	NC_013355	CAATC	2	10	362294	362303	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
244	NC_013355	TCACC	2	10	363675	363684	20 %	20 %	0 %	60 %	260752557
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257	NC_013355	CTGTC	2	10	376073	376082	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_013355	TAGCC	2	10	376704	376713	20 %	20 %	20 %	40 %	260752567
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