MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	TAAA	2	8	186	193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017565	GCCC	2	8	235	242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017565	GATA	2	8	3953	3960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017565	AGAA	2	8	7137	7144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017565	AATA	2	8	7229	7236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017565	TTCT	2	8	8310	8317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017565	TGCC	2	8	8350	8357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017565	AAAG	2	8	8483	8490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017565	ACTC	2	8	10628	10635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017565	GGCT	2	8	13511	13518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017565	CGAC	2	8	16099	16106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017565	AATA	2	8	16503	16510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017565	TAAT	2	8	16832	16839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017565	TGAT	2	8	19402	19409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017565	TCAT	2	8	19548	19555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017565	CCAT	2	8	19600	19607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017565	ACCG	2	8	21100	21107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017565	AAGT	2	8	21139	21146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017565	ACTG	2	8	27721	27728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017565	AAAG	2	8	27834	27841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017565	TTTA	2	8	30250	30257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017565	AAAT	2	8	32403	32410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017565	TATT	2	8	32428	32435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017565	CAGC	2	8	34318	34325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017565	GAAT	2	8	34361	34368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017565	TTTA	2	8	35245	35252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017565	AATA	2	8	35261	35268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017565	TTAA	2	8	36692	36699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017565	TCAT	2	8	36931	36938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017565	ATCC	2	8	37032	37039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017565	CAGC	2	8	37065	37072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017565	TTAT	2	8	37755	37762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017565	ATTT	2	8	37788	37795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017565	CTTC	2	8	39819	39826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017565	AAAT	2	8	45108	45115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017565	TGCG	2	8	46352	46359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017565	CTTT	2	8	46990	46997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017565	GAAA	2	8	47001	47008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017565	CAAA	2	8	47035	47042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017565	TAAA	2	8	59335	59342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017565	TCCT	2	8	60685	60692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017565	GCCC	2	8	61195	61202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017565	GTTA	2	8	63281	63288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017565	CATA	2	8	65200	65207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017565	ACCA	2	8	65454	65461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017565	ATAA	2	8	66779	66786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017565	ATAA	2	8	66952	66959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017565	AGTG	2	8	71188	71195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017565	TGGC	2	8	71224	71231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.