MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 9273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	GCA	2	6	31	36	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017168	GAA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017168	TTG	2	6	202	207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017168	TAA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017168	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017168	GTT	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017168	CCA	2	6	511	516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017168	TTG	3	9	558	566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017168	ATC	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017168	CCG	2	6	619	624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017168	AAG	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017168	TGG	3	9	680	688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017168	GCC	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017168	TCA	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017168	TGA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017168	CTG	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017168	TCG	2	6	1186	1191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017168	CGT	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017168	ACC	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017168	GGC	2	6	1356	1361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017168	GCC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017168	GGC	2	6	1559	1564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017168	ATC	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017168	GCT	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017168	GCC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017168	TTG	2	6	1722	1727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017168	GTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017168	CGC	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017168	CAG	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017168	AGC	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017168	TTA	2	6	7750	7755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017168	TTA	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017168	ATA	2	6	9272	9277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017168	TAA	2	6	9365	9370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017168	ATT	2	6	10404	10409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017168	TCG	2	6	10520	10525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017168	GCG	2	6	10570	10575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017168	ATT	2	6	12109	12114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017168	TAT	2	6	12364	12369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017168	TGT	2	6	12402	12407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017168	ATC	2	6	13974	13979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017168	AAT	2	6	14004	14009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017168	TTG	2	6	14297	14302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017168	GGA	2	6	14406	14411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017168	AGA	2	6	14446	14451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017168	ATT	2	6	14468	14473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017168	GAT	2	6	14533	14538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017168	TTA	2	6	14700	14705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017168	AAT	2	6	14761	14766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017168	TCG	2	6	14783	14788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017168	TTC	2	6	14842	14847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017168	ATT	2	6	14866	14871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017168	ATC	2	6	14873	14878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017168	CAT	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017168	AAG	2	6	14974	14979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017168	TTG	2	6	15884	15889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017168	GTG	2	6	15899	15904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017168	ATT	2	6	15948	15953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017168	AAG	2	6	16011	16016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017168	CTA	2	6	16088	16093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017168	GGC	2	6	16164	16169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017168	CAA	2	6	16998	17003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017168	TCA	2	6	17028	17033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017168	TAG	2	6	17035	17040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017168	GGA	2	6	17057	17062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017168	TCA	2	6	17467	17472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017168	ACT	2	6	17478	17483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017168	TTG	2	6	17671	17676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017168	ACA	2	6	17716	17721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017168	CAC	2	6	17738	17743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017168	TAG	2	6	17779	17784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017168	GGC	2	6	17894	17899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017168	TTC	2	6	17945	17950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017168	ATC	2	6	18004	18009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017168	ATT	2	6	18153	18158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017168	ATT	2	6	18208	18213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017168	TAA	2	6	18342	18347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017168	TAA	2	6	18496	18501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017168	CTT	2	6	18531	18536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017168	AAT	2	6	18615	18620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017168	ATT	2	6	18731	18736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017168	ATT	2	6	18798	18803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017168	TGG	2	6	18821	18826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017168	TAA	2	6	18848	18853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017168	GCT	2	6	19375	19380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017168	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017168	ATT	2	6	25290	25295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017168	CGC	2	6	25322	25327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017168	TAC	2	6	25523	25528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017168	TAT	2	6	32885	32890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017168	GCT	2	6	32964	32969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017168	CAA	2	6	32996	33001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017168	ATT	2	6	33099	33104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017168	GAT	2	6	33224	33229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017168	ATT	2	6	33327	33332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017168	GAT	2	6	33363	33368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017168	CAA	2	6	34100	34105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017168	AGC	2	6	34108	34113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017168	TAT	2	6	34154	34159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017168	GTC	2	6	34174	34179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017168	ATT	2	6	34201	34206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017168	TCT	2	6	34233	34238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017168	TAA	2	6	34346	34351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017168	TGG	2	6	34486	34491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017168	GGT	2	6	34501	34506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017168	ATT	2	6	34523	34528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017168	AGG	2	6	34649	34654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017168	AAT	2	6	34743	34748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017168	CCT	2	6	38656	38661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017168	ATC	2	6	38708	38713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017168	TAA	2	6	39449	39454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017168	TGG	2	6	39589	39594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017168	GGT	2	6	39604	39609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017168	AGG	2	6	39752	39757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017168	AAT	2	6	39846	39851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017168	ATG	2	6	40704	40709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017168	TCC	2	6	41100	41105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017168	TCC	2	6	41144	41149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017168	TTC	2	6	41153	41158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017168	GTA	2	6	41181	41186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017168	GAT	3	9	41205	41213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017168	AAT	2	6	41268	41273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017168	ATT	2	6	41650	41655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017168	AGG	2	6	41670	41675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017168	CTA	2	6	41745	41750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017168	TTC	2	6	41761	41766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017168	ATT	2	6	41802	41807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017168	CCG	2	6	41891	41896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017168	GCA	2	6	44428	44433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017168	ATT	2	6	44543	44548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017168	CTT	2	6	44577	44582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017168	ATG	2	6	44605	44610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017168	AAC	2	6	44696	44701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017168	CGT	2	6	45696	45701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017168	GCA	2	6	48294	48299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017168	CTG	2	6	51771	51776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017168	ATT	2	6	51802	51807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017168	TTA	2	6	51847	51852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017168	TTA	2	6	51865	51870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017168	TGA	2	6	52968	52973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017168	GCC	2	6	53070	53075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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410	NC_017168	TAA	2	6	194293	194298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_017168	TTA	2	6	208403	208408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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