MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017168	G	6	6	1158480	1158485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017168	GAA	2	6	1160683	1160688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017168	GAG	2	6	1160719	1160724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017168	G	6	6	1160724	1160729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017168	GGA	2	6	1160731	1160736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017168	GGC	2	6	1160761	1160766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017168	GAAAA	2	10	1160773	1160782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017168	CA	3	6	1161883	1161888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_017168	CCAG	2	8	1161891	1161898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_017168	CAGT	2	8	1161940	1161947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_017168	ATT	2	6	1162001	1162006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017168	ATT	2	6	1162037	1162042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017168	ACA	2	6	1162049	1162054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017168	ATT	2	6	1162067	1162072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017168	ATC	2	6	1162127	1162132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017168	TGA	2	6	1162142	1162147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017168	TGA	2	6	1162149	1162154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017168	CCT	2	6	1162216	1162221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_017168	TTG	2	6	1162249	1162254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017168	A	6	6	1162371	1162376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017168	ATG	2	6	1163048	1163053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017168	A	6	6	1163898	1163903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017168	TGC	2	6	1163997	1164002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017168	A	6	6	1164064	1164069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017168	TTA	2	6	1164094	1164099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017168	CAT	2	6	1164121	1164126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017168	T	7	7	1164135	1164141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017168	A	7	7	1164172	1164178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017168	TGT	2	6	1165233	1165238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017168	GGA	2	6	1165308	1165313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017168	TGG	2	6	1165361	1165366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017168	GCA	2	6	1165450	1165455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017168	CCATT	2	10	1165504	1165513	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4034	NC_017168	CTCG	2	8	1168539	1168546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_017168	TA	3	6	1168875	1168880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017168	TTA	2	6	1168991	1168996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017168	TGT	2	6	1169735	1169740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017168	CTG	2	6	1169771	1169776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017168	ACAA	2	8	1170067	1170074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_017168	ATC	2	6	1170078	1170083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017168	T	6	6	1170112	1170117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017168	AAT	2	6	1170123	1170128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017168	TTA	2	6	1170143	1170148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017168	CAA	2	6	1170172	1170177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017168	GTT	2	6	1170195	1170200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017168	TG	3	6	1170202	1170207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017168	GTTT	2	8	1170261	1170268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017168	AAT	2	6	1170330	1170335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017168	GCT	2	6	1172346	1172351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017168	ATT	2	6	1172371	1172376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017168	GAA	2	6	1172413	1172418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017168	GAT	2	6	1173702	1173707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017168	AGG	2	6	1173724	1173729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017168	CGC	2	6	1174430	1174435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_017168	CGC	2	6	1174979	1174984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_017168	GCC	2	6	1175010	1175015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_017168	GT	3	6	1175021	1175026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017168	CT	4	8	1175041	1175048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_017168	TAA	2	6	1175065	1175070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017168	AATAC	2	10	1175087	1175096	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4061	NC_017168	AGC	2	6	1175106	1175111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017168	CTTA	2	8	1175642	1175649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_017168	GTCA	2	8	1175689	1175696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_017168	TCA	2	6	1175703	1175708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017168	ATC	2	6	1175727	1175732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017168	GCG	2	6	1175736	1175741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017168	AT	3	6	1175815	1175820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017168	ATT	2	6	1175846	1175851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017168	T	6	6	1175850	1175855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017168	A	6	6	1175867	1175872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017168	TTCA	2	8	1175884	1175891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_017168	TTAA	2	8	1175899	1175906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017168	AAAGA	2	10	1175923	1175932	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017168	GCC	2	6	1176019	1176024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_017168	GTAT	2	8	1176087	1176094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017168	GCA	2	6	1176098	1176103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_017168	CTA	2	6	1176514	1176519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017168	T	6	6	1176545	1176550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017168	GAA	2	6	1176579	1176584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017168	ATT	2	6	1176618	1176623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017168	TTC	2	6	1178627	1178632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017168	ATT	2	6	1178692	1178697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017168	T	7	7	1178762	1178768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017168	CTT	2	6	1178805	1178810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017168	TGA	2	6	1178832	1178837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017168	ATC	2	6	1179594	1179599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017168	A	6	6	1179623	1179628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017168	TTAA	2	8	1179662	1179669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017168	GAA	2	6	1179727	1179732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017168	AAT	2	6	1179744	1179749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017168	ATG	2	6	1179769	1179774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017168	CTT	2	6	1179787	1179792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017168	A	7	7	1179847	1179853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017168	GTC	2	6	1179924	1179929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017168	TCA	2	6	1179981	1179986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017168	T	6	6	1179993	1179998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017168	TAT	2	6	1180924	1180929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017168	ATTC	2	8	1180941	1180948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_017168	CA	3	6	1180949	1180954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_017168	AAT	2	6	1181022	1181027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017168	GA	3	6	1184099	1184104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017168	TAAT	2	8	1186842	1186849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017168	AGC	2	6	1188343	1188348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017168	G	10	10	1188458	1188467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017168	TGG	3	9	1188488	1188496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017168	TGA	2	6	1188501	1188506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017168	TGA	3	9	1188600	1188608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017168	TGG	2	6	1188647	1188652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017168	CGG	2	6	1188692	1188697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017168	TCA	2	6	1188747	1188752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017168	GCG	2	6	1188780	1188785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017168	GTG	2	6	1188835	1188840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017168	AACC	2	8	1188937	1188944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_017168	CAG	2	6	1188949	1188954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017168	AGC	2	6	1189004	1189009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017168	ACA	2	6	1189098	1189103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017168	CAG	2	6	1189171	1189176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017168	GAC	2	6	1189183	1189188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017168	CAA	2	6	1189189	1189194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017168	CAA	2	6	1189210	1189215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017168	ATAA	2	8	1189219	1189226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017168	TGC	2	6	1189271	1189276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017168	GAA	2	6	1189335	1189340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017168	CGA	2	6	1189436	1189441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017168	GC	3	6	1189507	1189512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_017168	GGC	2	6	1189533	1189538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017168	GGC	2	6	1189545	1189550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017168	GTC	2	6	1189561	1189566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017168	GGGC	2	8	1189672	1189679	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4131	NC_017168	TGAT	2	8	1189733	1189740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_017168	GA	3	6	1216962	1216967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_017168	TTA	3	9	1217004	1217012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4384	NC_017168	CGA	2	6	1251768	1251773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4391	NC_017168	AATT	2	8	1254019	1254026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_017168	TTA	2	6	1254027	1254032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_017168	TGT	2	6	1254033	1254038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_017168	TA	3	6	1254095	1254100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_017168	A	6	6	1254100	1254105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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