MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017168	TGT	2	6	420390	420395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017168	AATA	2	8	420426	420433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017168	CT	3	6	425502	425507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017168	ATT	2	6	431256	431261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017168	ATT	2	6	431297	431302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017168	CT	3	6	432325	432330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_017168	A	6	6	432335	432340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017168	AT	4	8	435805	435812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017168	TCA	2	6	436975	436980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017168	CG	3	6	437047	437052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_017168	A	6	6	437117	437122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017168	TAA	2	6	437165	437170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017168	GTT	2	6	437225	437230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017168	ACC	2	6	438711	438716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_017168	CAGAG	2	10	438728	438737	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_017168	C	6	6	438748	438753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1517	NC_017168	GAT	2	6	438761	438766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017168	A	6	6	439806	439811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017168	GCG	2	6	442216	442221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017168	GCTT	2	8	442225	442232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_017168	AAC	2	6	442252	442257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017168	TTTG	2	8	442262	442269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017168	TC	3	6	442284	442289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_017168	GTTT	2	8	442318	442325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017168	ATT	2	6	442336	442341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017168	CAGG	2	8	443383	443390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_017168	ATT	2	6	443848	443853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017168	ACC	3	9	443908	443916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_017168	GCC	2	6	444149	444154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_017168	CAA	2	6	444407	444412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017168	AG	3	6	454542	454547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017168	TTAA	2	8	454553	454560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017168	GAG	2	6	456265	456270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017168	TTCCC	2	10	456271	456280	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1535	NC_017168	ACATAA	2	12	456295	456306	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1536	NC_017168	TTACG	2	10	456310	456319	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_017168	TAA	2	6	456347	456352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017168	TAA	2	6	456362	456367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017168	AAT	2	6	456369	456374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017168	ATG	2	6	456378	456383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017168	ACAG	2	8	456396	456403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_017168	AAT	3	9	456498	456506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017168	ATT	2	6	456515	456520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017168	AT	3	6	456595	456600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017168	A	7	7	456606	456612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017168	AAAAT	2	10	456735	456744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017168	GTG	2	6	456764	456769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017168	AAC	2	6	456897	456902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017168	ATG	2	6	456936	456941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017168	A	6	6	456943	456948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017168	TAG	2	6	456964	456969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017168	ATAA	2	8	457633	457640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017168	T	7	7	458970	458976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017168	CA	3	6	458998	459003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_017168	A	6	6	459007	459012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017168	C	6	6	463538	463543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1557	NC_017168	AAC	2	6	463563	463568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017168	AATC	2	8	463626	463633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_017168	ATA	2	6	463636	463641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017168	ATTTA	2	10	463645	463654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017168	TA	3	6	463653	463658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017168	TACT	2	8	463675	463682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_017168	CGG	2	6	464306	464311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017168	TCAA	2	8	464337	464344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_017168	CAC	2	6	464399	464404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_017168	A	6	6	464420	464425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017168	GCG	2	6	464458	464463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_017168	AAT	2	6	464474	464479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017168	GGTT	2	8	464480	464487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017168	AGA	2	6	466536	466541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017168	AAT	2	6	466601	466606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017168	AAT	2	6	467845	467850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017168	T	7	7	467895	467901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017168	CTA	2	6	467986	467991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017168	CCT	2	6	468029	468034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_017168	ATT	2	6	468044	468049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017168	ATAA	2	8	468075	468082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017168	AAAC	2	8	468095	468102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_017168	TTA	2	6	468107	468112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017168	A	6	6	468121	468126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017168	A	6	6	468141	468146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017168	A	6	6	468188	468193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017168	TAA	2	6	468223	468228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017168	TAA	2	6	468250	468255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017168	ATT	2	6	468256	468261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017168	AC	4	8	468274	468281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_017168	TAT	2	6	471444	471449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017168	GAT	2	6	471455	471460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017168	TC	3	6	471466	471471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_017168	CTTAA	2	10	471481	471490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1591	NC_017168	CTG	2	6	472077	472082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_017168	TAA	2	6	472139	472144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017168	TCT	2	6	472166	472171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_017168	TCT	2	6	472196	472201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017168	TTTTA	2	10	472208	472217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017168	CAAC	2	8	473275	473282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_017168	TAA	2	6	473312	473317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017168	ATCG	2	8	473347	473354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_017168	ATTT	2	8	473373	473380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017168	TA	3	6	473383	473388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017168	T	7	7	473391	473397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017168	TTA	2	6	473406	473411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017168	TAAAT	2	10	473426	473435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017168	T	7	7	473462	473468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017168	AC	3	6	473516	473521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_017168	ATA	2	6	473532	473537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017168	TAA	2	6	473621	473626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017168	AGC	2	6	473675	473680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017168	CAGT	2	8	475051	475058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_017168	T	7	7	475074	475080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017168	CAA	2	6	475198	475203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017168	GGA	2	6	475777	475782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017168	TATT	2	8	475783	475790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017168	TAA	2	6	476379	476384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017168	A	6	6	476440	476445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017168	TCA	2	6	479473	479478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_017168	TAAA	2	8	479548	479555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017168	TTA	2	6	479595	479600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017168	ATTG	2	8	479603	479610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017168	TAT	2	6	481226	481231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017168	TTG	2	6	481293	481298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017168	GCTTT	2	10	481321	481330	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1623	NC_017168	GC	3	6	481336	481341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_017168	GCC	2	6	481379	481384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_017168	AAGA	2	8	481506	481513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017168	A	8	8	481520	481527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017168	GTC	2	6	481539	481544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_017168	CTGA	2	8	481620	481627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_017168	ACC	2	6	481684	481689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_017168	GCA	2	6	481696	481701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017168	CCA	2	6	481735	481740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_017168	CT	3	6	483098	483103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_017168	CCTG	2	8	483116	483123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_017168	CTA	2	6	483136	483141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017168	TC	3	6	483175	483180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_017168	GCC	2	6	483324	483329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1637	NC_017168	ATG	2	6	484160	484165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_017168	ATT	2	6	484190	484195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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