MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017168	TAT	2	6	4401069	4401074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_017168	ACC	2	6	4401766	4401771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_017168	T	6	6	4401832	4401837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017168	CAT	2	6	4401911	4401916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_017168	GC	4	8	4401951	4401958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16007	NC_017168	ATCA	2	8	4401971	4401978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_017168	GAAA	2	8	4401980	4401987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16011	NC_017168	ATAGAT	2	12	4402049	4402060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_017168	A	6	6	4402089	4402094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_017168	C	6	6	4402140	4402145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16014	NC_017168	ATT	2	6	4402170	4402175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_017168	ACC	2	6	4402220	4402225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16017	NC_017168	GCTG	2	8	4403387	4403394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16018	NC_017168	CCTA	2	8	4403395	4403402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16019	NC_017168	GC	3	6	4403459	4403464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_017168	CGTT	2	8	4406062	4406069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16021	NC_017168	CT	3	6	4406079	4406084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16022	NC_017168	GA	4	8	4406117	4406124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_017168	CAT	3	9	4406131	4406139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16042	NC_017168	A	8	8	4409806	4409813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_017168	T	6	6	4409823	4409828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_017168	T	6	6	4409850	4409855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_017168	TAA	2	6	4409946	4409951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16047	NC_017168	ATT	3	9	4410007	4410015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16049	NC_017168	T	7	7	4410048	4410054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_017168	TAAA	2	8	4410067	4410074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_017168	ATTTT	2	10	4410096	4410105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_017168	T	9	9	4410102	4410110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_017168	ATT	2	6	4410111	4410116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_017168	TTAA	2	8	4410122	4410129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_017168	TTA	2	6	4410152	4410157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16058	NC_017168	ATT	2	6	4410236	4410241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16063	NC_017168	TTA	2	6	4411198	4411203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_017168	TA	3	6	4411202	4411207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_017168	ATA	2	6	4411217	4411222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16070	NC_017168	TA	3	6	4411342	4411347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16109	NC_017168	CCT	2	6	4418035	4418040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_017168	ATAG	2	8	4418085	4418092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_017168	A	6	6	4418102	4418107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_017168	T	6	6	4418121	4418126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_017168	TGC	2	6	4418163	4418168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_017168	ATA	2	6	4418185	4418190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16125	NC_017168	A	6	6	4427114	4427119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_017168	CA	3	6	4427120	4427125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16127	NC_017168	TATGT	2	10	4427133	4427142	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_017168	ACA	2	6	4427193	4427198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_017168	CAT	2	6	4427281	4427286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16131	NC_017168	TTA	2	6	4428830	4428835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16256	NC_017168	AAT	2	6	4445381	4445386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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