MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017168	TAA	2	6	280298	280303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017168	AAT	2	6	280332	280337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017168	TAA	2	6	280405	280410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017168	ATC	2	6	280426	280431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017168	AGGA	2	8	282747	282754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017168	AAT	2	6	288418	288423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017168	TTC	2	6	288433	288438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017168	AAGA	2	8	288454	288461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017168	ATGC	2	8	288463	288470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_017168	ATA	2	6	288493	288498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017168	TGG	2	6	288500	288505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017168	CAT	2	6	288514	288519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017168	ATT	2	6	288532	288537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017168	ATT	2	6	288540	288545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017168	TA	3	6	288589	288594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017168	TGA	2	6	288638	288643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017168	TAAAT	2	10	288958	288967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017168	T	6	6	288999	289004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017168	TTA	2	6	289029	289034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017168	T	6	6	289044	289049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017168	GGA	2	6	289095	289100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017168	G	6	6	289134	289139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017168	TCA	2	6	289171	289176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017168	TGA	2	6	289179	289184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017168	TTA	2	6	289185	289190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017168	T	6	6	289219	289224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017168	TAT	2	6	289245	289250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017168	AAT	2	6	289399	289404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017168	T	6	6	291452	291457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017168	GTTT	2	8	291498	291505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017168	T	6	6	291503	291508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017168	TAA	2	6	291513	291518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017168	A	6	6	291543	291548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017168	GTT	2	6	291597	291602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017168	GAG	2	6	291656	291661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017168	T	7	7	292766	292772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017168	TAGC	2	8	292787	292794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_017168	TCA	2	6	292803	292808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017168	CTCA	2	8	292828	292835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_017168	AAT	2	6	292880	292885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017168	CTT	2	6	292913	292918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017168	AAT	2	6	292926	292931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017168	TG	3	6	292939	292944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017168	TTA	2	6	292978	292983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017168	AT	3	6	292988	292993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017168	ATG	2	6	292999	293004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017168	TTA	2	6	293012	293017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017168	AAT	2	6	293024	293029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017168	CA	3	6	294878	294883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_017168	CTG	2	6	294905	294910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017168	GAACC	2	10	295440	295449	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_017168	TC	3	6	295646	295651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_017168	TAAAAG	15	90	295704	295793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017168	TAAAGG	15	90	295794	295883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017168	A	6	6	295896	295901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017168	TAA	2	6	295912	295917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017168	A	6	6	295926	295931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017168	AAT	2	6	295946	295951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017168	ATG	2	6	296369	296374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017168	GGCG	2	8	296381	296388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_017168	G	6	6	296424	296429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017168	ATA	2	6	296498	296503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017168	AATC	2	8	296519	296526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_017168	TGC	2	6	296623	296628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017168	CAG	2	6	296689	296694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017168	AC	3	6	296723	296728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017168	G	9	9	296764	296772	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017168	AAT	2	6	296778	296783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017168	GGT	2	6	296814	296819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017168	GCA	2	6	296868	296873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017168	GTG	2	6	296877	296882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017168	CAG	2	6	296901	296906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017168	TGA	2	6	296917	296922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017168	GCG	2	6	296932	296937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017168	TGA	2	6	296957	296962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017168	CCA	2	6	297034	297039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_017168	TAAA	2	8	298655	298662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017168	CAT	2	6	298685	298690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017168	CTTG	2	8	298709	298716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_017168	TATG	2	8	298736	298743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017168	ATT	2	6	298762	298767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017168	AAT	2	6	298824	298829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017168	CAGC	2	8	298846	298853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_017168	C	6	6	298939	298944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1085	NC_017168	GCC	2	6	299041	299046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_017168	AAC	2	6	299076	299081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017168	TA	3	6	302070	302075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017168	TA	4	8	302082	302089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017168	AAC	2	6	305276	305281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017168	TATTT	2	10	305292	305301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017168	AAT	2	6	305332	305337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017168	ATTT	2	8	305359	305366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017168	AAAT	2	8	305376	305383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017168	TAA	2	6	305396	305401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017168	AATTC	2	10	306702	306711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_017168	ATT	2	6	306776	306781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017168	A	6	6	306872	306877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017168	TTA	2	6	306903	306908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017168	C	6	6	306953	306958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1100	NC_017168	TC	3	6	308192	308197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017168	ATT	2	6	308258	308263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017168	A	6	6	308354	308359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017168	TTA	2	6	308385	308390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017168	GTT	2	6	308466	308471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017168	GCC	2	6	308498	308503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017168	AGG	2	6	308514	308519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017168	CT	3	6	308526	308531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017168	ATCAAA	2	12	308564	308575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1109	NC_017168	C	7	7	308666	308672	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_017168	GTA	3	9	309955	309963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017168	TG	3	6	309981	309986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017168	TGT	2	6	310013	310018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017168	TAA	2	6	310059	310064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017168	TTA	2	6	310071	310076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017168	GAC	2	6	310106	310111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017168	A	6	6	310122	310127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017168	ATT	2	6	310132	310137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017168	T	7	7	310136	310142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017168	A	8	8	310143	310150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017168	ATT	2	6	310152	310157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017168	ATC	2	6	310178	310183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017168	AAT	2	6	310218	310223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017168	ATAA	2	8	310267	310274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017168	TTA	2	6	310277	310282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017168	ATT	2	6	310291	310296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017168	TAA	2	6	310311	310316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017168	GAA	2	6	310331	310336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017168	TAA	2	6	310362	310367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017168	A	6	6	310385	310390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017168	ACA	2	6	310411	310416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017168	AAT	2	6	310449	310454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017168	CCT	2	6	310462	310467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_017168	AAT	2	6	310468	310473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017168	AATTA	2	10	310497	310506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017168	A	6	6	312054	312059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_017168	TGC	2	6	312119	312124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_017168	AATTAA	2	12	414443	414454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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