MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017168	CTG	2	6	122188	122193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017168	GAG	2	6	122217	122222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017168	TTCAC	2	10	125070	125079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
504	NC_017168	CTAGA	2	10	126636	126645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
505	NC_017168	GGA	2	6	126709	126714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017168	TAA	2	6	127255	127260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017168	TCA	2	6	127293	127298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017168	TCAA	2	8	127318	127325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_017168	AG	4	8	127326	127333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017168	CTT	2	6	130748	130753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017168	GAA	2	6	130786	130791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017168	A	6	6	130925	130930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017168	ATG	2	6	130985	130990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017168	AAGA	2	8	130993	131000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017168	GAA	2	6	131008	131013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017168	TAATC	2	10	133635	133644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_017168	TC	3	6	133806	133811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017168	TA	3	6	133875	133880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017168	G	6	6	133911	133916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017168	TA	3	6	133917	133922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017168	GGGA	2	8	135178	135185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017168	GCT	2	6	135743	135748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017168	ATT	2	6	135901	135906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017168	TAA	2	6	135916	135921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017168	TAA	3	9	135949	135957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017168	ACTCT	2	10	135987	135996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
527	NC_017168	TAAT	2	8	136776	136783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017168	CAAA	2	8	136803	136810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_017168	CTA	2	6	136842	136847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017168	TATT	2	8	136853	136860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017168	CAA	2	6	137597	137602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017168	T	6	6	137620	137625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017168	GGGATA	2	12	137635	137646	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017168	T	6	6	137657	137662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017168	CG	3	6	137666	137671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_017168	C	7	7	137751	137757	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
537	NC_017168	CCAT	2	8	137848	137855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_017168	ACTG	2	8	137878	137885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_017168	TTA	2	6	137891	137896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017168	TCAG	2	8	137906	137913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_017168	AATT	2	8	137932	137939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017168	CGG	2	6	140303	140308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017168	AGT	2	6	140414	140419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017168	GTG	2	6	140476	140481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017168	GGA	2	6	140542	140547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017168	T	6	6	140565	140570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017168	TC	3	6	141278	141283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_017168	AATT	2	8	141295	141302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017168	AAAT	2	8	141337	141344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017168	GCG	2	6	141413	141418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017168	AGT	2	6	142464	142469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017168	T	6	6	142608	142613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017168	GAT	2	6	143836	143841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017168	TAA	2	6	143945	143950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017168	CT	3	6	144062	144067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_017168	CAA	2	6	144201	144206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017168	TCA	2	6	144239	144244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017168	ATAA	2	8	144294	144301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017168	GAT	2	6	144304	144309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017168	TGG	2	6	146217	146222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017168	ATA	2	6	146286	146291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017168	GGC	2	6	146297	146302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017168	TA	3	6	146341	146346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017168	AGC	2	6	146630	146635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017168	ATT	2	6	146984	146989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017168	GAA	2	6	147042	147047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017168	GCT	2	6	147099	147104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017168	CAT	2	6	147173	147178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017168	GCA	2	6	147218	147223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017168	ATGG	2	8	147340	147347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017168	CCT	2	6	147349	147354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017168	CGT	2	6	150266	150271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017168	TTG	2	6	150317	150322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017168	GA	3	6	150340	150345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017168	ACTC	2	8	150394	150401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_017168	TATTT	2	10	150402	150411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_017168	AATAAA	2	12	150435	150446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017168	T	6	6	150451	150456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017168	TTG	2	6	150506	150511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017168	TG	3	6	150510	150515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017168	AATA	2	8	150813	150820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017168	ATA	2	6	150823	150828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017168	TTA	2	6	151649	151654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017168	TGA	2	6	151751	151756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_017168	GCA	2	6	151779	151784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_017168	CGA	2	6	152196	152201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_017168	AT	3	6	153277	153282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017168	AAGA	2	8	153293	153300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017168	A	8	8	153304	153311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017168	AT	3	6	153313	153318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_017168	GCTT	2	8	154646	154653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_017168	TGT	3	9	154705	154713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_017168	TA	4	8	154763	154770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_017168	TGC	2	6	154833	154838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_017168	ATTAA	2	10	155596	155605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017168	CAT	2	6	155635	155640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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613	NC_017168	T	6	6	155725	155730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017168	ATAA	2	8	155759	155766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017168	TCT	2	6	155779	155784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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617	NC_017168	GAT	2	6	155796	155801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017168	GAATG	2	10	155880	155889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017168	AAT	2	6	155940	155945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017168	ATT	2	6	155972	155977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017168	TGA	2	6	156022	156027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017168	CAG	2	6	156152	156157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017168	ATC	2	6	156185	156190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_017168	ACTT	2	8	157217	157224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_017168	TA	3	6	157244	157249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017168	TG	3	6	157271	157276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017168	A	6	6	157321	157326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017168	GTAA	2	8	157327	157334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017168	GCA	2	6	157380	157385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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632	NC_017168	GCC	2	6	157430	157435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_017168	AATT	2	8	157449	157456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017168	TAA	2	6	157468	157473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017168	TTG	2	6	157476	157481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017168	TTG	2	6	157492	157497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017168	T	7	7	157523	157529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017168	T	7	7	157569	157575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_017168	ATT	2	6	157614	157619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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