MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017168	GAAA	2	8	1693866	1693873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017168	AAG	2	6	1693887	1693892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017168	AG	3	6	1696601	1696606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017168	TTAAC	2	10	1696619	1696628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_017168	AAGG	2	8	1696640	1696647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017168	TCT	2	6	1696652	1696657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_017168	CGGG	2	8	1696680	1696687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_017168	AG	3	6	1696703	1696708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017168	ATT	2	6	1696951	1696956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017168	GCT	2	6	1697068	1697073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_017168	AGCC	2	8	1697146	1697153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_017168	TCC	2	6	1697184	1697189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_017168	ATT	2	6	1697248	1697253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017168	A	6	6	1697256	1697261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017168	ACA	2	6	1697295	1697300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017168	T	6	6	1697628	1697633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017168	TGA	2	6	1698689	1698694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017168	A	6	6	1698694	1698699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017168	AAT	2	6	1698708	1698713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017168	ACA	2	6	1698805	1698810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_017168	TCA	2	6	1698862	1698867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017168	AT	3	6	1698889	1698894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017168	CA	3	6	1698899	1698904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_017168	GGC	2	6	1698938	1698943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_017168	TGT	2	6	1699037	1699042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017168	TTG	2	6	1699090	1699095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017168	ATG	2	6	1699096	1699101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017168	TTG	2	6	1699107	1699112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017168	ATG	2	6	1699113	1699118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017168	TGGC	2	8	1699124	1699131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_017168	TC	3	6	1700080	1700085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_017168	GTT	2	6	1701873	1701878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017168	CACT	2	8	1701884	1701891	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_017168	ATTC	2	8	1701926	1701933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_017168	TGC	2	6	1701937	1701942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017168	GTT	2	6	1701997	1702002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017168	CACT	2	8	1702008	1702015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_017168	ATTC	2	8	1702050	1702057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_017168	TGC	2	6	1702061	1702066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_017168	GTT	2	6	1702121	1702126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017168	CACC	2	8	1702136	1702143	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6042	NC_017168	AGAAA	2	10	1702201	1702210	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017168	A	6	6	1702208	1702213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017168	CCAT	2	8	1702287	1702294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_017168	TGT	2	6	1702326	1702331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017168	GCT	2	6	1702349	1702354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017168	GAC	2	6	1702362	1702367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_017168	T	8	8	1702384	1702391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017168	AT	3	6	1702400	1702405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017168	ACTC	2	8	1702425	1702432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_017168	TAA	2	6	1702456	1702461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017168	ATT	2	6	1702464	1702469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_017168	T	7	7	1702539	1702545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017168	T	6	6	1702547	1702552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017168	AT	3	6	1702553	1702558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017168	A	7	7	1702565	1702571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017168	TAA	2	6	1702592	1702597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017168	TAA	2	6	1702614	1702619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017168	ATA	2	6	1702629	1702634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017168	ATTG	2	8	1702641	1702648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017168	TGG	2	6	1702673	1702678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017168	AAT	2	6	1702698	1702703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017168	ACT	2	6	1702711	1702716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017168	A	7	7	1702774	1702780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017168	CT	3	6	1702788	1702793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_017168	TTC	2	6	1702812	1702817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_017168	T	6	6	1702917	1702922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017168	ATGC	2	8	1702926	1702933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_017168	A	6	6	1702946	1702951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017168	TAAA	2	8	1702960	1702967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017168	GTT	2	6	1703011	1703016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017168	ATTA	2	8	1703020	1703027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017168	A	6	6	1703091	1703096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017168	C	6	6	1703100	1703105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6075	NC_017168	TTA	2	6	1703115	1703120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_017168	G	6	6	1703130	1703135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_017168	CAATT	2	10	1703136	1703145	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6078	NC_017168	ATG	2	6	1703171	1703176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_017168	TG	3	6	1705039	1705044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_017168	CAT	2	6	1705058	1705063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_017168	GCC	2	6	1705144	1705149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_017168	ATT	2	6	1705164	1705169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017168	CAT	2	6	1705655	1705660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_017168	A	6	6	1705664	1705669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_017168	CTG	2	6	1705674	1705679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_017168	ACG	2	6	1705701	1705706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_017168	A	8	8	1705802	1705809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_017168	G	6	6	1705863	1705868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017168	TGG	2	6	1707677	1707682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017168	ACC	2	6	1707729	1707734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_017168	GGT	2	6	1707758	1707763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_017168	ATTA	2	8	1707774	1707781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017168	A	6	6	1707828	1707833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017168	CTT	2	6	1708834	1708839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_017168	GCC	2	6	1708850	1708855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_017168	TGA	2	6	1709024	1709029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017168	ATT	2	6	1709086	1709091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017168	A	6	6	1709115	1709120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017168	GTCA	2	8	1711176	1711183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_017168	ACTT	2	8	1711206	1711213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_017168	TGT	2	6	1711281	1711286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017168	TGAC	2	8	1711342	1711349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_017168	TTG	2	6	1711388	1711393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017168	TGGT	2	8	1711404	1711411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017168	ATTTT	2	10	1711423	1711432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017168	AGA	2	6	1712517	1712522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017168	AATT	2	8	1712550	1712557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017168	GCA	2	6	1712564	1712569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017168	GAAT	2	8	1712614	1712621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017168	CTG	2	6	1712632	1712637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017168	TTAC	2	8	1712660	1712667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_017168	TTG	2	6	1712686	1712691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017168	GTT	2	6	1716271	1716276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017168	TTG	2	6	1722632	1722637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017168	CAA	2	6	1722666	1722671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_017168	TGC	2	6	1722707	1722712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_017168	A	6	6	1722732	1722737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017168	TAA	2	6	1722794	1722799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017168	ATT	2	6	1728519	1728524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017168	GGAG	2	8	1728683	1728690	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017168	ATC	2	6	1729846	1729851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_017168	ATG	2	6	1734500	1734505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017168	GCA	3	9	1734519	1734527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_017168	TTTG	2	8	1734531	1734538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017168	GCA	2	6	1734558	1734563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_017168	CGT	2	6	1734615	1734620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_017168	GCG	2	6	1734784	1734789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_017168	GAGG	2	8	1734850	1734857	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017168	T	6	6	1734872	1734877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017168	CAA	2	6	1734882	1734887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_017168	T	6	6	1734906	1734911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6133	NC_017168	TTC	2	6	1735030	1735035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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