MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017168	GCG	2	6	1540840	1540845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017168	GAG	2	6	1540856	1540861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017168	TG	3	6	1540881	1540886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017168	G	6	6	1541001	1541006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017168	TCC	2	6	1541011	1541016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_017168	CTGA	2	8	1541031	1541038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_017168	GTAC	2	8	1541115	1541122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_017168	GTG	2	6	1541142	1541147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017168	GGA	2	6	1541319	1541324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017168	GAA	2	6	1541517	1541522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017168	AC	3	6	1541537	1541542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_017168	CGTC	2	8	1541555	1541562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_017168	AAC	2	6	1541574	1541579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017168	AGC	2	6	1541664	1541669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017168	CAT	2	6	1541670	1541675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017168	AAAG	2	8	1541678	1541685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017168	GTT	2	6	1541773	1541778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017168	G	6	6	1542015	1542020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017168	AGGCT	2	10	1542028	1542037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5520	NC_017168	TGA	2	6	1542117	1542122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017168	CAC	2	6	1542128	1542133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_017168	GGT	2	6	1542216	1542221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017168	GA	3	6	1542246	1542251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017168	GCTG	2	8	1542359	1542366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_017168	TAA	2	6	1542375	1542380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017168	CGG	2	6	1542500	1542505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_017168	ATG	2	6	1542576	1542581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017168	ACC	2	6	1542771	1542776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_017168	TGG	2	6	1542831	1542836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017168	TCC	2	6	1542857	1542862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_017168	GGA	2	6	1542874	1542879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017168	AGCT	2	8	1542934	1542941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_017168	GGT	2	6	1542994	1542999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017168	CGG	2	6	1543081	1543086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017168	TCA	2	6	1543109	1543114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017168	CGT	2	6	1543189	1543194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017168	GCT	2	6	1543243	1543248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017168	GT	3	6	1543442	1543447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017168	ACA	2	6	1543503	1543508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_017168	GA	4	8	1543527	1543534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017168	CGT	2	6	1543542	1543547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017168	GGC	2	6	1543615	1543620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017168	GGT	2	6	1543629	1543634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017168	T	6	6	1543765	1543770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017168	TG	3	6	1543773	1543778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017168	A	6	6	1543874	1543879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017168	TCC	2	6	1543896	1543901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_017168	GAC	2	6	1543950	1543955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017168	GTA	2	6	1544024	1544029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017168	CTT	2	6	1544036	1544041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_017168	TGA	2	6	1544068	1544073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017168	TAG	2	6	1544080	1544085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017168	ACT	2	6	1544093	1544098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017168	ATT	2	6	1544104	1544109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017168	A	6	6	1544120	1544125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017168	AGTG	2	8	1547286	1547293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017168	CAAT	2	8	1547319	1547326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_017168	T	6	6	1547361	1547366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017168	AACG	2	8	1547938	1547945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_017168	AGT	2	6	1549968	1549973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017168	TTA	2	6	1549988	1549993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017168	AAT	2	6	1550019	1550024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017168	TGA	2	6	1550079	1550084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017168	T	6	6	1550143	1550148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017168	ATA	2	6	1550176	1550181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017168	GCG	2	6	1550187	1550192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_017168	GGT	2	6	1550198	1550203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017168	T	7	7	1550235	1550241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017168	CAT	2	6	1550246	1550251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017168	CAC	2	6	1550457	1550462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_017168	CCTT	2	8	1550564	1550571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_017168	TGA	2	6	1550654	1550659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017168	TC	3	6	1550779	1550784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_017168	TTTC	2	8	1550795	1550802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_017168	AGCA	2	8	1550817	1550824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_017168	ACC	2	6	1550847	1550852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_017168	CAT	2	6	1552091	1552096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_017168	T	7	7	1552145	1552151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017168	GTG	2	6	1552214	1552219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017168	AG	3	6	1552226	1552231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017168	TTTGC	2	10	1552256	1552265	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5582	NC_017168	GTT	2	6	1552279	1552284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017168	GGTT	2	8	1552305	1552312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_017168	CAG	2	6	1553254	1553259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_017168	GTCTT	2	10	1553274	1553283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5586	NC_017168	TAC	2	6	1553409	1553414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_017168	CAA	2	6	1554667	1554672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_017168	GT	3	6	1554724	1554729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017168	TCTT	2	8	1554783	1554790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_017168	ATT	2	6	1554903	1554908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017168	T	6	6	1555439	1555444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017168	TCA	2	6	1555925	1555930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_017168	GAC	2	6	1556008	1556013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017168	ATA	2	6	1556137	1556142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017168	TTC	2	6	1560240	1560245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_017168	TGG	2	6	1560280	1560285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017168	CTA	2	6	1564598	1564603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_017168	AAAT	2	8	1564606	1564613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017168	TCC	2	6	1564615	1564620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_017168	GA	3	6	1565351	1565356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_017168	T	8	8	1565379	1565386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017168	T	8	8	1565408	1565415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017168	GTTTT	2	10	1565421	1565430	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017168	TGTT	2	8	1565446	1565453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017168	GTC	2	6	1565466	1565471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_017168	C	6	6	1565471	1565476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5607	NC_017168	AAAC	2	8	1565515	1565522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_017168	GCCA	2	8	1565538	1565545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_017168	GTG	2	6	1565546	1565551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017168	GTG	2	6	1571285	1571290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017168	A	6	6	1571475	1571480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017168	TGCT	2	8	1571565	1571572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_017168	CTG	2	6	1571596	1571601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_017168	GGC	2	6	1571618	1571623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_017168	A	6	6	1572155	1572160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_017168	CAA	2	6	1572222	1572227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017168	GAAA	2	8	1573047	1573054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017168	G	6	6	1573055	1573060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017168	CTTT	2	8	1573074	1573081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_017168	A	6	6	1573101	1573106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017168	GTTAT	2	10	1573188	1573197	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017168	ATA	2	6	1573204	1573209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017168	CTCTT	2	10	1573252	1573261	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5624	NC_017168	CAC	2	6	1573304	1573309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_017168	GGTA	2	8	1573313	1573320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017168	C	6	6	1573414	1573419	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5627	NC_017168	GAT	2	6	1573451	1573456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_017168	GCCA	2	8	1573482	1573489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_017168	A	6	6	1573489	1573494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017168	CGCA	2	8	1573506	1573513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_017168	GAA	2	6	1573590	1573595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_017168	ACAG	2	8	1573650	1573657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5892	NC_017168	TGTA	2	8	1664622	1664629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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