MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017160	GC	3	6	109643	109648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_017160	GGT	2	6	109666	109671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017160	TAT	2	6	109686	109691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017160	TAT	2	6	109700	109705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017160	ATTC	2	8	109750	109757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_017160	TGA	2	6	109764	109769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017160	T	6	6	109772	109777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017160	GCT	2	6	109789	109794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017160	GTA	2	6	109804	109809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017160	GAA	2	6	110415	110420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017160	CAGA	2	8	110456	110463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017160	TAT	2	6	110464	110469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017160	ATC	2	6	111029	111034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017160	TTCA	2	8	112032	112039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_017160	TAA	2	6	112107	112112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017160	A	6	6	112125	112130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017160	ATA	2	6	112167	112172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017160	GAT	2	6	112226	112231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017160	ATT	2	6	113592	113597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017160	TGTAC	2	10	113625	113634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017160	ATTA	2	8	113635	113642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017160	A	6	6	114233	114238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017160	GGA	2	6	114270	114275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017160	CGT	2	6	115145	115150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017160	ATG	2	6	115152	115157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017160	GC	3	6	116260	116265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_017160	GTT	2	6	116286	116291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017160	A	6	6	116359	116364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017160	T	6	6	116380	116385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017160	AGG	2	6	116403	116408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017160	GTG	2	6	116424	116429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017160	ATG	2	6	118777	118782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017160	A	7	7	118812	118818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017160	CGC	2	6	118893	118898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017160	TTAT	2	8	118949	118956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017160	GTG	2	6	118964	118969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017160	CTT	2	6	119059	119064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017160	GCG	2	6	119128	119133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017160	AGC	2	6	119158	119163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017160	TGG	2	6	119177	119182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017160	GAA	2	6	119225	119230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017160	T	6	6	119271	119276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017160	ACC	2	6	119289	119294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017160	GAT	3	9	119324	119332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017160	GAT	2	6	119344	119349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017160	GAT	2	6	119361	119366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017160	TCG	2	6	119370	119375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017160	GTC	2	6	119382	119387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017160	GAT	2	6	119463	119468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017160	ATAA	2	8	119474	119481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017160	TAAA	2	8	119482	119489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017160	TAA	2	6	119492	119497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017160	TAA	2	6	119500	119505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017160	GA	3	6	119535	119540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017160	TTA	3	9	119565	119573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017160	GAT	2	6	119594	119599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017160	A	6	6	119616	119621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017160	T	6	6	119651	119656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017160	CATT	2	8	120242	120249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017160	T	6	6	120265	120270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017160	AGTG	2	8	120278	120285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017160	AAT	2	6	120318	120323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017160	ATA	2	6	120337	120342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017160	ATA	2	6	120347	120352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017160	T	6	6	120356	120361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017160	AAG	2	6	120454	120459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017160	ATA	2	6	120483	120488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017160	GGT	2	6	120566	120571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017160	TAAA	2	8	120975	120982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017160	GTT	2	6	121030	121035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017160	GCT	2	6	121036	121041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017160	CTCG	2	8	121046	121053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017160	TGCTA	2	10	121082	121091	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
574	NC_017160	TTA	2	6	121155	121160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017160	AAG	2	6	121184	121189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017160	TTCTG	2	10	124892	124901	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
580	NC_017160	ATC	2	6	124968	124973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_017160	T	6	6	125991	125996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017160	G	6	6	126000	126005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017160	TGG	2	6	126023	126028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017160	TGG	2	6	126031	126036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017160	TGG	2	6	126039	126044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017160	TGG	2	6	126047	126052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017160	TGG	2	6	126055	126060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017160	GTT	2	6	126084	126089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017160	AACC	2	8	126120	126127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017160	CA	3	6	126970	126975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_017160	CTG	2	6	126997	127002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017160	ACC	2	6	127700	127705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_017160	ATT	2	6	129353	129358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_017160	TTA	2	6	129810	129815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017160	CGA	2	6	129847	129852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017160	ATC	2	6	130051	130056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_017160	ATT	2	6	134838	134843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017160	TAAT	2	8	134854	134861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017160	CTC	2	6	134964	134969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017160	GAT	2	6	134990	134995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017160	GTGA	2	8	139588	139595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017160	TGT	2	6	139609	139614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017160	AAGA	2	8	139625	139632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017160	GCA	2	6	139664	139669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017160	TA	3	6	139696	139701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017160	GTGA	2	8	139728	139735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017160	AAGA	2	8	139765	139772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017160	GGC	2	6	139803	139808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017160	AAGC	2	8	139809	139816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_017160	TAAG	2	8	139836	139843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017160	GTGA	2	8	139852	139859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017160	CGC	2	6	139870	139875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017160	ACT	2	6	140499	140504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017160	CTT	2	6	142113	142118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017160	TC	4	8	142123	142130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_017160	TTGG	2	8	142153	142160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017160	ATT	2	6	142184	142189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017160	TTA	2	6	142194	142199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017160	TAA	2	6	142223	142228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017160	TC	3	6	142317	142322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_017160	CGC	2	6	142326	142331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017160	TGC	2	6	142335	142340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017160	AAG	2	6	142358	142363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017160	AAT	2	6	142372	142377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017160	A	6	6	142435	142440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017160	ATT	2	6	142542	142547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017160	ATT	2	6	142556	142561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017160	A	6	6	142607	142612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017160	ATA	2	6	142637	142642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017160	GCTG	2	8	142874	142881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_017160	GGCT	2	8	142956	142963	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_017160	T	6	6	145335	145340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017160	T	6	6	145419	145424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_017160	AAC	2	6	145488	145493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_017160	CGT	2	6	229350	229355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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