MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CT	3	6	231	236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017157	TC	3	6	2424	2429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017157	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017157	AT	3	6	3051	3056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017157	GT	3	6	3282	3287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017157	AC	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017157	AT	3	6	6442	6447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017157	AT	3	6	6640	6645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017157	AT	3	6	10341	10346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017157	AT	3	6	10596	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017157	AT	3	6	14834	14839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017157	AT	3	6	14932	14937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017157	TA	3	6	17002	17007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017157	TA	3	6	17010	17015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017157	TA	3	6	18579	18584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017157	CA	3	6	22467	22472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017157	AT	3	6	34562	34567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017157	AT	3	6	34584	34589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017157	TG	3	6	34932	34937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017157	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017157	TA	4	8	36672	36679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017157	AG	3	6	40323	40328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017157	AT	3	6	43839	43844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017157	TA	3	6	44404	44409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017157	GA	3	6	44581	44586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017157	AT	3	6	44923	44928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017157	CT	3	6	45158	45163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017157	AT	3	6	48055	48060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017157	TA	4	8	50721	50728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017157	AT	3	6	50807	50812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017157	AT	3	6	53553	53558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017157	GT	3	6	53824	53829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017157	GC	3	6	55130	55135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017157	TC	3	6	56854	56859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017157	GT	3	6	57561	57566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017157	GT	3	6	57718	57723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017157	GA	3	6	59753	59758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017157	AT	3	6	61293	61298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017157	AT	3	6	61415	61420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017157	TA	3	6	61703	61708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017157	AC	3	6	64596	64601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017157	TG	3	6	64617	64622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017157	AC	3	6	65849	65854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017157	TC	3	6	68009	68014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017157	GT	3	6	69423	69428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.