MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017157	ACA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017157	TAA	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017157	CAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017157	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017157	AAC	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017157	CAG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017157	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017157	ATC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017157	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017157	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017157	TGC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017157	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017157	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017157	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017157	TCA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017157	CAT	2	6	3571	3576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017157	TGA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017157	CCG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017157	GTT	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017157	ATT	2	6	3747	3752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017157	AAG	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017157	TCT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017157	AAC	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017157	CGC	2	6	6466	6471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017157	GAC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017157	CTG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017157	TCG	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017157	CAG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017157	CAC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017157	CGC	2	6	6930	6935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017157	CAT	2	6	6957	6962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017157	TTA	2	6	7069	7074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017157	CCA	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017157	TGT	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017157	ATG	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017157	AGC	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017157	TCC	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017157	CAG	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017157	CAC	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017157	ATC	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017157	TGA	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017157	ATC	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017157	GTT	2	6	9385	9390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017157	GCG	2	6	9398	9403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017157	AGG	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017157	GAT	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017157	TAC	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017157	TAA	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017157	TCC	2	6	10295	10300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017157	ATT	2	6	10309	10314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017157	ATT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017157	TAT	2	6	10381	10386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017157	TAA	2	6	10453	10458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017157	ACA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017157	AAT	2	6	10622	10627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017157	CAA	2	6	11306	11311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017157	TTG	2	6	13713	13718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017157	AAG	2	6	13747	13752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017157	TGC	2	6	13767	13772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017157	AGC	2	6	13775	13780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017157	AAT	2	6	13798	13803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017157	CGA	2	6	13909	13914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017157	GTT	2	6	14014	14019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017157	ATT	2	6	14028	14033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017157	TAA	2	6	14633	14638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017157	TAA	2	6	14700	14705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017157	ACA	2	6	14875	14880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017157	ATG	2	6	14905	14910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017157	TGC	2	6	14943	14948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017157	AAT	2	6	14950	14955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017157	AAT	2	6	14988	14993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017157	AAC	2	6	15002	15007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017157	GTC	2	6	15106	15111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017157	CAA	2	6	15347	15352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017157	AGA	2	6	17106	17111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017157	AGT	2	6	17193	17198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017157	TTC	2	6	17226	17231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017157	ATT	2	6	17304	17309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017157	TAT	2	6	17335	17340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017157	CTG	2	6	17373	17378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017157	TTG	2	6	17490	17495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017157	CTT	2	6	17536	17541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017157	GTT	2	6	18237	18242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017157	ATT	2	6	18251	18256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017157	ATT	2	6	18290	18295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017157	CAA	2	6	18423	18428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017157	CTA	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017157	TTA	2	6	18504	18509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017157	TAA	2	6	18519	18524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017157	TCA	2	6	18649	18654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017157	TCC	2	6	19586	19591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017157	GTG	2	6	20638	20643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017157	TTG	2	6	20705	20710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017157	AAT	2	6	22285	22290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017157	CAT	2	6	22300	22305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017157	TCA	2	6	22373	22378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017157	CGG	2	6	22410	22415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017157	AAT	2	6	22481	22486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017157	TCA	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017157	CCT	2	6	22576	22581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017157	TTC	2	6	26231	26236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017157	CTC	2	6	26300	26305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017157	ACT	2	6	27355	27360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017157	TGC	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017157	TCA	2	6	27574	27579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017157	GCC	2	6	32335	32340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017157	GGT	2	6	32356	32361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017157	TGG	2	6	32442	32447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017157	ATG	2	6	32510	32515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017157	TTG	2	6	34428	34433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017157	CAA	2	6	34536	34541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017157	ATA	2	6	34686	34691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017157	GTG	2	6	34828	34833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017157	GTT	2	6	34859	34864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017157	AAT	2	6	34872	34877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017157	CAC	2	6	34884	34889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017157	ATC	2	6	34913	34918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017157	TCT	2	6	34925	34930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017157	TAT	2	6	35360	35365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017157	TAA	2	6	35409	35414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017157	CGC	2	6	36410	36415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017157	AAT	2	6	36424	36429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017157	TGT	2	6	36431	36436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017157	TAA	2	6	36438	36443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017157	TTA	2	6	36463	36468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017157	ATC	2	6	36535	36540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017157	GGT	2	6	36553	36558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017157	ATG	2	6	40283	40288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017157	GGT	2	6	40292	40297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017157	ATT	2	6	40358	40363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017157	AAG	2	6	40460	40465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017157	CAG	2	6	40467	40472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017157	AGC	2	6	40504	40509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017157	ACA	2	6	40552	40557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017157	TAA	2	6	40564	40569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017157	TAT	2	6	43858	43863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017157	AGT	2	6	43987	43992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017157	ATA	2	6	44400	44405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017157	AAT	2	6	44428	44433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017157	AAT	3	9	44506	44514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017157	CCT	2	6	44518	44523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.