MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) chromosome

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015224	CGTCGC	2	12	12804	12815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015224	TAATAT	2	12	45602	45613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015224	TTTTCT	2	12	73066	73077	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015224	GCAGGA	2	12	137642	137653	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015224	TTTATT	2	12	149433	149444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015224	TAAATT	2	12	197540	197551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015224	GTCTTG	2	12	271667	271678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015224	TTTATA	2	12	291835	291846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015224	CAGTGA	2	12	301299	301310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015224	TGTATT	2	12	304912	304923	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015224	GCATAT	2	12	342123	342134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015224	CATTTG	2	12	413944	413955	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015224	CATTGG	2	12	436776	436787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015224	TTTTTA	2	12	472768	472779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015224	AAATAA	2	12	549169	549180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015224	ATCTTT	2	12	552819	552830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015224	GATCCA	2	12	568325	568336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015224	TTAAAA	2	12	632510	632521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015224	GGGATA	2	12	674575	674586	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015224	TTATCA	2	12	676215	676226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015224	GATATT	2	12	676575	676586	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015224	GCTGAA	2	12	692631	692642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015224	CTGGCA	2	12	727406	727417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015224	AAAAAT	2	12	733902	733913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015224	TTAACC	2	12	737096	737107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015224	ATCATA	2	12	744261	744272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015224	AATAAA	2	12	764540	764551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015224	AAGGGA	2	12	775736	775747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015224	TATAAT	2	12	797212	797223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015224	TCACAT	2	12	810460	810471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015224	TCTTAT	2	12	864237	864248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015224	GGGTTT	2	12	910094	910105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015224	ATTTTT	2	12	923821	923832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015224	TTCTTG	2	12	958320	958331	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015224	GGTAAT	2	12	958441	958452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015224	TTCACT	2	12	998593	998604	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015224	CCATTT	2	12	1008287	1008298	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015224	TTCACT	2	12	1045647	1045658	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015224	GGGATA	2	12	1060119	1060130	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015224	AATGGC	2	12	1062022	1062033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015224	AATCAA	2	12	1071267	1071278	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015224	TGTTAT	2	12	1078069	1078080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015224	TGCTAC	2	12	1078296	1078307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015224	GAAGTT	2	12	1118276	1118287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015224	CCCGTG	2	12	1119823	1119834	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015224	TTATGA	2	12	1149924	1149935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015224	TTGCAT	2	12	1205509	1205520	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015224	ATCAGA	2	12	1228044	1228055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015224	TATTGA	2	12	1281923	1281934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015224	AATGAT	2	12	1282854	1282865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015224	TATTGA	2	12	1314647	1314658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015224	TAAGTT	2	12	1320859	1320870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015224	GCAGGG	2	12	1322782	1322793	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015224	TGTGTT	2	12	1352218	1352229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015224	TGATTT	2	12	1385621	1385632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015224	TACTTG	2	12	1406097	1406108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015224	CAAAAA	2	12	1432811	1432822	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015224	TAAATA	2	12	1444773	1444784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015224	AGCCAT	2	12	1456833	1456844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015224	AGCGGC	2	12	1471890	1471901	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015224	TTGAGT	2	12	1487449	1487460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015224	TACTGA	2	12	1499315	1499326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015224	ATTTGC	2	12	1505494	1505505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015224	GGTGAT	2	12	1523622	1523633	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015224	TGGTGA	2	12	1523795	1523806	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015224	GGTAAT	2	12	1524381	1524392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015224	AGCTAA	2	12	1524590	1524601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015224	GCGAAT	2	12	1524888	1524899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015224	TCACTG	2	12	1554142	1554153	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015224	TTACTT	2	12	1571370	1571381	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015224	TACTCA	2	12	1571467	1571478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015224	AAAAAG	2	12	1598256	1598267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015224	GACTAT	2	12	1650502	1650513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015224	AAATTT	2	12	1666902	1666913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015224	AATTTT	2	12	1667093	1667104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015224	TTGGAT	2	12	1685490	1685501	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015224	AAATTA	2	12	1832445	1832456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015224	TGAACC	2	12	1884417	1884428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015224	TAAATG	2	12	1941041	1941052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015224	TCGTTT	2	12	1947654	1947665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015224	GATCGC	2	12	1969004	1969015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015224	ACGTAA	2	12	1969197	1969208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015224	TTTATG	2	12	1969495	1969506	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015224	ATCAGA	2	12	1976566	1976577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015224	GTACCT	2	12	2000159	2000170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015224	TAAATC	2	12	2025147	2025158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015224	TTATAT	2	12	2104513	2104524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015224	ATAAAA	2	12	2109878	2109889	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015224	ATCGCG	2	12	2172673	2172684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015224	AATTTG	2	12	2184556	2184567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015224	ATTGTC	2	12	2187022	2187033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015224	TGTCAG	2	12	2216727	2216738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015224	ATTCTA	2	12	2263802	2263813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015224	GGTTAT	2	12	2265601	2265612	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015224	ACGGAA	2	12	2291768	2291779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015224	GTGATT	2	12	2364273	2364284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015224	ATGATA	2	12	2380544	2380555	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015224	TATTTT	2	12	2392873	2392884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015224	GTTTAT	2	12	2392915	2392926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015224	ATTTTT	2	12	2396249	2396260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015224	TGAAAG	2	12	2428799	2428810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015224	TTATTT	2	12	2431470	2431481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015224	TTATAA	2	12	2435295	2435306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015224	AATGCG	2	12	2441624	2441635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015224	ACAGCC	2	12	2459823	2459834	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015224	CATTGC	2	12	2475093	2475104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015224	TTAAAG	2	12	2494869	2494880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015224	TTGTGT	2	12	2551345	2551356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015224	TTAATA	2	12	2563905	2563916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015224	TTACCT	2	12	2582617	2582628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015224	ATCACT	2	12	2605981	2605992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015224	CAAAAA	2	12	2606089	2606100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015224	AAAAAT	2	12	2616198	2616209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015224	ATTTTC	2	12	2637901	2637912	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015224	GCAGAA	2	12	2667953	2667964	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015224	ATCGCG	2	12	2674712	2674723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015224	ATTAAC	2	12	2697034	2697045	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015224	GTTAAC	2	12	2798437	2798448	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015224	GTTAAC	2	12	2798501	2798512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015224	GAAGCC	2	12	2801633	2801644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015224	ATCGCG	2	12	2806335	2806346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015224	ATAAAT	2	12	2849255	2849266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015224	AAGCTC	2	12	2914344	2914355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015224	CCCTTT	2	12	2923527	2923538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015224	CAAATA	2	12	2967008	2967019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015224	TCGCGA	2	12	2990062	2990073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015224	CAGGAA	2	12	3037135	3037146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015224	CCAGCA	2	12	3059902	3059913	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015224	AATAAA	2	12	3070651	3070662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015224	CCTACC	2	12	3071098	3071109	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015224	TAACAT	2	12	3097743	3097754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015224	ACTCAC	2	12	3106764	3106775	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015224	GGAAAG	2	12	3116788	3116799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015224	ATCGCG	2	12	3121132	3121143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015224	CCAAAA	2	12	3139256	3139267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015224	GATTAA	2	12	3140550	3140561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015224	TTTTAT	2	12	3186068	3186079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015224	TGCCAA	2	12	3187768	3187779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015224	GGTGAT	2	12	3191045	3191056	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015224	TCAACG	2	12	3212830	3212841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015224	AGAAAA	2	12	3245262	3245273	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015224	TCCTAT	2	12	3278072	3278083	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015224	ATAACG	2	12	3284681	3284692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_015224	ATTTAT	2	12	3385245	3385256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015224	GATATC	2	12	3396771	3396782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015224	CGCGAT	2	12	3416711	3416722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015224	ATGGAT	2	12	3421079	3421090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015224	TATTGA	2	12	3458068	3458079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015224	GTTACT	2	12	3472752	3472763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_015224	AATGAA	2	12	3519316	3519327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015224	TTTTTG	2	12	3519925	3519936	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015224	ATTTCT	2	12	3574760	3574771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_015224	AAATGG	2	12	3587410	3587421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015224	TTTTAA	2	12	3601213	3601224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.